RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364025.1

RN7SKP245-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 245, humanhuman

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Gene RN7SKP245, Length 320 nt, Biotype misc RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP245-201ENST00000364025 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.71■■■□□ 2.35
RN7SKP245-201ENST00000364025 ABCC9O60706 1549 aa26.45■■□□□ 1.83
RN7SKP245-201ENST00000364025 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.43■■□□□ 1.82
RN7SKP245-201ENST00000364025 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.19■■□□□ 1.62
RN7SKP245-201ENST00000364025 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.14■■□□□ 1.62
RN7SKP245-201ENST00000364025 NACADO15069 1562 aa25.02■■□□□ 1.6
RN7SKP245-201ENST00000364025 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
RN7SKP245-201ENST00000364025 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.77■■□□□ 1.56
RN7SKP245-201ENST00000364025 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
RN7SKP245-201ENST00000364025 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.52■■□□□ 1.52
RN7SKP245-201ENST00000364025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.48■■□□□ 1.51
RN7SKP245-201ENST00000364025 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.46■■□□□ 1.51
RN7SKP245-201ENST00000364025 SCRIBQ14160 1630 aa24.22■■□□□ 1.47
RN7SKP245-201ENST00000364025 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.02■■□□□ 1.44
RN7SKP245-201ENST00000364025 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.83■■□□□ 1.41
RN7SKP245-201ENST00000364025 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
RN7SKP245-201ENST00000364025 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
RN7SKP245-201ENST00000364025 NCAPD3P42695 1498 aa23.17■■□□□ 1.3
RN7SKP245-201ENST00000364025 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.13■■□□□ 1.29
RN7SKP245-201ENST00000364025 SMARCA4P51532 1647 aa23.09■■□□□ 1.29
RN7SKP245-201ENST00000364025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RN7SKP245-201ENST00000364025 SMARCA2P51531 1590 aa23■■□□□ 1.27
RN7SKP245-201ENST00000364025 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.93■■□□□ 1.26
RN7SKP245-201ENST00000364025 HMGXB3Q12766 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
RN7SKP245-201ENST00000364025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RN7SKP245-201ENST00000364025 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.84■■□□□ 1.25
RN7SKP245-201ENST00000364025 NESP48681 1621 aa22.79■■□□□ 1.24
RN7SKP245-201ENST00000364025 ERCC6Q03468 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
RN7SKP245-201ENST00000364025 WIZO95785 1651 aa22.63■■□□□ 1.21
RN7SKP245-201ENST00000364025 CUX2O14529 1486 aa22.61■■□□□ 1.21
RN7SKP245-201ENST00000364025 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RN7SKP245-201ENST00000364025 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.54■■□□□ 1.2
RN7SKP245-201ENST00000364025 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.53■■□□□ 1.2
RN7SKP245-201ENST00000364025 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.5■■□□□ 1.19
RN7SKP245-201ENST00000364025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.47■■□□□ 1.19
RN7SKP245-201ENST00000364025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.38■■□□□ 1.17
RN7SKP245-201ENST00000364025 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RN7SKP245-201ENST00000364025 CFTRP13569 1480 aa22.25■■□□□ 1.15
RN7SKP245-201ENST00000364025 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.25■■□□□ 1.15
RN7SKP245-201ENST00000364025 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.22■■□□□ 1.15
RN7SKP245-201ENST00000364025 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.19■■□□□ 1.14
RN7SKP245-201ENST00000364025 WDR62O43379 1518 aa22.16■■□□□ 1.14
RN7SKP245-201ENST00000364025 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.15■■□□□ 1.14
RN7SKP245-201ENST00000364025 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RN7SKP245-201ENST00000364025 PRDM2Q13029 1718 aa21.85■■□□□ 1.09
