RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.4■■■■■ 5.34
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RALGPS1-202ENST00000319107 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.6■■■■■ 4.09
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RALGPS1-202ENST00000319107 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
RALGPS1-202ENST00000319107 NACADO15069 1562 aa40.34■■■■■ 4.05
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RALGPS1-202ENST00000319107 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.12■■■■■ 4.01
RALGPS1-202ENST00000319107 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
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RALGPS1-202ENST00000319107 SCRIBQ14160 1630 aa39.15■■■■□ 3.86
RALGPS1-202ENST00000319107 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.85■■■■□ 3.81
RALGPS1-202ENST00000319107 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.55■■■■□ 3.76
RALGPS1-202ENST00000319107 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.51■■■■□ 3.76
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RALGPS1-202ENST00000319107 NCAPD3P42695 1498 aa37.17■■■■□ 3.54
RALGPS1-202ENST00000319107 SMARCA2P51531 1590 aa37.16■■■■□ 3.54
RALGPS1-202ENST00000319107 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
RALGPS1-202ENST00000319107 CUX2O14529 1486 aa37.14■■■■□ 3.54
RALGPS1-202ENST00000319107 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.13■■■■□ 3.54
RALGPS1-202ENST00000319107 HMGXB3Q12766 1538 aa37.02■■■■□ 3.52
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RALGPS1-202ENST00000319107 WIZO95785 1651 aa36.98■■■■□ 3.51
RALGPS1-202ENST00000319107 ERCC6Q03468 1493 aa36.95■■■■□ 3.51
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RALGPS1-202ENST00000319107 NESP48681 1621 aa36.43■■■■□ 3.42
RALGPS1-202ENST00000319107 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.32■■■■□ 3.4
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RALGPS1-202ENST00000319107 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.07■■■■□ 3.36
RALGPS1-202ENST00000319107 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.05■■■■□ 3.36
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.99■■■■□ 3.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM41Q8WV44 630 aa35.89■■■■□ 3.34
RALGPS1-202ENST00000319107 PRDM2Q13029 1718 aa35.85■■■■□ 3.33
RALGPS1-202ENST00000319107 CFTRP13569 1480 aa35.85■■■■□ 3.33
RALGPS1-202ENST00000319107 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.7■■■■□ 3.31
RALGPS1-202ENST00000319107 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.7■■■■□ 3.31
RALGPS1-202ENST00000319107 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.68■■■■□ 3.3
RALGPS1-202ENST00000319107 WDR62O43379 1518 aa35.62■■■■□ 3.29
RALGPS1-202ENST00000319107 OSCARQ8IYS5 282 aa35.36■■■■□ 3.25
RALGPS1-202ENST00000319107 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
RALGPS1-202ENST00000319107 ABCC8Q09428 1581 aa35.12■■■■□ 3.21
RALGPS1-202ENST00000319107 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.11■■■■□ 3.21
RALGPS1-202ENST00000319107 TOPBP1Q92547 1522 aa35.06■■■■□ 3.2
RALGPS1-202ENST00000319107 CUX1P39880 1505 aa34.98■■■■□ 3.19
RALGPS1-202ENST00000319107 IFT140Q96RY7 1462 aa34.95■■■■□ 3.19
RALGPS1-202ENST00000319107 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.9■■■■□ 3.18
RALGPS1-202ENST00000319107 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
RALGPS1-202ENST00000319107 SYNJ1O43426 1573 aa34.86■■■■□ 3.17
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RALGPS1-202ENST00000319107 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
RALGPS1-202ENST00000319107 TOP2BQ02880 1626 aa34.85■■■■□ 3.17
RALGPS1-202ENST00000319107 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
RALGPS1-202ENST00000319107 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
RALGPS1-202ENST00000319107 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.78■■■■□ 3.16
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
RALGPS1-202ENST00000319107 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
RALGPS1-202ENST00000319107 ARHGEF11O15085 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
RALGPS1-202ENST00000319107 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
RALGPS1-202ENST00000319107 WDR97A6NE52 1622 aa34.62■■■■□ 3.13
RALGPS1-202ENST00000319107 SOGA1O94964 1423 aa34.59■■■■□ 3.13
RALGPS1-202ENST00000319107 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.58■■■■□ 3.13
RALGPS1-202ENST00000319107 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.53■■■■□ 3.12
RALGPS1-202ENST00000319107 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.52■■■■□ 3.12
RALGPS1-202ENST00000319107 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.48■■■■□ 3.11
RALGPS1-202ENST00000319107 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
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RALGPS1-202ENST00000319107 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.37■■■■□ 3.09
RALGPS1-202ENST00000319107 CHD1O14646 1710 aa34.32■■■■□ 3.08
RALGPS1-202ENST00000319107 ARAP1Q96P48 1450 aa34.31■■■■□ 3.08
RALGPS1-202ENST00000319107 PBRM1Q86U86 1689 aa34.29■■■■□ 3.08
RALGPS1-202ENST00000319107 FBLN2P98095 1184 aa34.27■■■■□ 3.08
RALGPS1-202ENST00000319107 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.07
RALGPS1-202ENST00000319107 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.24■■■■□ 3.07
RALGPS1-202ENST00000319107 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.23■■■■□ 3.07
RALGPS1-202ENST00000319107 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
RALGPS1-202ENST00000319107 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.19■■■■□ 3.06
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF27Q86VH2 1401 aa34.11■■■■□ 3.05
RALGPS1-202ENST00000319107 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.09■■■■□ 3.05
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RALGPS1-202ENST00000319107 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
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RALGPS1-202ENST00000319107 CUL7Q14999 1698 aa33.94■■■■□ 3.02
RALGPS1-202ENST00000319107 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
RALGPS1-202ENST00000319107 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.86■■■■□ 3.01
RALGPS1-202ENST00000319107 IGF1RP08069 1367 aa33.85■■■■□ 3.01
RALGPS1-202ENST00000319107 EEA1Q15075 1411 aa33.82■■■■□ 3
RALGPS1-202ENST00000319107 GRIN2AQ12879 1464 aa33.82■■■■□ 3
RALGPS1-202ENST00000319107 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.69■■■□□ 2.98
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