RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369131.8

SFXN4-202, Transcript of sideroflexin 4, humanhuman

TSL 5

Gene SFXN4, Length 1,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4-202ENST00000369131 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.5■■■■■ 6.96
SFXN4-202ENST00000369131 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.15■■■■■ 5.94
SFXN4-202ENST00000369131 ABCC9O60706 1549 aa51.87■■■■■ 5.89
SFXN4-202ENST00000369131 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.51■■■■■ 5.52
SFXN4-202ENST00000369131 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.4■■■■■ 5.5
SFXN4-202ENST00000369131 NACADO15069 1562 aa49.3■■■■■ 5.48
SFXN4-202ENST00000369131 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.78■■■■■ 5.4
SFXN4-202ENST00000369131 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.55■■■■■ 5.36
SFXN4-202ENST00000369131 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.47■■■■■ 5.35
SFXN4-202ENST00000369131 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.32■■■■■ 5.33
SFXN4-202ENST00000369131 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.29■■■■■ 5.32
SFXN4-202ENST00000369131 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.21■■■■■ 5.31
SFXN4-202ENST00000369131 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.01■■■■■ 5.28
SFXN4-202ENST00000369131 SCRIBQ14160 1630 aa47.63■■■■■ 5.22
SFXN4-202ENST00000369131 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.44■■■■■ 5.18
SFXN4-202ENST00000369131 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
SFXN4-202ENST00000369131 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.79■■■■■ 5.08
SFXN4-202ENST00000369131 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.68■■■■■ 5.06
SFXN4-202ENST00000369131 NCAPD3P42695 1498 aa45.56■■■■■ 4.88
SFXN4-202ENST00000369131 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.49■■■■■ 4.87
SFXN4-202ENST00000369131 SMARCA4P51532 1647 aa45.48■■■■■ 4.87
SFXN4-202ENST00000369131 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
SFXN4-202ENST00000369131 SMARCA2P51531 1590 aa45.35■■■■■ 4.85
SFXN4-202ENST00000369131 HMGXB3Q12766 1538 aa45.18■■■■■ 4.82
SFXN4-202ENST00000369131 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.08■■■■■ 4.81
SFXN4-202ENST00000369131 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
SFXN4-202ENST00000369131 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.02■■■■■ 4.8
SFXN4-202ENST00000369131 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.83■■■■■ 4.77
SFXN4-202ENST00000369131 ERCC6Q03468 1493 aa44.77■■■■■ 4.76
SFXN4-202ENST00000369131 NESP48681 1621 aa44.67■■■■■ 4.74
SFXN4-202ENST00000369131 WIZO95785 1651 aa44.51■■■■■ 4.72
SFXN4-202ENST00000369131 CUX2O14529 1486 aa44.47■■■■■ 4.71
SFXN4-202ENST00000369131 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.39■■■■■ 4.7
SFXN4-202ENST00000369131 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.69
SFXN4-202ENST00000369131 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.25■■■■■ 4.67
SFXN4-202ENST00000369131 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.23■■■■■ 4.67
SFXN4-202ENST00000369131 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
SFXN4-202ENST00000369131 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
SFXN4-202ENST00000369131 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.97■■■■■ 4.63
SFXN4-202ENST00000369131 CFTRP13569 1480 aa43.79■■■■■ 4.6
SFXN4-202ENST00000369131 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.76■■■■■ 4.6
SFXN4-202ENST00000369131 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.7■■■■■ 4.59
SFXN4-202ENST00000369131 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.68■■■■■ 4.58
SFXN4-202ENST00000369131 WDR62O43379 1518 aa43.58■■■■■ 4.57
SFXN4-202ENST00000369131 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.57■■■■■ 4.57
SFXN4-202ENST00000369131 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
SFXN4-202ENST00000369131 PRDM2Q13029 1718 aa43.16■■■■■ 4.5
SFXN4-202ENST00000369131 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
SFXN4-202ENST00000369131 TOPBP1Q92547 1522 aa42.9■■■■■ 4.46
SFXN4-202ENST00000369131 ABCC8Q09428 1581 aa42.87■■■■■ 4.45
SFXN4-202ENST00000369131 IFT140Q96RY7 1462 aa42.81■■■■■ 4.44
SFXN4-202ENST00000369131 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.75■■■■■ 4.43
SFXN4-202ENST00000369131 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
SFXN4-202ENST00000369131 OSCARQ8IYS5 282 aa42.67■■■■■ 4.42
SFXN4-202ENST00000369131 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
SFXN4-202ENST00000369131 TRIM41Q8WV44 630 aa42.44■■■■■ 4.38
SFXN4-202ENST00000369131 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
SFXN4-202ENST00000369131 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.389e-7■■■□□ 17.8
SFXN4-202ENST00000369131 SOGA1O94964 1423 aa42.38■■■■■ 4.38
SFXN4-202ENST00000369131 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.37■■■■■ 4.37
SFXN4-202ENST00000369131 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
SFXN4-202ENST00000369131 CUX1P39880 1505 aa42.31■■■■■ 4.36
SFXN4-202ENST00000369131 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.3■■■■■ 4.36
SFXN4-202ENST00000369131 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.35
SFXN4-202ENST00000369131 FBLN2P98095 1184 aa42.13■■■■■ 4.33
SFXN4-202ENST00000369131 WDR97A6NE52 1622 aa42.01■■■■■ 4.32
SFXN4-202ENST00000369131 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.94■■■■■ 4.3
SFXN4-202ENST00000369131 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
SFXN4-202ENST00000369131 CHD1O14646 1710 aa41.92■■■■■ 4.3
SFXN4-202ENST00000369131 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
SFXN4-202ENST00000369131 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.86■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.86■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.86■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.86■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.85■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.84■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 ARHGEF11O15085 1522 aa41.83■■■■■ 4.29
SFXN4-202ENST00000369131 TOP2BQ02880 1626 aa41.73■■■■■ 4.27
SFXN4-202ENST00000369131 SYNJ2O15056 1496 aa41.71■■■■■ 4.27
SFXN4-202ENST00000369131 SYNJ1O43426 1573 aa41.7■■■■■ 4.27
SFXN4-202ENST00000369131 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.69■■■■■ 4.26
SFXN4-202ENST00000369131 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.66■■■■■ 4.26
SFXN4-202ENST00000369131 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.65■■■■■ 4.26
SFXN4-202ENST00000369131 PBRM1Q86U86 1689 aa41.62■■■■■ 4.25
SFXN4-202ENST00000369131 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.53■■■■■ 4.24
SFXN4-202ENST00000369131 ARAP1Q96P48 1450 aa41.46■■■■■ 4.23
SFXN4-202ENST00000369131 GRIN2AQ12879 1464 aa41.35■■■■■ 4.21
SFXN4-202ENST00000369131 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
SFXN4-202ENST00000369131 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.2
SFXN4-202ENST00000369131 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.31■■■■■ 4.2
SFXN4-202ENST00000369131 NUP160Q12769 1436 aa41.2■■■■■ 4.19
SFXN4-202ENST00000369131 CEP170Q5SW79 1584 aa41.13■■■■■ 4.18
SFXN4-202ENST00000369131 KIF27Q86VH2 1401 aa41.06■■■■■ 4.16
SFXN4-202ENST00000369131 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
SFXN4-202ENST00000369131 IGF1RP08069 1367 aa41■■■■■ 4.15
SFXN4-202ENST00000369131 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.94■■■■■ 4.14
SFXN4-202ENST00000369131 JPH4Q96JJ6 628 aa40.91■■■■■ 4.14
SFXN4-202ENST00000369131 SHROOM2Q13796 1616 aa40.86■■■■■ 4.13
SFXN4-202ENST00000369131 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
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