RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368659.3

SLC27A3-202, Transcript of solute carrier family 27 member 3, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A3, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3-202ENST00000368659 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC27A3-202ENST00000368659 ABCC9O60706 1549 aa32.61■■■□□ 2.81
SLC27A3-202ENST00000368659 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.42■■■□□ 2.78
SLC27A3-202ENST00000368659 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.95■■■□□ 2.55
SLC27A3-202ENST00000368659 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.92■■■□□ 2.54
SLC27A3-202ENST00000368659 NACADO15069 1562 aa30.66■■■□□ 2.5
SLC27A3-202ENST00000368659 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.42■■■□□ 2.46
SLC27A3-202ENST00000368659 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
SLC27A3-202ENST00000368659 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.24■■■□□ 2.43
SLC27A3-202ENST00000368659 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC27A3-202ENST00000368659 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC27A3-202ENST00000368659 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
SLC27A3-202ENST00000368659 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC27A3-202ENST00000368659 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC27A3-202ENST00000368659 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC27A3-202ENST00000368659 SCRIBQ14160 1630 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC27A3-202ENST00000368659 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3-202ENST00000368659 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3-202ENST00000368659 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3-202ENST00000368659 NCAPD3P42695 1498 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC27A3-202ENST00000368659 CUX2O14529 1486 aa28.23■■■□□ 2.11
SLC27A3-202ENST00000368659 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC27A3-202ENST00000368659 SMARCA4P51532 1647 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC27A3-202ENST00000368659 ERCC6Q03468 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3-202ENST00000368659 HMGXB3Q12766 1538 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC27A3-202ENST00000368659 SMARCA2P51531 1590 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC27A3-202ENST00000368659 NESP48681 1621 aa27.98■■■□□ 2.07
SLC27A3-202ENST00000368659 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.88■■■□□ 2.05
SLC27A3-202ENST00000368659 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SLC27A3-202ENST00000368659 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.04
SLC27A3-202ENST00000368659 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SLC27A3-202ENST00000368659 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.72■■■□□ 2.03
SLC27A3-202ENST00000368659 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.7■■■□□ 2.03
SLC27A3-202ENST00000368659 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC27A3-202ENST00000368659 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC27A3-202ENST00000368659 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3-202ENST00000368659 WIZO95785 1651 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3-202ENST00000368659 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC27A3-202ENST00000368659 WDR62O43379 1518 aa27.31■■□□□ 1.96
SLC27A3-202ENST00000368659 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3-202ENST00000368659 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.08■■□□□ 1.93
SLC27A3-202ENST00000368659 CFTRP13569 1480 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3-202ENST00000368659 TRIM41Q8WV44 630 aa27.06■■□□□ 1.92
SLC27A3-202ENST00000368659 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SLC27A3-202ENST00000368659 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
SLC27A3-202ENST00000368659 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SLC27A3-202ENST00000368659 PRDM2Q13029 1718 aa26.87■■□□□ 1.89
SLC27A3-202ENST00000368659 OSCARQ8IYS5 282 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3-202ENST00000368659 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3-202ENST00000368659 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3-202ENST00000368659 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC27A3-202ENST00000368659 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC27A3-202ENST00000368659 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC27A3-202ENST00000368659 IFT140Q96RY7 1462 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC27A3-202ENST00000368659 TOPBP1Q92547 1522 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC27A3-202ENST00000368659 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3-202ENST00000368659 ARHGEF11O15085 1522 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3-202ENST00000368659 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC27A3-202ENST00000368659 ABCC8Q09428 1581 aa26.44■■□□□ 1.82
SLC27A3-202ENST00000368659 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SLC27A3-202ENST00000368659 CHD1O14646 1710 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC27A3-202ENST00000368659 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
SLC27A3-202ENST00000368659 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC27A3-202ENST00000368659 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3-202ENST00000368659 ARAP1Q96P48 1450 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3-202ENST00000368659 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3-202ENST00000368659 SOGA1O94964 1423 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC27A3-202ENST00000368659 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SLC27A3-202ENST00000368659 WDR97A6NE52 1622 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3-202ENST00000368659 FBLN2P98095 1184 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC27A3-202ENST00000368659 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC27A3-202ENST00000368659 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC27A3-202ENST00000368659 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3-202ENST00000368659 CUX1P39880 1505 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC27A3-202ENST00000368659 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3-202ENST00000368659 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3-202ENST00000368659 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3-202ENST00000368659 SYNJ1O43426 1573 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3-202ENST00000368659 GRIN2BQ13224 1484 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC27A3-202ENST00000368659 PBRM1Q86U86 1689 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC27A3-202ENST00000368659 SYNJ2O15056 1496 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC27A3-202ENST00000368659 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3-202ENST00000368659 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3-202ENST00000368659 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC27A3-202ENST00000368659 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC27A3-202ENST00000368659 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC27A3-202ENST00000368659 GRIN2AQ12879 1464 aa25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3-202ENST00000368659 ADAMTS12P58397 1594 aa25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3-202ENST00000368659 CEP170Q5SW79 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3-202ENST00000368659 NUP160Q12769 1436 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3-202ENST00000368659 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC27A3-202ENST00000368659 SHROOM2Q13796 1616 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC27A3-202ENST00000368659 TOP2BQ02880 1626 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC27A3-202ENST00000368659 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
SLC27A3-202ENST00000368659 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
SLC27A3-202ENST00000368659 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3-202ENST00000368659 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC27A3-202ENST00000368659 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SLC27A3-202ENST00000368659 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SLC27A3-202ENST00000368659 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.1 ms