RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392083.5

RESP18-202, Transcript of regulated endocrine specific protein 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RESP18, Length 626 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RESP18-202ENST00000392083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.79■■□□□ 1.4
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RESP18-202ENST00000392083 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.19■□□□□ 0.82
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