RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331057.8

C16orf52-201, Transcript of Uncharacterized protein C16orf52, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C16orf52, Length 1,359 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C16orf52-201ENST00000331057 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.37■■■■■ 6.61
C16orf52-201ENST00000331057 SCRIBQ14160 1630 aa55.34■■■■■ 6.45
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C16orf52-201ENST00000331057 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.16■■■■■ 5.62
C16orf52-201ENST00000331057 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.12■■■■■ 5.61
C16orf52-201ENST00000331057 ERCC6Q03468 1493 aa50.08■■■■■ 5.61
C16orf52-201ENST00000331057 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.98■■■■■ 5.59
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C16orf52-201ENST00000331057 ABCC8Q09428 1581 aa49.67■■■■■ 5.54
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C16orf52-201ENST00000331057 SOGA1O94964 1423 aa48.83■■■■■ 5.41
C16orf52-201ENST00000331057 WDR97A6NE52 1622 aa48.8■■■■■ 5.4
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C16orf52-201ENST00000331057 KIF27Q86VH2 1401 aa48.27■■■■■ 5.32
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C16orf52-201ENST00000331057 ADAMTS12P58397 1594 aa47.96■■■■■ 5.27
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C16orf52-201ENST00000331057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.76■■■■■ 5.24
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C16orf52-201ENST00000331057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.69■■■■■ 5.22
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C16orf52-201ENST00000331057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.57■■■■■ 5.21
C16orf52-201ENST00000331057 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.55■■■■■ 5.2
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C16orf52-201ENST00000331057 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.36■■■■■ 5.17
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C16orf52-201ENST00000331057 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
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