RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378389.5

PRDM16-202, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

TSL 5

Gene PRDM16, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-202ENST00000378389 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.48■■■■■ 5.35
PRDM16-202ENST00000378389 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.58■■■■■ 4.57
PRDM16-202ENST00000378389 ABCC9O60706 1549 aa43.35■■■■■ 4.53
PRDM16-202ENST00000378389 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.4■■■■■ 4.22
PRDM16-202ENST00000378389 NACADO15069 1562 aa41.17■■■■■ 4.18
PRDM16-202ENST00000378389 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.74■■■■■ 4.11
PRDM16-202ENST00000378389 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.68■■■■■ 4.1
PRDM16-202ENST00000378389 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.54■■■■■ 4.08
PRDM16-202ENST00000378389 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.45■■■■■ 4.07
PRDM16-202ENST00000378389 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.28■■■■■ 4.04
PRDM16-202ENST00000378389 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.23■■■■■ 4.03
PRDM16-202ENST00000378389 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
PRDM16-202ENST00000378389 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.19■■■■■ 4.02
PRDM16-202ENST00000378389 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.84■■■■□ 3.97
PRDM16-202ENST00000378389 SCRIBQ14160 1630 aa39.51■■■■□ 3.92
PRDM16-202ENST00000378389 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.25■■■■□ 3.87
PRDM16-202ENST00000378389 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
PRDM16-202ENST00000378389 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
PRDM16-202ENST00000378389 NCAPD3P42695 1498 aa38.02■■■■□ 3.68
PRDM16-202ENST00000378389 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.85■■■■□ 3.65
PRDM16-202ENST00000378389 SMARCA4P51532 1647 aa37.8■■■■□ 3.64
PRDM16-202ENST00000378389 SMARCA2P51531 1590 aa37.76■■■■□ 3.64
PRDM16-202ENST00000378389 HMGXB3Q12766 1538 aa37.75■■■■□ 3.63
PRDM16-202ENST00000378389 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.62
PRDM16-202ENST00000378389 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.56■■■■□ 3.6
PRDM16-202ENST00000378389 CUX2O14529 1486 aa37.52■■■■□ 3.6
PRDM16-202ENST00000378389 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
PRDM16-202ENST00000378389 ERCC6Q03468 1493 aa37.42■■■■□ 3.58
PRDM16-202ENST00000378389 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.41■■■■□ 3.58
PRDM16-202ENST00000378389 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.3■■■■□ 3.56
PRDM16-202ENST00000378389 NESP48681 1621 aa37.26■■■■□ 3.56
PRDM16-202ENST00000378389 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.13■■■■□ 3.53
PRDM16-202ENST00000378389 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
PRDM16-202ENST00000378389 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.87■■■■□ 3.49
PRDM16-202ENST00000378389 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.82■■■■□ 3.48
PRDM16-202ENST00000378389 WIZO95785 1651 aa36.81■■■■□ 3.48
PRDM16-202ENST00000378389 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.79■■■■□ 3.48
PRDM16-202ENST00000378389 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.56■■■■□ 3.44
PRDM16-202ENST00000378389 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
PRDM16-202ENST00000378389 WDR62O43379 1518 aa36.52■■■■□ 3.44
PRDM16-202ENST00000378389 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
PRDM16-202ENST00000378389 CFTRP13569 1480 aa36.43■■■■□ 3.42
PRDM16-202ENST00000378389 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.38■■■■□ 3.41
PRDM16-202ENST00000378389 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.35■■■■□ 3.41
PRDM16-202ENST00000378389 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PRDM16-202ENST00000378389 PRDM2Q13029 1718 aa36.06■■■■□ 3.36
PRDM16-202ENST00000378389 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.98■■■■□ 3.35
PRDM16-202ENST00000378389 IFT140Q96RY7 1462 aa35.7■■■■□ 3.31
