RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355531.7

AFG3L1P-201, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AFG3L1P, Length 1,329 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-201ENST00000355531 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.33■■■■□ 3.57
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AFG3L1P-201ENST00000355531 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.99■■■□□ 2.71
AFG3L1P-201ENST00000355531 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.89■■■□□ 2.7
AFG3L1P-201ENST00000355531 NACADO15069 1562 aa31.65■■■□□ 2.66
AFG3L1P-201ENST00000355531 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.41■■■□□ 2.62
AFG3L1P-201ENST00000355531 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.33■■■□□ 2.61
AFG3L1P-201ENST00000355531 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
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AFG3L1P-201ENST00000355531 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.81■■■□□ 2.52
AFG3L1P-201ENST00000355531 SCRIBQ14160 1630 aa30.59■■■□□ 2.49
AFG3L1P-201ENST00000355531 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.5■■■□□ 2.47
AFG3L1P-201ENST00000355531 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.45■■■□□ 2.46
AFG3L1P-201ENST00000355531 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.4■■■□□ 2.46
AFG3L1P-201ENST00000355531 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
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AFG3L1P-201ENST00000355531 CUX2O14529 1486 aa29.3■■■□□ 2.28
AFG3L1P-201ENST00000355531 NCAPD3P42695 1498 aa29.18■■■□□ 2.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 SMARCA4P51532 1647 aa29.17■■■□□ 2.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 ERCC6Q03468 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
AFG3L1P-201ENST00000355531 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.12■■■□□ 2.25
AFG3L1P-201ENST00000355531 SMARCA2P51531 1590 aa29.06■■■□□ 2.24
AFG3L1P-201ENST00000355531 HMGXB3Q12766 1538 aa29.03■■■□□ 2.24
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AFG3L1P-201ENST00000355531 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.85■■■□□ 2.21
AFG3L1P-201ENST00000355531 NESP48681 1621 aa28.8■■■□□ 2.2
AFG3L1P-201ENST00000355531 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.79■■■□□ 2.2
AFG3L1P-201ENST00000355531 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
AFG3L1P-201ENST00000355531 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
AFG3L1P-201ENST00000355531 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.52■■■□□ 2.16
AFG3L1P-201ENST00000355531 WIZO95785 1651 aa28.5■■■□□ 2.15
AFG3L1P-201ENST00000355531 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.33■■■□□ 2.13
AFG3L1P-201ENST00000355531 TRIM41Q8WV44 630 aa28.31■■■□□ 2.12
AFG3L1P-201ENST00000355531 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.28■■■□□ 2.12
AFG3L1P-201ENST00000355531 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.16■■■□□ 2.1
AFG3L1P-201ENST00000355531 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
AFG3L1P-201ENST00000355531 WDR62O43379 1518 aa28.12■■■□□ 2.09
AFG3L1P-201ENST00000355531 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
AFG3L1P-201ENST00000355531 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.05■■■□□ 2.08
AFG3L1P-201ENST00000355531 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.01■■■□□ 2.07
AFG3L1P-201ENST00000355531 CFTRP13569 1480 aa28■■■□□ 2.07
AFG3L1P-201ENST00000355531 PRDM2Q13029 1718 aa27.89■■■□□ 2.06
AFG3L1P-201ENST00000355531 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
AFG3L1P-201ENST00000355531 OSCARQ8IYS5 282 aa27.73■■■□□ 2.03
AFG3L1P-201ENST00000355531 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.73■■■□□ 2.03
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AFG3L1P-201ENST00000355531 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.62■■■□□ 2.01
AFG3L1P-201ENST00000355531 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.62■■■□□ 2.01
AFG3L1P-201ENST00000355531 TOPBP1Q92547 1522 aa27.5■■□□□ 1.99
AFG3L1P-201ENST00000355531 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
AFG3L1P-201ENST00000355531 IFT140Q96RY7 1462 aa27.46■■□□□ 1.99
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARHGEF11O15085 1522 aa27.43■■□□□ 1.98
AFG3L1P-201ENST00000355531 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.42■■□□□ 1.98
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AFG3L1P-201ENST00000355531 ABCC8Q09428 1581 aa27.37■■□□□ 1.97
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AFG3L1P-201ENST00000355531 CHD1O14646 1710 aa27.24■■□□□ 1.95
AFG3L1P-201ENST00000355531 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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AFG3L1P-201ENST00000355531 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.12■■□□□ 1.93
AFG3L1P-201ENST00000355531 ARAP1Q96P48 1450 aa27.1■■□□□ 1.93
AFG3L1P-201ENST00000355531 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
AFG3L1P-201ENST00000355531 CUX1P39880 1505 aa27.06■■□□□ 1.92
AFG3L1P-201ENST00000355531 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
AFG3L1P-201ENST00000355531 SOGA1O94964 1423 aa27.03■■□□□ 1.92
AFG3L1P-201ENST00000355531 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
AFG3L1P-201ENST00000355531 WDR97A6NE52 1622 aa26.98■■□□□ 1.91
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AFG3L1P-201ENST00000355531 PBRM1Q86U86 1689 aa26.87■■□□□ 1.89
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AFG3L1P-201ENST00000355531 GRIN2BQ13224 1484 aa26.83■■□□□ 1.88
AFG3L1P-201ENST00000355531 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
AFG3L1P-201ENST00000355531 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.82■■□□□ 1.88
AFG3L1P-201ENST00000355531 SYNJ1O43426 1573 aa26.77■■□□□ 1.88
AFG3L1P-201ENST00000355531 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.77■■□□□ 1.88
AFG3L1P-201ENST00000355531 SYNJ2O15056 1496 aa26.75■■□□□ 1.87
AFG3L1P-201ENST00000355531 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.74■■□□□ 1.87
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AFG3L1P-201ENST00000355531 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
AFG3L1P-201ENST00000355531 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.72■■□□□ 1.87
AFG3L1P-201ENST00000355531 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.67■■□□□ 1.86
AFG3L1P-201ENST00000355531 TOP2BQ02880 1626 aa26.63■■□□□ 1.85
AFG3L1P-201ENST00000355531 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
AFG3L1P-201ENST00000355531 ADAMTS12P58397 1594 aa26.56■■□□□ 1.84
AFG3L1P-201ENST00000355531 GRIN2AQ12879 1464 aa26.51■■□□□ 1.83
AFG3L1P-201ENST00000355531 CEP170Q5SW79 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
AFG3L1P-201ENST00000355531 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.43■■□□□ 1.82
AFG3L1P-201ENST00000355531 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
AFG3L1P-201ENST00000355531 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.4■■□□□ 1.82
AFG3L1P-201ENST00000355531 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.37■■□□□ 1.81
AFG3L1P-201ENST00000355531 SHROOM2Q13796 1616 aa26.36■■□□□ 1.81
AFG3L1P-201ENST00000355531 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.27■■□□□ 1.8
AFG3L1P-201ENST00000355531 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.2■■□□□ 1.78
AFG3L1P-201ENST00000355531 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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