RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341028.8

CDK11B-202, Transcript of cyclin dependent kinase 11B, humanhuman

TSL 2

Gene CDK11B, Length 881 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11B-202ENST00000341028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.9■■■■■ 6.38
CDK11B-202ENST00000341028 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.83■■■■■ 5.41
CDK11B-202ENST00000341028 ABCC9O60706 1549 aa47.95■■■■■ 5.27
CDK11B-202ENST00000341028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.04■■■■■ 4.96
CDK11B-202ENST00000341028 NACADO15069 1562 aa45.96■■■■■ 4.95
CDK11B-202ENST00000341028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.92■■■■■ 4.94
CDK11B-202ENST00000341028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.7■■■■■ 4.91
CDK11B-202ENST00000341028 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.66■■■■■ 4.9
CDK11B-202ENST00000341028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.41■■■■■ 4.86
CDK11B-202ENST00000341028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.02■■■■■ 4.8
CDK11B-202ENST00000341028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.81■■■■■ 4.76
CDK11B-202ENST00000341028 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.7■■■■■ 4.75
CDK11B-202ENST00000341028 SCRIBQ14160 1630 aa44.56■■■■■ 4.72
CDK11B-202ENST00000341028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.21■■■■■ 4.67
CDK11B-202ENST00000341028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.15■■■■■ 4.66
CDK11B-202ENST00000341028 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
CDK11B-202ENST00000341028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.37■■■■■ 4.53
CDK11B-202ENST00000341028 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.09■■■■■ 4.49
CDK11B-202ENST00000341028 SMARCA4P51532 1647 aa42.61■■■■■ 4.41
CDK11B-202ENST00000341028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
CDK11B-202ENST00000341028 NCAPD3P42695 1498 aa42.44■■■■■ 4.38
CDK11B-202ENST00000341028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.44■■■■■ 4.38
CDK11B-202ENST00000341028 SMARCA2P51531 1590 aa42.35■■■■■ 4.37
CDK11B-202ENST00000341028 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.33■■■■■ 4.37
CDK11B-202ENST00000341028 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.21■■■■■ 4.35
CDK11B-202ENST00000341028 HMGXB3Q12766 1538 aa42.19■■■■■ 4.34
CDK11B-202ENST00000341028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CDK11B-202ENST00000341028 WIZO95785 1651 aa41.85■■■■■ 4.29
CDK11B-202ENST00000341028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
CDK11B-202ENST00000341028 NESP48681 1621 aa41.47■■■■■ 4.23
CDK11B-202ENST00000341028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
CDK11B-202ENST00000341028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.31■■■■■ 4.2
CDK11B-202ENST00000341028 ERCC6Q03468 1493 aa41.29■■■■■ 4.2
CDK11B-202ENST00000341028 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.19■■■■■ 4.18
CDK11B-202ENST00000341028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.03■■■■■ 4.16
CDK11B-202ENST00000341028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.94■■■■■ 4.15
CDK11B-202ENST00000341028 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.93■■■■■ 4.14
CDK11B-202ENST00000341028 CUX2O14529 1486 aa40.93■■■■■ 4.14
CDK11B-202ENST00000341028 CFTRP13569 1480 aa40.92■■■■■ 4.14
CDK11B-202ENST00000341028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CDK11B-202ENST00000341028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.7■■■■■ 4.11
CDK11B-202ENST00000341028 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.64■■■■■ 4.1
CDK11B-202ENST00000341028 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.63■■■■■ 4.09
CDK11B-202ENST00000341028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
CDK11B-202ENST00000341028 PRDM2Q13029 1718 aa40.55■■■■■ 4.08
CDK11B-202ENST00000341028 WDR62O43379 1518 aa40.51■■■■■ 4.08
