RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.8■■■■□ 3.8
IFT20-201ENST00000322326 ABCC9O60706 1549 aa35.11■■■■□ 3.21
IFT20-201ENST00000322326 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.95■■■■□ 3.18
IFT20-201ENST00000322326 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.37■■■□□ 2.93
IFT20-201ENST00000322326 NACADO15069 1562 aa33.09■■■□□ 2.89
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.05■■■□□ 2.88
IFT20-201ENST00000322326 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.86■■■□□ 2.85
IFT20-201ENST00000322326 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.63■■■□□ 2.81
IFT20-201ENST00000322326 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.57■■■□□ 2.8
IFT20-201ENST00000322326 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.56■■■□□ 2.8
IFT20-201ENST00000322326 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.34■■■□□ 2.77
IFT20-201ENST00000322326 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
IFT20-201ENST00000322326 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.05■■■□□ 2.72
IFT20-201ENST00000322326 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.96■■■□□ 2.71
IFT20-201ENST00000322326 SCRIBQ14160 1630 aa31.79■■■□□ 2.68
IFT20-201ENST00000322326 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.71■■■□□ 2.67
IFT20-201ENST00000322326 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
IFT20-201ENST00000322326 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.57■■■□□ 2.48
IFT20-201ENST00000322326 NCAPD3P42695 1498 aa30.52■■■□□ 2.48
IFT20-201ENST00000322326 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.39■■■□□ 2.46
IFT20-201ENST00000322326 CUX2O14529 1486 aa30.38■■■□□ 2.45
IFT20-201ENST00000322326 ERCC6Q03468 1493 aa30.37■■■□□ 2.45
IFT20-201ENST00000322326 SMARCA2P51531 1590 aa30.33■■■□□ 2.45
IFT20-201ENST00000322326 SMARCA4P51532 1647 aa30.32■■■□□ 2.44
IFT20-201ENST00000322326 HMGXB3Q12766 1538 aa30.29■■■□□ 2.44
IFT20-201ENST00000322326 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
IFT20-201ENST00000322326 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
IFT20-201ENST00000322326 NESP48681 1621 aa30.07■■■□□ 2.4
IFT20-201ENST00000322326 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.03■■■□□ 2.4
IFT20-201ENST00000322326 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.89■■■□□ 2.38
IFT20-201ENST00000322326 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.88■■■□□ 2.37
IFT20-201ENST00000322326 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
IFT20-201ENST00000322326 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.73■■■□□ 2.35
IFT20-201ENST00000322326 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.71■■■□□ 2.35
IFT20-201ENST00000322326 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.59■■■□□ 2.33
IFT20-201ENST00000322326 WIZO95785 1651 aa29.52■■■□□ 2.32
IFT20-201ENST00000322326 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.48■■■□□ 2.31
IFT20-201ENST00000322326 WDR62O43379 1518 aa29.4■■■□□ 2.3
IFT20-201ENST00000322326 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.32■■■□□ 2.28
IFT20-201ENST00000322326 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.25■■■□□ 2.27
IFT20-201ENST00000322326 CFTRP13569 1480 aa29.2■■■□□ 2.26
IFT20-201ENST00000322326 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
IFT20-201ENST00000322326 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
IFT20-201ENST00000322326 TRIM41Q8WV44 630 aa29.15■■■□□ 2.26
IFT20-201ENST00000322326 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
IFT20-201ENST00000322326 OSCARQ8IYS5 282 aa28.96■■■□□ 2.23
IFT20-201ENST00000322326 PRDM2Q13029 1718 aa28.92■■■□□ 2.22
IFT20-201ENST00000322326 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.8■■■□□ 2.2
IFT20-201ENST00000322326 IFT140Q96RY7 1462 aa28.74■■■□□ 2.19
IFT20-201ENST00000322326 TOPBP1Q92547 1522 aa28.68■■■□□ 2.18
IFT20-201ENST00000322326 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
IFT20-201ENST00000322326 ABCC8Q09428 1581 aa28.65■■■□□ 2.18
IFT20-201ENST00000322326 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
IFT20-201ENST00000322326 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
IFT20-201ENST00000322326 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.58■■■□□ 2.17
IFT20-201ENST00000322326 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.57■■■□□ 2.16
IFT20-201ENST00000322326 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
IFT20-201ENST00000322326 ARHGEF11O15085 1522 aa28.47■■■□□ 2.15
IFT20-201ENST00000322326 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
IFT20-201ENST00000322326 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
IFT20-201ENST00000322326 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
IFT20-201ENST00000322326 CHD1O14646 1710 aa28.36■■■□□ 2.13
IFT20-201ENST00000322326 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
IFT20-201ENST00000322326 FBLN2P98095 1184 aa28.29■■■□□ 2.12
IFT20-201ENST00000322326 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.27■■■□□ 2.12
IFT20-201ENST00000322326 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.25■■■□□ 2.11
IFT20-201ENST00000322326 SOGA1O94964 1423 aa28.25■■■□□ 2.11
IFT20-201ENST00000322326 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
IFT20-201ENST00000322326 WDR97A6NE52 1622 aa28.18■■■□□ 2.1
IFT20-201ENST00000322326 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.16■■■□□ 2.1
IFT20-201ENST00000322326 ARAP1Q96P48 1450 aa28.16■■■□□ 2.1
IFT20-201ENST00000322326 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.12■■■□□ 2.09
IFT20-201ENST00000322326 CUX1P39880 1505 aa28.08■■■□□ 2.09
IFT20-201ENST00000322326 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 SYNJ1O43426 1573 aa28.03■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 GRIN2BQ13224 1484 aa28.03■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.02■■■□□ 2.08
IFT20-201ENST00000322326 SYNJ2O15056 1496 aa27.96■■■□□ 2.07
IFT20-201ENST00000322326 PBRM1Q86U86 1689 aa27.91■■■□□ 2.06
IFT20-201ENST00000322326 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.9■■■□□ 2.06
IFT20-201ENST00000322326 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.84■■■□□ 2.05
IFT20-201ENST00000322326 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.81■■■□□ 2.04
IFT20-201ENST00000322326 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.03
IFT20-201ENST00000322326 GRIN2AQ12879 1464 aa27.66■■■□□ 2.02
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTS12P58397 1594 aa27.62■■■□□ 2.01
IFT20-201ENST00000322326 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.61■■■□□ 2.01
IFT20-201ENST00000322326 TOP2BQ02880 1626 aa27.6■■■□□ 2.01
IFT20-201ENST00000322326 NUP160Q12769 1436 aa27.57■■■□□ 2
IFT20-201ENST00000322326 CEP170Q5SW79 1584 aa27.56■■■□□ 2
IFT20-201ENST00000322326 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.55■■■□□ 2
IFT20-201ENST00000322326 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.54■■■□□ 2
IFT20-201ENST00000322326 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.49■■□□□ 1.99
IFT20-201ENST00000322326 SHROOM2Q13796 1616 aa27.47■■□□□ 1.99
IFT20-201ENST00000322326 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
IFT20-201ENST00000322326 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
IFT20-201ENST00000322326 JPH4Q96JJ6 628 aa27.3■■□□□ 1.96
IFT20-201ENST00000322326 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.23■■□□□ 1.95
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