RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301008.5

JPH3-202, Transcript of junctophilin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene JPH3, Length 1,030 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3-202ENST00000301008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.25■■■■■ 4.51
JPH3-202ENST00000301008 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.45■■■■□ 3.75
JPH3-202ENST00000301008 ABCC9O60706 1549 aa37.46■■■■□ 3.59
JPH3-202ENST00000301008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.1■■■■□ 3.37
JPH3-202ENST00000301008 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.1■■■■□ 3.37
JPH3-202ENST00000301008 NACADO15069 1562 aa36.08■■■■□ 3.37
JPH3-202ENST00000301008 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
JPH3-202ENST00000301008 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.87■■■■□ 3.33
JPH3-202ENST00000301008 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.78■■■■□ 3.32
JPH3-202ENST00000301008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.34■■■■□ 3.25
JPH3-202ENST00000301008 SCRIBQ14160 1630 aa35.1■■■■□ 3.21
JPH3-202ENST00000301008 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
JPH3-202ENST00000301008 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.98■■■■□ 3.19
JPH3-202ENST00000301008 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.9■■■■□ 3.18
JPH3-202ENST00000301008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.62■■■■□ 3.13
JPH3-202ENST00000301008 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
JPH3-202ENST00000301008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.9■■■■□ 3.02
JPH3-202ENST00000301008 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.68■■■□□ 2.98
JPH3-202ENST00000301008 SMARCA4P51532 1647 aa33.57■■■□□ 2.96
JPH3-202ENST00000301008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
JPH3-202ENST00000301008 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.34■■■□□ 2.93
JPH3-202ENST00000301008 SMARCA2P51531 1590 aa33.31■■■□□ 2.92
JPH3-202ENST00000301008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.31■■■□□ 2.92
JPH3-202ENST00000301008 NCAPD3P42695 1498 aa33.25■■■□□ 2.91
JPH3-202ENST00000301008 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.2■■■□□ 2.91
JPH3-202ENST00000301008 HMGXB3Q12766 1538 aa33.14■■■□□ 2.9
JPH3-202ENST00000301008 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
JPH3-202ENST00000301008 WIZO95785 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
JPH3-202ENST00000301008 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
JPH3-202ENST00000301008 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
JPH3-202ENST00000301008 NESP48681 1621 aa32.45■■■□□ 2.79
JPH3-202ENST00000301008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.41■■■□□ 2.78
JPH3-202ENST00000301008 ERCC6Q03468 1493 aa32.3■■■□□ 2.76
JPH3-202ENST00000301008 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.3■■■□□ 2.76
JPH3-202ENST00000301008 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
JPH3-202ENST00000301008 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.26■■■□□ 2.75
JPH3-202ENST00000301008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.17■■■□□ 2.74
JPH3-202ENST00000301008 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.16■■■□□ 2.74
JPH3-202ENST00000301008 CFTRP13569 1480 aa32.14■■■□□ 2.74
JPH3-202ENST00000301008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.12■■■□□ 2.73
JPH3-202ENST00000301008 PRDM2Q13029 1718 aa32.02■■■□□ 2.72
JPH3-202ENST00000301008 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.96■■■□□ 2.71
JPH3-202ENST00000301008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
JPH3-202ENST00000301008 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.92■■■□□ 2.7
JPH3-202ENST00000301008 CUX2O14529 1486 aa31.88■■■□□ 2.69
JPH3-202ENST00000301008 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.84■■■□□ 2.69
JPH3-202ENST00000301008 WDR62O43379 1518 aa31.73■■■□□ 2.67
