RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325139.9

CYTH2-201, Transcript of cytohesin 2, humanhuman

TSL 2

Gene CYTH2, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH2-201ENST00000325139 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.37■■■■■ 7.58
CYTH2-201ENST00000325139 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.79■■■■■ 6.52
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC9O60706 1549 aa54.65■■■■■ 6.34
CYTH2-201ENST00000325139 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.49■■■■■ 5.99
CYTH2-201ENST00000325139 NACADO15069 1562 aa52.38■■■■■ 5.98
CYTH2-201ENST00000325139 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.05■■■■■ 5.92
CYTH2-201ENST00000325139 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.96■■■■■ 5.91
CYTH2-201ENST00000325139 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.68■■■■■ 5.86
CYTH2-201ENST00000325139 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.64■■■■■ 5.86
CYTH2-201ENST00000325139 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.63■■■■■ 5.86
CYTH2-201ENST00000325139 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.15■■■■■ 5.78
CYTH2-201ENST00000325139 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.83■■■■■ 5.73
CYTH2-201ENST00000325139 SCRIBQ14160 1630 aa50.69■■■■■ 5.71
CYTH2-201ENST00000325139 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.54■■■■■ 5.68
CYTH2-201ENST00000325139 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.46■■■■■ 5.67
CYTH2-201ENST00000325139 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
CYTH2-201ENST00000325139 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.57■■■■■ 5.53
CYTH2-201ENST00000325139 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.15■■■■■ 5.46
CYTH2-201ENST00000325139 SMARCA4P51532 1647 aa48.55■■■■■ 5.36
CYTH2-201ENST00000325139 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.33■■■■■ 5.33
CYTH2-201ENST00000325139 NCAPD3P42695 1498 aa48.31■■■■■ 5.32
CYTH2-201ENST00000325139 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.28■■■■■ 5.32
CYTH2-201ENST00000325139 SMARCA2P51531 1590 aa48.18■■■■■ 5.3
CYTH2-201ENST00000325139 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.17■■■■■ 5.3
CYTH2-201ENST00000325139 HMGXB3Q12766 1538 aa48.15■■■■■ 5.3
CYTH2-201ENST00000325139 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.08■■■■■ 5.29
CYTH2-201ENST00000325139 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
CYTH2-201ENST00000325139 WIZO95785 1651 aa47.57■■■■■ 5.21
CYTH2-201ENST00000325139 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.31■■■■■ 5.16
CYTH2-201ENST00000325139 NESP48681 1621 aa47.28■■■■■ 5.16
CYTH2-201ENST00000325139 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.14■■■■■ 5.14
CYTH2-201ENST00000325139 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
CYTH2-201ENST00000325139 ERCC6Q03468 1493 aa47■■■■■ 5.11
CYTH2-201ENST00000325139 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.86■■■■■ 5.09
CYTH2-201ENST00000325139 CUX2O14529 1486 aa46.85■■■■■ 5.09
CYTH2-201ENST00000325139 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
CYTH2-201ENST00000325139 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.76■■■■■ 5.08
CYTH2-201ENST00000325139 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.62■■■■■ 5.05
CYTH2-201ENST00000325139 CFTRP13569 1480 aa46.54■■■■■ 5.04
CYTH2-201ENST00000325139 PRDM2Q13029 1718 aa46.4■■■■■ 5.02
CYTH2-201ENST00000325139 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.38■■■■■ 5.01
CYTH2-201ENST00000325139 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.31■■■■■ 5
CYTH2-201ENST00000325139 WDR62O43379 1518 aa46.3■■■■■ 5
CYTH2-201ENST00000325139 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.27■■■■■ 5
CYTH2-201ENST00000325139 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.25■■■■■ 4.99
CYTH2-201ENST00000325139 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