PRDM16-202ENST00000378389 TOPBP1Q92547 1522 aa35.68■■■■□ 3.3
PRDM16-202ENST00000378389 OSCARQ8IYS5 282 aa35.67■■■■□ 3.3
PRDM16-202ENST00000378389 ABCC8Q09428 1581 aa35.66■■■■□ 3.3
PRDM16-202ENST00000378389 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
PRDM16-202ENST00000378389 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.58■■■■□ 3.29
PRDM16-202ENST00000378389 TRIM41Q8WV44 630 aa35.54■■■■□ 3.28
PRDM16-202ENST00000378389 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
PRDM16-202ENST00000378389 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
PRDM16-202ENST00000378389 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
PRDM16-202ENST00000378389 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.26■■■■□ 3.24
PRDM16-202ENST00000378389 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.26■■■■□ 3.24
PRDM16-202ENST00000378389 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.26■■■■□ 3.24
PRDM16-202ENST00000378389 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
PRDM16-202ENST00000378389 ARHGEF11O15085 1522 aa35.16■■■■□ 3.22
PRDM16-202ENST00000378389 WDR97A6NE52 1622 aa35.14■■■■□ 3.22
PRDM16-202ENST00000378389 CHD1O14646 1710 aa35.12■■■■□ 3.21
PRDM16-202ENST00000378389 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.11■■■■□ 3.21
PRDM16-202ENST00000378389 SOGA1O94964 1423 aa35.1■■■■□ 3.21
PRDM16-202ENST00000378389 CUX1P39880 1505 aa35.06■■■■□ 3.2
PRDM16-202ENST00000378389 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.06■■■■□ 3.2
PRDM16-202ENST00000378389 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
PRDM16-202ENST00000378389 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.9■■■■□ 3.18
PRDM16-202ENST00000378389 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
PRDM16-202ENST00000378389 GRIN2BQ13224 1484 aa34.85■■■■□ 3.17
PRDM16-202ENST00000378389 ARAP1Q96P48 1450 aa34.84■■■■□ 3.17
PRDM16-202ENST00000378389 FBLN2P98095 1184 aa34.83■■■■□ 3.17
PRDM16-202ENST00000378389 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.82■■■■□ 3.16
PRDM16-202ENST00000378389 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.75■■■■□ 3.15
PRDM16-202ENST00000378389 SYNJ2O15056 1496 aa34.75■■■■□ 3.15
PRDM16-202ENST00000378389 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.75■■■■□ 3.15
PRDM16-202ENST00000378389 SYNJ1O43426 1573 aa34.74■■■■□ 3.15
PRDM16-202ENST00000378389 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.71■■■■□ 3.15
PRDM16-202ENST00000378389 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.7■■■■□ 3.14
PRDM16-202ENST00000378389 PBRM1Q86U86 1689 aa34.69■■■■□ 3.14
PRDM16-202ENST00000378389 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
PRDM16-202ENST00000378389 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
PRDM16-202ENST00000378389 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.55■■■■□ 3.12
PRDM16-202ENST00000378389 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
PRDM16-202ENST00000378389 TOP2BQ02880 1626 aa34.54■■■■□ 3.12
PRDM16-202ENST00000378389 ADAMTS12P58397 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
PRDM16-202ENST00000378389 GRIN2AQ12879 1464 aa34.4■■■■□ 3.1
PRDM16-202ENST00000378389 NUP160Q12769 1436 aa34.35■■■■□ 3.09
PRDM16-202ENST00000378389 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.32■■■■□ 3.08
PRDM16-202ENST00000378389 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.3■■■■□ 3.08
PRDM16-202ENST00000378389 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PRDM16-202ENST00000378389 CEP170Q5SW79 1584 aa34.28■■■■□ 3.08
PRDM16-202ENST00000378389 SHROOM2Q13796 1616 aa34.21■■■■□ 3.07
PRDM16-202ENST00000378389 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.17■■■■□ 3.06
PRDM16-202ENST00000378389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.93■■■■□ 3.02
PRDM16-202ENST00000378389 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PRDM16-202ENST00000378389 JPH4Q96JJ6 628 aa33.87■■■■□ 3.01
PRDM16-202ENST00000378389 IGF1RP08069 1367 aa33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms