RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

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Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa9.65□□□□□ -0.86
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SNORD66.1-201ENST00000391230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.09□□□□□ -1.11
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SNORD66.1-201ENST00000391230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.96□□□□□ -1.13
SNORD66.1-201ENST00000391230 ABCC9O60706 1549 aa7.96□□□□□ -1.14
SNORD66.1-201ENST00000391230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.93□□□□□ -1.14
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.83□□□□□ -1.16
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SNORD66.1-201ENST00000391230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.7□□□□□ -1.18
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCRIBQ14160 1630 aa7.69□□□□□ -1.18
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SNORD66.1-201ENST00000391230 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.55□□□□□ -1.2
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SNORD66.1-201ENST00000391230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.49□□□□□ -1.21
SNORD66.1-201ENST00000391230 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.47□□□□□ -1.21
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SNORD66.1-201ENST00000391230 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.4□□□□□ -1.22
SNORD66.1-201ENST00000391230 WIZO95785 1651 aa7.38□□□□□ -1.23
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMARCA4P51532 1647 aa7.37□□□□□ -1.23
SNORD66.1-201ENST00000391230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.3□□□□□ -1.24
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SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.28□□□□□ -1.24
SNORD66.1-201ENST00000391230 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.26□□□□□ -1.25
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SNORD66.1-201ENST00000391230 NCAPD3P42695 1498 aa7.24□□□□□ -1.25
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMARCA2P51531 1590 aa7.24□□□□□ -1.25
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIM41Q8WV44 630 aa7.23□□□□□ -1.25
SNORD66.1-201ENST00000391230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNORD66.1-201ENST00000391230 HMGXB3Q12766 1538 aa7.16□□□□□ -1.26
SNORD66.1-201ENST00000391230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.15□□□□□ -1.26
SNORD66.1-201ENST00000391230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.15□□□□□ -1.27
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SNORD66.1-201ENST00000391230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.12□□□□□ -1.27
SNORD66.1-201ENST00000391230 ABCC8Q09428 1581 aa7.09□□□□□ -1.27
SNORD66.1-201ENST00000391230 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.08□□□□□ -1.28
SNORD66.1-201ENST00000391230 CFTRP13569 1480 aa7.07□□□□□ -1.28
SNORD66.1-201ENST00000391230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
SNORD66.1-201ENST00000391230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.03□□□□□ -1.28
SNORD66.1-201ENST00000391230 SOGA1O94964 1423 aa7.02□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.01□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.01□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYNJ1O43426 1573 aa6.99□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 NESP48681 1621 aa6.99□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 CUX1P39880 1505 aa6.97□□□□□ -1.29
SNORD66.1-201ENST00000391230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.96□□□□□ -1.3
SNORD66.1-201ENST00000391230 EEA1Q15075 1411 aa6.95□□□□□ -1.3
SNORD66.1-201ENST00000391230 TOP2BQ02880 1626 aa6.95□□□□□ -1.3
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.93□□□□□ -1.3
SNORD66.1-201ENST00000391230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.92□□□□□ -1.3
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SNORD66.1-201ENST00000391230 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.9□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 IGF1RP08069 1367 aa6.89□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.89□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 TOPBP1Q92547 1522 aa6.89□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRDM2Q13029 1718 aa6.88□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.88□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF27Q86VH2 1401 aa6.88□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 CUX2O14529 1486 aa6.87□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.87□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.86□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 GOLGA3Q08378 1498 aa6.85□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRXQ9BXM0 1461 aa6.85□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.85□□□□□ -1.31
SNORD66.1-201ENST00000391230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.83□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP162Q5TB80 1403 aa6.83□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.82□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF21BO75037 1637 aa6.82□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.81□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERCC6Q03468 1493 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLIP1P30622 1438 aa6.78□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.78□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SNORD66.1-201ENST00000391230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.77□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR62O43379 1518 aa6.75□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 IFT140Q96RY7 1462 aa6.74□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 P3H3Q8IVL6 736 aa6.72□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR97A6NE52 1622 aa6.72□□□□□ -1.33
SNORD66.1-201ENST00000391230 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.71□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.71□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.71□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 APLP2Q06481 763 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 GRIN2BQ13224 1484 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARAP1Q96P48 1450 aa6.7□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SNORD66.1-201ENST00000391230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.69□□□□□ -1.34
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