RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369123.3

LIN28B-AS1-201, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIN28B-AS1, Length 575 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.6■■■■■ 4.25
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.09■■■■□ 3.53
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LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.97■■■■□ 3.19
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NACADO15069 1562 aa34.94■■■■□ 3.18
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.79■■■■□ 3.16
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.69■■■■□ 3.14
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.54■■■■□ 3.12
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.04■■■■□ 3.04
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.84■■■■□ 3.01
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.69■■■□□ 2.98
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SCRIBQ14160 1630 aa33.64■■■□□ 2.98
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.42■■■□□ 2.94
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.85■■■□□ 2.85
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.67■■■□□ 2.82
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SMARCA4P51532 1647 aa32.28■■■□□ 2.76
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NCAPD3P42695 1498 aa32.25■■■□□ 2.75
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SMARCA2P51531 1590 aa32.18■■■□□ 2.74
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.17■■■□□ 2.74
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.07■■■□□ 2.72
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 HMGXB3Q12766 1538 aa32.05■■■□□ 2.72
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.98■■■□□ 2.71
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 WIZO95785 1651 aa31.59■■■□□ 2.65
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.39■■■□□ 2.62
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ERCC6Q03468 1493 aa31.33■■■□□ 2.61
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NESP48681 1621 aa31.31■■■□□ 2.6
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.28■■■□□ 2.6
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.22■■■□□ 2.59
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CUX2O14529 1486 aa31.17■■■□□ 2.58
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CFTRP13569 1480 aa31.05■■■□□ 2.56
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.96■■■□□ 2.55
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.95■■■□□ 2.55
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.85■■■□□ 2.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.84■■■□□ 2.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.83■■■□□ 2.53
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PRDM2Q13029 1718 aa30.76■■■□□ 2.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 WDR62O43379 1518 aa30.74■■■□□ 2.51
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ABCC8Q09428 1581 aa30.49■■■□□ 2.47
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.36■■■□□ 2.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TOPBP1Q92547 1522 aa30.34■■■□□ 2.45
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.31■■■□□ 2.44
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 IFT140Q96RY7 1462 aa30.25■■■□□ 2.43
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CUX1P39880 1505 aa30.01■■■□□ 2.4
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SOGA1O94964 1423 aa29.97■■■□□ 2.39
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.95■■■□□ 2.39
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 WDR97A6NE52 1622 aa29.93■■■□□ 2.38
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.87■■■□□ 2.37
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 OSCARQ8IYS5 282 aa29.85■■■□□ 2.37
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TOP2BQ02880 1626 aa29.78■■■□□ 2.36
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.77■■■□□ 2.36
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.73■■■□□ 2.35
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GRIN2BQ13224 1484 aa29.67■■■□□ 2.34
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SYNJ1O43426 1573 aa29.66■■■□□ 2.34
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.62■■■□□ 2.33
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.56■■■□□ 2.32
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.55■■■□□ 2.32
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CHD1O14646 1710 aa29.51■■■□□ 2.31
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 PBRM1Q86U86 1689 aa29.49■■■□□ 2.31
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FBLN2P98095 1184 aa29.48■■■□□ 2.31
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SYNJ2O15056 1496 aa29.48■■■□□ 2.31
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.4■■■□□ 2.3
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.31■■■□□ 2.28
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ADAMTS12P58397 1594 aa29.28■■■□□ 2.28
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KIF27Q86VH2 1401 aa29.27■■■□□ 2.28
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ARHGEF11O15085 1522 aa29.26■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.26■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.25■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.25■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.25■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 GRIN2AQ12879 1464 aa29.24■■■□□ 2.27
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 NUP160Q12769 1436 aa29.16■■■□□ 2.26
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 IGF1RP08069 1367 aa29.13■■■□□ 2.25
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 TRIM41Q8WV44 630 aa29.12■■■□□ 2.25
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CUL7Q14999 1698 aa29.06■■■□□ 2.24
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 ARAP1Q96P48 1450 aa28.99■■■□□ 2.23
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.99■■■□□ 2.23
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.97■■■□□ 2.23
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 SHROOM2Q13796 1616 aa28.93■■■□□ 2.22
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 JPH4Q96JJ6 628 aa28.87■■■□□ 2.21
LIN28B-AS1-201ENST00000369123 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.87■■■□□ 2.21
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