RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343105.9

NEMP2-201, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene NEMP2, Length 549 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2-201ENST00000343105 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.31■■■□□ 2.6
NEMP2-201ENST00000343105 ABCC9O60706 1549 aa29.69■■■□□ 2.34
NEMP2-201ENST00000343105 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.78■■■□□ 2.2
NEMP2-201ENST00000343105 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.65■■■□□ 2.18
NEMP2-201ENST00000343105 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.83■■■□□ 2.05
NEMP2-201ENST00000343105 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
NEMP2-201ENST00000343105 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.37■■□□□ 1.97
NEMP2-201ENST00000343105 NACADO15069 1562 aa27.35■■□□□ 1.97
NEMP2-201ENST00000343105 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.16■■□□□ 1.94
NEMP2-201ENST00000343105 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27■■□□□ 1.91
NEMP2-201ENST00000343105 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.97■■□□□ 1.91
NEMP2-201ENST00000343105 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.88■■□□□ 1.89
NEMP2-201ENST00000343105 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.78■■□□□ 1.88
NEMP2-201ENST00000343105 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.58■■□□□ 1.85
NEMP2-201ENST00000343105 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.58■■□□□ 1.85
NEMP2-201ENST00000343105 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NEMP2-201ENST00000343105 CUX2O14529 1486 aa26.11■■□□□ 1.77
NEMP2-201ENST00000343105 SCRIBQ14160 1630 aa25.98■■□□□ 1.75
NEMP2-201ENST00000343105 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.82■■□□□ 1.72
NEMP2-201ENST00000343105 ERCC6Q03468 1493 aa25.79■■□□□ 1.72
NEMP2-201ENST00000343105 TRIM41Q8WV44 630 aa25.72■■□□□ 1.71
NEMP2-201ENST00000343105 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NEMP2-201ENST00000343105 NCAPD3P42695 1498 aa25.23■■□□□ 1.63
NEMP2-201ENST00000343105 NESP48681 1621 aa25.15■■□□□ 1.62
NEMP2-201ENST00000343105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NEMP2-201ENST00000343105 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
NEMP2-201ENST00000343105 HMGXB3Q12766 1538 aa24.95■■□□□ 1.58
NEMP2-201ENST00000343105 SMARCA2P51531 1590 aa24.93■■□□□ 1.58
NEMP2-201ENST00000343105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.88■■□□□ 1.57
NEMP2-201ENST00000343105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.85■■□□□ 1.57
NEMP2-201ENST00000343105 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.79■■□□□ 1.56
NEMP2-201ENST00000343105 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NEMP2-201ENST00000343105 OSCARQ8IYS5 282 aa24.76■■□□□ 1.55
NEMP2-201ENST00000343105 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
NEMP2-201ENST00000343105 SMARCA4P51532 1647 aa24.68■■□□□ 1.54
NEMP2-201ENST00000343105 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.61■■□□□ 1.53
NEMP2-201ENST00000343105 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
NEMP2-201ENST00000343105 WDR62O43379 1518 aa24.56■■□□□ 1.52
NEMP2-201ENST00000343105 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.5■■□□□ 1.51
NEMP2-201ENST00000343105 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.5■■□□□ 1.51
NEMP2-201ENST00000343105 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.5■■□□□ 1.51
NEMP2-201ENST00000343105 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.44■■□□□ 1.5
NEMP2-201ENST00000343105 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.42■■□□□ 1.5
NEMP2-201ENST00000343105 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NEMP2-201ENST00000343105 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.3■■□□□ 1.48
NEMP2-201ENST00000343105 ARHGEF11O15085 1522 aa24.3■■□□□ 1.48
NEMP2-201ENST00000343105 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.23■■□□□ 1.47
NEMP2-201ENST00000343105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.14■■□□□ 1.46
NEMP2-201ENST00000343105 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.08■■□□□ 1.44
NEMP2-201ENST00000343105 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NEMP2-201ENST00000343105 ARAP1Q96P48 1450 aa23.95■■□□□ 1.42
NEMP2-201ENST00000343105 CFTRP13569 1480 aa23.88■■□□□ 1.41
NEMP2-201ENST00000343105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NEMP2-201ENST00000343105 IFT140Q96RY7 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
NEMP2-201ENST00000343105 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NEMP2-201ENST00000343105 CHD1O14646 1710 aa23.78■■□□□ 1.4
NEMP2-201ENST00000343105 WIZO95785 1651 aa23.76■■□□□ 1.39
NEMP2-201ENST00000343105 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NEMP2-201ENST00000343105 FBLN2P98095 1184 aa23.67■■□□□ 1.38
NEMP2-201ENST00000343105 PRDM2Q13029 1718 aa23.63■■□□□ 1.37
NEMP2-201ENST00000343105 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
NEMP2-201ENST00000343105 TOPBP1Q92547 1522 aa23.54■■□□□ 1.36
NEMP2-201ENST00000343105 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
NEMP2-201ENST00000343105 ABCC8Q09428 1581 aa23.51■■□□□ 1.35
NEMP2-201ENST00000343105 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.43■■□□□ 1.34
NEMP2-201ENST00000343105 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NEMP2-201ENST00000343105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
NEMP2-201ENST00000343105 SYNJ1O43426 1573 aa23.39■■□□□ 1.33
NEMP2-201ENST00000343105 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.38■■□□□ 1.33
NEMP2-201ENST00000343105 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NEMP2-201ENST00000343105 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.3■■□□□ 1.32
NEMP2-201ENST00000343105 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.25■■□□□ 1.31
NEMP2-201ENST00000343105 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEMP2-201ENST00000343105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
NEMP2-201ENST00000343105 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NEMP2-201ENST00000343105 WDR97A6NE52 1622 aa23.17■■□□□ 1.3
NEMP2-201ENST00000343105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.14■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 SOGA1O94964 1423 aa23.14■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.12■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 SYNJ2O15056 1496 aa23.11■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.11■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.08■■□□□ 1.29
NEMP2-201ENST00000343105 GRIN2BQ13224 1484 aa23.07■■□□□ 1.28
NEMP2-201ENST00000343105 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.93■■□□□ 1.26
NEMP2-201ENST00000343105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.92■■□□□ 1.26
NEMP2-201ENST00000343105 PBRM1Q86U86 1689 aa22.91■■□□□ 1.26
NEMP2-201ENST00000343105 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.88■■□□□ 1.25
NEMP2-201ENST00000343105 KDM6BO15054 1643 aa22.87■■□□□ 1.25
NEMP2-201ENST00000343105 CEP170Q5SW79 1584 aa22.85■■□□□ 1.25
NEMP2-201ENST00000343105 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.82■■□□□ 1.24
NEMP2-201ENST00000343105 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
NEMP2-201ENST00000343105 GRIN2AQ12879 1464 aa22.75■■□□□ 1.23
NEMP2-201ENST00000343105 SHROOM2Q13796 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
NEMP2-201ENST00000343105 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NEMP2-201ENST00000343105 DIP2BQ9P265 1576 aa22.72■■□□□ 1.23
NEMP2-201ENST00000343105 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.71■■□□□ 1.23
NEMP2-201ENST00000343105 CUX1P39880 1505 aa22.7■■□□□ 1.22
NEMP2-201ENST00000343105 MAPKBP1O60336 1514 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP2-201ENST00000343105 NUP160Q12769 1436 aa22.69■■□□□ 1.22
NEMP2-201ENST00000343105 FBXO41Q8TF61 875 aa22.69■■□□□ 1.22
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