JPH3-202ENST00000301008 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
JPH3-202ENST00000301008 TOPBP1Q92547 1522 aa31.47■■■□□ 2.63
JPH3-202ENST00000301008 ABCC8Q09428 1581 aa31.46■■■□□ 2.63
JPH3-202ENST00000301008 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.46■■■□□ 2.63
JPH3-202ENST00000301008 CUX1P39880 1505 aa31.29■■■□□ 2.6
JPH3-202ENST00000301008 IFT140Q96RY7 1462 aa31.23■■■□□ 2.59
JPH3-202ENST00000301008 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
JPH3-202ENST00000301008 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.16■■■□□ 2.58
JPH3-202ENST00000301008 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
JPH3-202ENST00000301008 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
JPH3-202ENST00000301008 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
JPH3-202ENST00000301008 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.07■■■□□ 2.56
JPH3-202ENST00000301008 SYNJ1O43426 1573 aa31.07■■■□□ 2.56
JPH3-202ENST00000301008 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.07■■■□□ 2.56
JPH3-202ENST00000301008 SOGA1O94964 1423 aa31.07■■■□□ 2.56
JPH3-202ENST00000301008 TOP2BQ02880 1626 aa31.06■■■□□ 2.56
JPH3-202ENST00000301008 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
JPH3-202ENST00000301008 WDR97A6NE52 1622 aa30.93■■■□□ 2.54
JPH3-202ENST00000301008 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
JPH3-202ENST00000301008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
JPH3-202ENST00000301008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.85■■■□□ 2.53
JPH3-202ENST00000301008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.75■■■□□ 2.51
JPH3-202ENST00000301008 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.73■■■□□ 2.51
JPH3-202ENST00000301008 PBRM1Q86U86 1689 aa30.72■■■□□ 2.51
JPH3-202ENST00000301008 TRIM41Q8WV44 630 aa30.7■■■□□ 2.51
JPH3-202ENST00000301008 GRIN2BQ13224 1484 aa30.7■■■□□ 2.5
JPH3-202ENST00000301008 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.66■■■□□ 2.5
JPH3-202ENST00000301008 CHD1O14646 1710 aa30.61■■■□□ 2.49
JPH3-202ENST00000301008 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
JPH3-202ENST00000301008 OSCARQ8IYS5 282 aa30.55■■■□□ 2.48
JPH3-202ENST00000301008 FBLN2P98095 1184 aa30.53■■■□□ 2.48
JPH3-202ENST00000301008 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.49■■■□□ 2.47
JPH3-202ENST00000301008 SYNJ2O15056 1496 aa30.49■■■□□ 2.47
JPH3-202ENST00000301008 KIF27Q86VH2 1401 aa30.47■■■□□ 2.47
JPH3-202ENST00000301008 ADAMTS12P58397 1594 aa30.45■■■□□ 2.47
JPH3-202ENST00000301008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
JPH3-202ENST00000301008 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.37■■■□□ 2.45
JPH3-202ENST00000301008 GRIN2AQ12879 1464 aa30.31■■■□□ 2.44
JPH3-202ENST00000301008 IGF1RP08069 1367 aa30.28■■■□□ 2.44
JPH3-202ENST00000301008 CUL7Q14999 1698 aa30.28■■■□□ 2.44
JPH3-202ENST00000301008 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.22■■■□□ 2.43
JPH3-202ENST00000301008 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.22■■■□□ 2.43
JPH3-202ENST00000301008 CEP170Q5SW79 1584 aa30.17■■■□□ 2.42
JPH3-202ENST00000301008 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.17■■■□□ 2.42
JPH3-202ENST00000301008 NUP160Q12769 1436 aa30.15■■■□□ 2.42
JPH3-202ENST00000301008 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.14■■■□□ 2.41
JPH3-202ENST00000301008 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
JPH3-202ENST00000301008 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
JPH3-202ENST00000301008 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.11■■■□□ 2.41
JPH3-202ENST00000301008 ARHGEF11O15085 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
JPH3-202ENST00000301008 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.99■■■□□ 2.39
JPH3-202ENST00000301008 EEA1Q15075 1411 aa29.96■■■□□ 2.39
JPH3-202ENST00000301008 SHROOM2Q13796 1616 aa29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms