RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288087.11

MDP1-201, Transcript of magnesium dependent phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDP1, Length 730 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDP1-201ENST00000288087 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.35■■□□□ 1.81
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MDP1-201ENST00000288087 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.88■■□□□ 1.41
MDP1-201ENST00000288087 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.25■■□□□ 1.31
MDP1-201ENST00000288087 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.14■■□□□ 1.29
MDP1-201ENST00000288087 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
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MDP1-201ENST00000288087 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.72■■□□□ 1.23
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MDP1-201ENST00000288087 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.57■■□□□ 1.2
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MDP1-201ENST00000288087 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
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MDP1-201ENST00000288087 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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MDP1-201ENST00000288087 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.37■□□□□ 0.85
MDP1-201ENST00000288087 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.3■□□□□ 0.84
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MDP1-201ENST00000288087 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.07■□□□□ 0.64
MDP1-201ENST00000288087 SHROOM2Q13796 1616 aa19.03■□□□□ 0.64
MDP1-201ENST00000288087 GRIN2AQ12879 1464 aa19.02■□□□□ 0.63
MDP1-201ENST00000288087 DIP2BQ9P265 1576 aa19.02■□□□□ 0.63
MDP1-201ENST00000288087 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
MDP1-201ENST00000288087 ADGRL1O94910 1474 aa19.01■□□□□ 0.63
MDP1-201ENST00000288087 NUP160Q12769 1436 aa19■□□□□ 0.63
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