RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380151.3

CDKN2A-203, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CDKN2A, Length 794 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-203ENST00000380151 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.95■■■■■ 7.03
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CDKN2A-203ENST00000380151 ABCC9O60706 1549 aa52.22■■■■■ 5.95
CDKN2A-203ENST00000380151 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.89■■■■■ 5.58
CDKN2A-203ENST00000380151 NACADO15069 1562 aa49.66■■■■■ 5.54
CDKN2A-203ENST00000380151 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.52■■■■■ 5.52
CDKN2A-203ENST00000380151 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.13■■■■■ 5.45
CDKN2A-203ENST00000380151 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49■■■■■ 5.44
CDKN2A-203ENST00000380151 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.77■■■■■ 5.4
CDKN2A-203ENST00000380151 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.7■■■■■ 5.39
CDKN2A-203ENST00000380151 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.67■■■■■ 5.38
CDKN2A-203ENST00000380151 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.47■■■■■ 5.35
CDKN2A-203ENST00000380151 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.43■■■■■ 5.34
CDKN2A-203ENST00000380151 SCRIBQ14160 1630 aa48.1■■■■■ 5.29
CDKN2A-203ENST00000380151 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.81■■■■■ 5.24
CDKN2A-203ENST00000380151 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
CDKN2A-203ENST00000380151 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.17■■■■■ 5.14
CDKN2A-203ENST00000380151 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.96■■■■■ 5.11
CDKN2A-203ENST00000380151 SMARCA4P51532 1647 aa45.9■■■■■ 4.94
CDKN2A-203ENST00000380151 NCAPD3P42695 1498 aa45.83■■■■■ 4.93
CDKN2A-203ENST00000380151 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.8■■■■■ 4.92
CDKN2A-203ENST00000380151 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.74■■■■■ 4.91
CDKN2A-203ENST00000380151 SMARCA2P51531 1590 aa45.69■■■■■ 4.9
CDKN2A-203ENST00000380151 HMGXB3Q12766 1538 aa45.58■■■■■ 4.89
CDKN2A-203ENST00000380151 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.45■■■■■ 4.87
CDKN2A-203ENST00000380151 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.41■■■■■ 4.86
CDKN2A-203ENST00000380151 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
CDKN2A-203ENST00000380151 ERCC6Q03468 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
CDKN2A-203ENST00000380151 NESP48681 1621 aa45.01■■■■■ 4.8
CDKN2A-203ENST00000380151 WIZO95785 1651 aa44.93■■■■■ 4.78
CDKN2A-203ENST00000380151 CUX2O14529 1486 aa44.75■■■■■ 4.75
CDKN2A-203ENST00000380151 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.73■■■■■ 4.75
CDKN2A-203ENST00000380151 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.75
CDKN2A-203ENST00000380151 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.47■■■■■ 4.71
CDKN2A-203ENST00000380151 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
CDKN2A-203ENST00000380151 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.45■■■■■ 4.71
CDKN2A-203ENST00000380151 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.43■■■■■ 4.7
CDKN2A-203ENST00000380151 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
CDKN2A-203ENST00000380151 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.09■■■■■ 4.65
CDKN2A-203ENST00000380151 CFTRP13569 1480 aa44.08■■■■■ 4.65
CDKN2A-203ENST00000380151 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.08■■■■■ 4.65
CDKN2A-203ENST00000380151 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.01■■■■■ 4.64
CDKN2A-203ENST00000380151 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44■■■■■ 4.63
CDKN2A-203ENST00000380151 WDR62O43379 1518 aa43.94■■■■■ 4.63
CDKN2A-203ENST00000380151 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.88■■■■■ 4.61
CDKN2A-203ENST00000380151 PRDM2Q13029 1718 aa43.69■■■■■ 4.58
CDKN2A-203ENST00000380151 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
CDKN2A-203ENST00000380151 TOPBP1Q92547 1522 aa43.23■■■■■ 4.51
CDKN2A-203ENST00000380151 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.12■■■■■ 4.49
CDKN2A-203ENST00000380151 ABCC8Q09428 1581 aa43.11■■■■■ 4.49
CDKN2A-203ENST00000380151 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
CDKN2A-203ENST00000380151 IFT140Q96RY7 1462 aa43.09■■■■■ 4.49
CDKN2A-203ENST00000380151 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
CDKN2A-203ENST00000380151 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
CDKN2A-203ENST00000380151 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
CDKN2A-203ENST00000380151 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
CDKN2A-203ENST00000380151 OSCARQ8IYS5 282 aa42.75■■■■■ 4.43
CDKN2A-203ENST00000380151 CUX1P39880 1505 aa42.69■■■■■ 4.42
CDKN2A-203ENST00000380151 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.67■■■■■ 4.42
CDKN2A-203ENST00000380151 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.66■■■■■ 4.42
CDKN2A-203ENST00000380151 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.64■■■■■ 4.42
CDKN2A-203ENST00000380151 SOGA1O94964 1423 aa42.6■■■■■ 4.41
CDKN2A-203ENST00000380151 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
CDKN2A-203ENST00000380151 TRIM41Q8WV44 630 aa42.44■■■■■ 4.38
CDKN2A-203ENST00000380151 WDR97A6NE52 1622 aa42.38■■■■■ 4.37
CDKN2A-203ENST00000380151 CHD1O14646 1710 aa42.37■■■■■ 4.37
CDKN2A-203ENST00000380151 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.28■■■■■ 4.36
CDKN2A-203ENST00000380151 FBLN2P98095 1184 aa42.26■■■■■ 4.36
CDKN2A-203ENST00000380151 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
CDKN2A-203ENST00000380151 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
CDKN2A-203ENST00000380151 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.21■■■■■ 4.35
CDKN2A-203ENST00000380151 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
CDKN2A-203ENST00000380151 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.17■■■■■ 4.34
CDKN2A-203ENST00000380151 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
CDKN2A-203ENST00000380151 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
CDKN2A-203ENST00000380151 ARHGEF11O15085 1522 aa42.14■■■■■ 4.34
CDKN2A-203ENST00000380151 SYNJ1O43426 1573 aa42.12■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 TOP2BQ02880 1626 aa42.12■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.12■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.11■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 PBRM1Q86U86 1689 aa42.09■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.08■■■■■ 4.33
CDKN2A-203ENST00000380151 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
CDKN2A-203ENST00000380151 SYNJ2O15056 1496 aa41.99■■■■■ 4.31
CDKN2A-203ENST00000380151 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.9■■■■■ 4.3
CDKN2A-203ENST00000380151 ARAP1Q96P48 1450 aa41.78■■■■■ 4.28
CDKN2A-203ENST00000380151 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.75■■■■■ 4.27
CDKN2A-203ENST00000380151 ADAMTS12P58397 1594 aa41.75■■■■■ 4.27
CDKN2A-203ENST00000380151 GRIN2AQ12879 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
CDKN2A-203ENST00000380151 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.64■■■■■ 4.26
CDKN2A-203ENST00000380151 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.6■■■■■ 4.25
CDKN2A-203ENST00000380151 CEP170Q5SW79 1584 aa41.51■■■■■ 4.24
CDKN2A-203ENST00000380151 NUP160Q12769 1436 aa41.5■■■■■ 4.23
CDKN2A-203ENST00000380151 KIF27Q86VH2 1401 aa41.31■■■■■ 4.2
CDKN2A-203ENST00000380151 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.3■■■■■ 4.2
CDKN2A-203ENST00000380151 SHROOM2Q13796 1616 aa41.26■■■■■ 4.19
CDKN2A-203ENST00000380151 IGF1RP08069 1367 aa41.21■■■■■ 4.19
CDKN2A-203ENST00000380151 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.14■■■■■ 4.18
CDKN2A-203ENST00000380151 CUL7Q14999 1698 aa41.14■■■■■ 4.18
CDKN2A-203ENST00000380151 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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