CDK11B-202ENST00000341028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CDK11B-202ENST00000341028 TOPBP1Q92547 1522 aa40.05■■■■■ 4
CDK11B-202ENST00000341028 ABCC8Q09428 1581 aa40.01■■■■■ 4
CDK11B-202ENST00000341028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.97■■■■□ 3.99
CDK11B-202ENST00000341028 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.88■■■■□ 3.97
CDK11B-202ENST00000341028 IFT140Q96RY7 1462 aa39.81■■■■□ 3.96
CDK11B-202ENST00000341028 CUX1P39880 1505 aa39.71■■■■□ 3.95
CDK11B-202ENST00000341028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
CDK11B-202ENST00000341028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
CDK11B-202ENST00000341028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CDK11B-202ENST00000341028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.58■■■■□ 3.93
CDK11B-202ENST00000341028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.55■■■■□ 3.92
CDK11B-202ENST00000341028 SOGA1O94964 1423 aa39.54■■■■□ 3.92
CDK11B-202ENST00000341028 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CDK11B-202ENST00000341028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.93e-8■■■■□ 22.5
CDK11B-202ENST00000341028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.39■■■■□ 3.9
CDK11B-202ENST00000341028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
CDK11B-202ENST00000341028 TOP2BQ02880 1626 aa39.31■■■■□ 3.88
CDK11B-202ENST00000341028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.31■■■■□ 3.88
CDK11B-202ENST00000341028 SYNJ1O43426 1573 aa39.3■■■■□ 3.88
CDK11B-202ENST00000341028 WDR97A6NE52 1622 aa39.26■■■■□ 3.88
CDK11B-202ENST00000341028 OSCARQ8IYS5 282 aa39.24■■■■□ 3.87
CDK11B-202ENST00000341028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.19■■■■□ 3.86
CDK11B-202ENST00000341028 GRIN2BQ13224 1484 aa39.07■■■■□ 3.85
CDK11B-202ENST00000341028 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.07■■■■□ 3.85
CDK11B-202ENST00000341028 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.05■■■■□ 3.84
CDK11B-202ENST00000341028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.04■■■■□ 3.84
CDK11B-202ENST00000341028 CHD1O14646 1710 aa39.01■■■■□ 3.84
CDK11B-202ENST00000341028 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
CDK11B-202ENST00000341028 PBRM1Q86U86 1689 aa38.97■■■■□ 3.83
CDK11B-202ENST00000341028 FBLN2P98095 1184 aa38.96■■■■□ 3.83
CDK11B-202ENST00000341028 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
CDK11B-202ENST00000341028 SYNJ2O15056 1496 aa38.84■■■■□ 3.81
CDK11B-202ENST00000341028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.71■■■■□ 3.79
CDK11B-202ENST00000341028 ADAMTS12P58397 1594 aa38.67■■■■□ 3.78
CDK11B-202ENST00000341028 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.61■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.61■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.6■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 ARHGEF11O15085 1522 aa38.58■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 GRIN2AQ12879 1464 aa38.58■■■■□ 3.77
CDK11B-202ENST00000341028 KIF27Q86VH2 1401 aa38.56■■■■□ 3.76
CDK11B-202ENST00000341028 TRIM41Q8WV44 630 aa38.49■■■■□ 3.75
CDK11B-202ENST00000341028 IGF1RP08069 1367 aa38.47■■■■□ 3.75
CDK11B-202ENST00000341028 NUP160Q12769 1436 aa38.43■■■■□ 3.74
CDK11B-202ENST00000341028 CEP170Q5SW79 1584 aa38.4■■■■□ 3.74
CDK11B-202ENST00000341028 CUL7Q14999 1698 aa38.31■■■■□ 3.72
CDK11B-202ENST00000341028 ARAP1Q96P48 1450 aa38.28■■■■□ 3.72
CDK11B-202ENST00000341028 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.26■■■■□ 3.72
CDK11B-202ENST00000341028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.23■■■■□ 3.71
CDK11B-202ENST00000341028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.22■■■■□ 3.71
CDK11B-202ENST00000341028 SHROOM2Q13796 1616 aa38.14■■■■□ 3.7
CDK11B-202ENST00000341028 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.09■■■■□ 3.69
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