CYTH2-201ENST00000325139 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.7■■■■■ 4.91
CYTH2-201ENST00000325139 TOPBP1Q92547 1522 aa45.57■■■■■ 4.88
CYTH2-201ENST00000325139 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.52■■■■■ 4.88
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC8Q09428 1581 aa45.41■■■■■ 4.86
CYTH2-201ENST00000325139 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
CYTH2-201ENST00000325139 IFT140Q96RY7 1462 aa45.29■■■■■ 4.84
CYTH2-201ENST00000325139 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
CYTH2-201ENST00000325139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
CYTH2-201ENST00000325139 CUX1P39880 1505 aa45.13■■■■■ 4.82
CYTH2-201ENST00000325139 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
CYTH2-201ENST00000325139 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.97■■■■■ 4.79
CYTH2-201ENST00000325139 WDR97A6NE52 1622 aa44.9■■■■■ 4.78
CYTH2-201ENST00000325139 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.9■■■■■ 4.78
CYTH2-201ENST00000325139 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.762e-6■■■■■ 30.3
CYTH2-201ENST00000325139 SOGA1O94964 1423 aa44.78■■■■■ 4.76
CYTH2-201ENST00000325139 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.75■■■■■ 4.75
CYTH2-201ENST00000325139 TOP2BQ02880 1626 aa44.66■■■■■ 4.74
CYTH2-201ENST00000325139 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
CYTH2-201ENST00000325139 CHD1O14646 1710 aa44.65■■■■■ 4.74
CYTH2-201ENST00000325139 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.55■■■■■ 4.72
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.55■■■■■ 4.72
CYTH2-201ENST00000325139 OSCARQ8IYS5 282 aa44.54■■■■■ 4.72
CYTH2-201ENST00000325139 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.53■■■■■ 4.72
CYTH2-201ENST00000325139 PBRM1Q86U86 1689 aa44.51■■■■■ 4.72
CYTH2-201ENST00000325139 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.43■■■■■ 4.7
CYTH2-201ENST00000325139 GRIN2BQ13224 1484 aa44.39■■■■■ 4.7
CYTH2-201ENST00000325139 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
CYTH2-201ENST00000325139 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.34■■■■■ 4.69
CYTH2-201ENST00000325139 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
CYTH2-201ENST00000325139 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
CYTH2-201ENST00000325139 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
CYTH2-201ENST00000325139 SYNJ2O15056 1496 aa44.19■■■■■ 4.66
CYTH2-201ENST00000325139 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.16■■■■■ 4.66
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF11O15085 1522 aa44.14■■■■■ 4.66
CYTH2-201ENST00000325139 ADAMTS12P58397 1594 aa44.1■■■■■ 4.65
CYTH2-201ENST00000325139 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44■■■■■ 4.63
CYTH2-201ENST00000325139 FBLN2P98095 1184 aa43.98■■■■■ 4.63
CYTH2-201ENST00000325139 GRIN2AQ12879 1464 aa43.89■■■■■ 4.62
CYTH2-201ENST00000325139 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
CYTH2-201ENST00000325139 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.81■■■■■ 4.6
CYTH2-201ENST00000325139 TRIM41Q8WV44 630 aa43.8■■■■■ 4.6
CYTH2-201ENST00000325139 CEP170Q5SW79 1584 aa43.8■■■■■ 4.6
CYTH2-201ENST00000325139 ARAP1Q96P48 1450 aa43.79■■■■■ 4.6
CYTH2-201ENST00000325139 NUP160Q12769 1436 aa43.77■■■■■ 4.6
CYTH2-201ENST00000325139 SHROOM2Q13796 1616 aa43.62■■■■■ 4.57
CYTH2-201ENST00000325139 CUL7Q14999 1698 aa43.57■■■■■ 4.57
CYTH2-201ENST00000325139 KIF27Q86VH2 1401 aa43.56■■■■■ 4.56
CYTH2-201ENST00000325139 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.5■■■■■ 4.55
CYTH2-201ENST00000325139 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.49■■■■■ 4.55
CYTH2-201ENST00000325139 IGF1RP08069 1367 aa43.49■■■■■ 4.55
CYTH2-201ENST00000325139 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.4■■■■■ 4.54
CYTH2-201ENST00000325139 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.16■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms