RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.61■■■□□ 2.33
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.36■■□□□ 1.81
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCC9O60706 1549 aa25.53■■□□□ 1.68
KCNQ1-203ENST00000345015 NACADO15069 1562 aa24.8■■□□□ 1.56
KCNQ1-203ENST00000345015 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.79■■□□□ 1.56
KCNQ1-203ENST00000345015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.76■■□□□ 1.55
KCNQ1-203ENST00000345015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
KCNQ1-203ENST00000345015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.65■■□□□ 1.54
KCNQ1-203ENST00000345015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.51■■□□□ 1.51
KCNQ1-203ENST00000345015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.06■■□□□ 1.44
KCNQ1-203ENST00000345015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.94■■□□□ 1.42
KCNQ1-203ENST00000345015 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.93■■□□□ 1.42
KCNQ1-203ENST00000345015 SCRIBQ14160 1630 aa23.84■■□□□ 1.41
KCNQ1-203ENST00000345015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.78■■□□□ 1.4
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KCNQ1-203ENST00000345015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.17■■□□□ 1.3
KCNQ1-203ENST00000345015 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.03■■□□□ 1.28
KCNQ1-203ENST00000345015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
KCNQ1-203ENST00000345015 SMARCA4P51532 1647 aa22.93■■□□□ 1.26
KCNQ1-203ENST00000345015 NCAPD3P42695 1498 aa22.88■■□□□ 1.25
KCNQ1-203ENST00000345015 SMARCA2P51531 1590 aa22.85■■□□□ 1.25
KCNQ1-203ENST00000345015 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.82■■□□□ 1.24
KCNQ1-203ENST00000345015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.82■■□□□ 1.24
KCNQ1-203ENST00000345015 HMGXB3Q12766 1538 aa22.76■■□□□ 1.23
KCNQ1-203ENST00000345015 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
KCNQ1-203ENST00000345015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
KCNQ1-203ENST00000345015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
KCNQ1-203ENST00000345015 WIZO95785 1651 aa22.43■■□□□ 1.18
KCNQ1-203ENST00000345015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
KCNQ1-203ENST00000345015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.25■■□□□ 1.15
KCNQ1-203ENST00000345015 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
KCNQ1-203ENST00000345015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.11■■□□□ 1.13
KCNQ1-203ENST00000345015 NESP48681 1621 aa22.09■■□□□ 1.13
KCNQ1-203ENST00000345015 ERCC6Q03468 1493 aa22.08■■□□□ 1.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CFTRP13569 1480 aa22.06■■□□□ 1.12
KCNQ1-203ENST00000345015 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.02■■□□□ 1.12
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KCNQ1-203ENST00000345015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.86■■□□□ 1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.85■■□□□ 1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 PRDM2Q13029 1718 aa21.85■■□□□ 1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.84■■□□□ 1.09
KCNQ1-203ENST00000345015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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KCNQ1-203ENST00000345015 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.81■■□□□ 1.08
KCNQ1-203ENST00000345015 WDR62O43379 1518 aa21.75■■□□□ 1.07
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCC8Q09428 1581 aa21.67■■□□□ 1.06
KCNQ1-203ENST00000345015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.66■■□□□ 1.06
KCNQ1-203ENST00000345015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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KCNQ1-203ENST00000345015 TOPBP1Q92547 1522 aa21.51■■□□□ 1.03
KCNQ1-203ENST00000345015 IFT140Q96RY7 1462 aa21.43■■□□□ 1.02
KCNQ1-203ENST00000345015 CUX1P39880 1505 aa21.33■■□□□ 1
KCNQ1-203ENST00000345015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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KCNQ1-203ENST00000345015 SOGA1O94964 1423 aa21.26■□□□□ 0.99
KCNQ1-203ENST00000345015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
KCNQ1-203ENST00000345015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.26■□□□□ 0.99
KCNQ1-203ENST00000345015 TOP2BQ02880 1626 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-203ENST00000345015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-203ENST00000345015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-203ENST00000345015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNJ1O43426 1573 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-203ENST00000345015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-203ENST00000345015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
KCNQ1-203ENST00000345015 GRIN2BQ13224 1484 aa21.04■□□□□ 0.96
KCNQ1-203ENST00000345015 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-203ENST00000345015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-203ENST00000345015 OSCARQ8IYS5 282 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21■□□□□ 0.95
KCNQ1-203ENST00000345015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.91■□□□□ 0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNJ2O15056 1496 aa20.9■□□□□ 0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 PBRM1Q86U86 1689 aa20.89■□□□□ 0.94
KCNQ1-203ENST00000345015 KIF27Q86VH2 1401 aa20.86■□□□□ 0.93
KCNQ1-203ENST00000345015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
KCNQ1-203ENST00000345015 CHD1O14646 1710 aa20.82■□□□□ 0.92
KCNQ1-203ENST00000345015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.82■□□□□ 0.92
KCNQ1-203ENST00000345015 ADAMTS12P58397 1594 aa20.78■□□□□ 0.92
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KCNQ1-203ENST00000345015 GRIN2AQ12879 1464 aa20.74■□□□□ 0.91
KCNQ1-203ENST00000345015 CUL7Q14999 1698 aa20.7■□□□□ 0.91
KCNQ1-203ENST00000345015 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.7■□□□□ 0.9
KCNQ1-203ENST00000345015 NUP160Q12769 1436 aa20.7■□□□□ 0.9
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KCNQ1-203ENST00000345015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-203ENST00000345015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
KCNQ1-203ENST00000345015 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNQ1-203ENST00000345015 ARHGEF11O15085 1522 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNQ1-203ENST00000345015 EEA1Q15075 1411 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP170Q5SW79 1584 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNQ1-203ENST00000345015 SHROOM2Q13796 1616 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-203ENST00000345015 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.51■□□□□ 0.87
KCNQ1-203ENST00000345015 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNQ1-203ENST00000345015 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.5■□□□□ 0.87
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