RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.87■■■■■ 4.61
SYP-202ENST00000376303 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.33■■■■□ 3.89
SYP-202ENST00000376303 ABCC9O60706 1549 aa39.07■■■■□ 3.84
SYP-202ENST00000376303 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.34■■■■□ 3.57
SYP-202ENST00000376303 NACADO15069 1562 aa37.13■■■■□ 3.53
SYP-202ENST00000376303 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.92■■■■□ 3.5
SYP-202ENST00000376303 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.69■■■■□ 3.46
SYP-202ENST00000376303 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.51■■■■□ 3.44
SYP-202ENST00000376303 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.46■■■■□ 3.43
SYP-202ENST00000376303 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
SYP-202ENST00000376303 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
SYP-202ENST00000376303 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.29■■■■□ 3.4
SYP-202ENST00000376303 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.2■■■■□ 3.39
SYP-202ENST00000376303 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.8■■■■□ 3.32
SYP-202ENST00000376303 SCRIBQ14160 1630 aa35.79■■■■□ 3.32
SYP-202ENST00000376303 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.34■■■■□ 3.25
SYP-202ENST00000376303 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SYP-202ENST00000376303 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.2■■■■□ 3.23
SYP-202ENST00000376303 NCAPD3P42695 1498 aa34.26■■■■□ 3.07
SYP-202ENST00000376303 SMARCA4P51532 1647 aa34.19■■■■□ 3.06
SYP-202ENST00000376303 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.16■■■■□ 3.06
SYP-202ENST00000376303 SMARCA2P51531 1590 aa34.11■■■■□ 3.05
SYP-202ENST00000376303 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
SYP-202ENST00000376303 HMGXB3Q12766 1538 aa34.03■■■■□ 3.04
SYP-202ENST00000376303 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.88■■■■□ 3.01
SYP-202ENST00000376303 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
SYP-202ENST00000376303 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.78■■■■□ 3
SYP-202ENST00000376303 ERCC6Q03468 1493 aa33.75■■■□□ 2.99
SYP-202ENST00000376303 CUX2O14529 1486 aa33.65■■■□□ 2.98
SYP-202ENST00000376303 NESP48681 1621 aa33.61■■■□□ 2.97
SYP-202ENST00000376303 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.47■■■□□ 2.95
SYP-202ENST00000376303 WIZO95785 1651 aa33.41■■■□□ 2.94
SYP-202ENST00000376303 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.4■■■□□ 2.94
SYP-202ENST00000376303 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
SYP-202ENST00000376303 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.27■■■□□ 2.92
SYP-202ENST00000376303 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.24■■■□□ 2.91
SYP-202ENST00000376303 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.21■■■□□ 2.91
SYP-202ENST00000376303 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
SYP-202ENST00000376303 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
SYP-202ENST00000376303 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.94■■■□□ 2.86
SYP-202ENST00000376303 CFTRP13569 1480 aa32.88■■■□□ 2.85
SYP-202ENST00000376303 WDR62O43379 1518 aa32.87■■■□□ 2.85
SYP-202ENST00000376303 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.86■■■□□ 2.85
SYP-202ENST00000376303 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.83■■■□□ 2.85
SYP-202ENST00000376303 PRDM2Q13029 1718 aa32.64■■■□□ 2.82
SYP-202ENST00000376303 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.61■■■□□ 2.81
SYP-202ENST00000376303 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
SYP-202ENST00000376303 TOPBP1Q92547 1522 aa32.23■■■□□ 2.75
SYP-202ENST00000376303 ABCC8Q09428 1581 aa32.23■■■□□ 2.75
SYP-202ENST00000376303 IFT140Q96RY7 1462 aa32.2■■■□□ 2.75
SYP-202ENST00000376303 OSCARQ8IYS5 282 aa32.15■■■□□ 2.74
SYP-202ENST00000376303 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.15■■■□□ 2.74
SYP-202ENST00000376303 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
SYP-202ENST00000376303 TRIM41Q8WV44 630 aa31.98■■■□□ 2.71
SYP-202ENST00000376303 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
SYP-202ENST00000376303 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
SYP-202ENST00000376303 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
SYP-202ENST00000376303 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
SYP-202ENST00000376303 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
SYP-202ENST00000376303 SOGA1O94964 1423 aa31.77■■■□□ 2.68
SYP-202ENST00000376303 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.77■■■□□ 2.68
SYP-202ENST00000376303 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.73■■■□□ 2.67
SYP-202ENST00000376303 CUX1P39880 1505 aa31.73■■■□□ 2.67
SYP-202ENST00000376303 CHD1O14646 1710 aa31.71■■■□□ 2.67
SYP-202ENST00000376303 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
SYP-202ENST00000376303 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
SYP-202ENST00000376303 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.69■■■□□ 2.66
SYP-202ENST00000376303 WDR97A6NE52 1622 aa31.68■■■□□ 2.66
SYP-202ENST00000376303 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
SYP-202ENST00000376303 ARHGEF11O15085 1522 aa31.6■■■□□ 2.65
SYP-202ENST00000376303 FBLN2P98095 1184 aa31.6■■■□□ 2.65
SYP-202ENST00000376303 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.52■■■□□ 2.64
SYP-202ENST00000376303 GRIN2BQ13224 1484 aa31.48■■■□□ 2.63
SYP-202ENST00000376303 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
SYP-202ENST00000376303 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
SYP-202ENST00000376303 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.4■■■□□ 2.62
SYP-202ENST00000376303 PBRM1Q86U86 1689 aa31.4■■■□□ 2.62
SYP-202ENST00000376303 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.4■■■□□ 2.62
SYP-202ENST00000376303 SYNJ2O15056 1496 aa31.37■■■□□ 2.61
SYP-202ENST00000376303 SYNJ1O43426 1573 aa31.35■■■□□ 2.61
SYP-202ENST00000376303 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.35■■■□□ 2.61
SYP-202ENST00000376303 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.34■■■□□ 2.61
SYP-202ENST00000376303 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.32■■■□□ 2.6
SYP-202ENST00000376303 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
SYP-202ENST00000376303 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.31■■■□□ 2.6
SYP-202ENST00000376303 TOP2BQ02880 1626 aa31.31■■■□□ 2.6
SYP-202ENST00000376303 ARAP1Q96P48 1450 aa31.29■■■□□ 2.6
SYP-202ENST00000376303 ADAMTS12P58397 1594 aa31.08■■■□□ 2.57
SYP-202ENST00000376303 GRIN2AQ12879 1464 aa31.08■■■□□ 2.57
SYP-202ENST00000376303 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.03■■■□□ 2.56
SYP-202ENST00000376303 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.01■■■□□ 2.55
SYP-202ENST00000376303 NUP160Q12769 1436 aa30.97■■■□□ 2.55
SYP-202ENST00000376303 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
SYP-202ENST00000376303 CEP170Q5SW79 1584 aa30.95■■■□□ 2.54
SYP-202ENST00000376303 SHROOM2Q13796 1616 aa30.83■■■□□ 2.53
SYP-202ENST00000376303 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.81■■■□□ 2.52
SYP-202ENST00000376303 KIF27Q86VH2 1401 aa30.7■■■□□ 2.5
SYP-202ENST00000376303 JPH4Q96JJ6 628 aa30.66■■■□□ 2.5
SYP-202ENST00000376303 IGF1RP08069 1367 aa30.65■■■□□ 2.5
SYP-202ENST00000376303 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
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