RN7SKP245-201ENST00000364025 TOPBP1Q92547 1522 aa21.81■■□□□ 1.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RN7SKP245-201ENST00000364025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 OSCARQ8IYS5 282 aa21.75■■□□□ 1.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 IFT140Q96RY7 1462 aa21.75■■□□□ 1.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 ABCC8Q09428 1581 aa21.73■■□□□ 1.07
RN7SKP245-201ENST00000364025 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.7■■□□□ 1.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 TRIM41Q8WV44 630 aa21.67■■□□□ 1.06
RN7SKP245-201ENST00000364025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
RN7SKP245-201ENST00000364025 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RN7SKP245-201ENST00000364025 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.58■■□□□ 1.05
RN7SKP245-201ENST00000364025 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
RN7SKP245-201ENST00000364025 SOGA1O94964 1423 aa21.55■■□□□ 1.04
RN7SKP245-201ENST00000364025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RN7SKP245-201ENST00000364025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RN7SKP245-201ENST00000364025 CUX1P39880 1505 aa21.52■■□□□ 1.04
RN7SKP245-201ENST00000364025 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.51■■□□□ 1.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 FBLN2P98095 1184 aa21.48■■□□□ 1.03
RN7SKP245-201ENST00000364025 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.33■■□□□ 1.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.33■■□□□ 1.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.33■■□□□ 1.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.33■■□□□ 1.01
RN7SKP245-201ENST00000364025 CHD1O14646 1710 aa21.32■■□□□ 1
RN7SKP245-201ENST00000364025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RN7SKP245-201ENST00000364025 ARHGEF11O15085 1522 aa21.31■■□□□ 1
RN7SKP245-201ENST00000364025 GRIN2BQ13224 1484 aa21.29■■□□□ 1
RN7SKP245-201ENST00000364025 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.28■■□□□ 1
RN7SKP245-201ENST00000364025 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.26■□□□□ 0.99
RN7SKP245-201ENST00000364025 WDR97A6NE52 1622 aa21.26■□□□□ 0.99
RN7SKP245-201ENST00000364025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
RN7SKP245-201ENST00000364025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RN7SKP245-201ENST00000364025 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.24■□□□□ 0.99
RN7SKP245-201ENST00000364025 SYNJ2O15056 1496 aa21.19■□□□□ 0.98
RN7SKP245-201ENST00000364025 SYNJ1O43426 1573 aa21.19■□□□□ 0.98
RN7SKP245-201ENST00000364025 TOP2BQ02880 1626 aa21.17■□□□□ 0.98
RN7SKP245-201ENST00000364025 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.15■□□□□ 0.98
RN7SKP245-201ENST00000364025 ARAP1Q96P48 1450 aa21.13■□□□□ 0.97
RN7SKP245-201ENST00000364025 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.13■□□□□ 0.97
RN7SKP245-201ENST00000364025 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.13■□□□□ 0.97
RN7SKP245-201ENST00000364025 PBRM1Q86U86 1689 aa21.12■□□□□ 0.97
RN7SKP245-201ENST00000364025 GRIN2AQ12879 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
RN7SKP245-201ENST00000364025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.99■□□□□ 0.95
RN7SKP245-201ENST00000364025 ADAMTS12P58397 1594 aa20.98■□□□□ 0.95
RN7SKP245-201ENST00000364025 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
RN7SKP245-201ENST00000364025 NUP160Q12769 1436 aa20.95■□□□□ 0.94
RN7SKP245-201ENST00000364025 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.94■□□□□ 0.94
RN7SKP245-201ENST00000364025 CEP170Q5SW79 1584 aa20.93■□□□□ 0.94
RN7SKP245-201ENST00000364025 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.89■□□□□ 0.93
RN7SKP245-201ENST00000364025 IGF1RP08069 1367 aa20.85■□□□□ 0.93
RN7SKP245-201ENST00000364025 KIF27Q86VH2 1401 aa20.82■□□□□ 0.92
RN7SKP245-201ENST00000364025 JPH4Q96JJ6 628 aa20.82■□□□□ 0.92
RN7SKP245-201ENST00000364025 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RN7SKP245-201ENST00000364025 SHROOM2Q13796 1616 aa20.76■□□□□ 0.91
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