RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.23■■■■■ 4.99
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.11■■■■■ 4.17
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC9O60706 1549 aa40.63■■■■■ 4.1
MALSU1-201ENST00000287543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.96■■■■□ 3.83
MALSU1-201ENST00000287543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.88■■■■□ 3.81
MALSU1-201ENST00000287543 NACADO15069 1562 aa38.87■■■■□ 3.81
MALSU1-201ENST00000287543 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.59■■■■□ 3.77
MALSU1-201ENST00000287543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
MALSU1-201ENST00000287543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.28■■■■□ 3.72
MALSU1-201ENST00000287543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38■■■■□ 3.67
MALSU1-201ENST00000287543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.73■■■■□ 3.63
MALSU1-201ENST00000287543 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.68■■■■□ 3.62
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.62■■■■□ 3.61
MALSU1-201ENST00000287543 SCRIBQ14160 1630 aa37.47■■■■□ 3.59
MALSU1-201ENST00000287543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.47■■■■□ 3.59
MALSU1-201ENST00000287543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
MALSU1-201ENST00000287543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.67■■■■□ 3.46
MALSU1-201ENST00000287543 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.6■■■■□ 3.45
MALSU1-201ENST00000287543 NCAPD3P42695 1498 aa35.93■■■■□ 3.34
MALSU1-201ENST00000287543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
MALSU1-201ENST00000287543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.86■■■■□ 3.33
MALSU1-201ENST00000287543 SMARCA4P51532 1647 aa35.84■■■■□ 3.33
MALSU1-201ENST00000287543 SMARCA2P51531 1590 aa35.79■■■■□ 3.32
MALSU1-201ENST00000287543 HMGXB3Q12766 1538 aa35.63■■■■□ 3.29
MALSU1-201ENST00000287543 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.56■■■■□ 3.28
MALSU1-201ENST00000287543 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.55■■■■□ 3.28
MALSU1-201ENST00000287543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
MALSU1-201ENST00000287543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
MALSU1-201ENST00000287543 ERCC6Q03468 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
MALSU1-201ENST00000287543 WIZO95785 1651 aa35.07■■■■□ 3.2
MALSU1-201ENST00000287543 NESP48681 1621 aa35.01■■■■□ 3.19
MALSU1-201ENST00000287543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.95■■■■□ 3.18
MALSU1-201ENST00000287543 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.89■■■■□ 3.18
MALSU1-201ENST00000287543 CUX2O14529 1486 aa34.88■■■■□ 3.17
MALSU1-201ENST00000287543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.86■■■■□ 3.17
MALSU1-201ENST00000287543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
MALSU1-201ENST00000287543 CFTRP13569 1480 aa34.57■■■■□ 3.12
MALSU1-201ENST00000287543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
MALSU1-201ENST00000287543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.44■■■■□ 3.1
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.42■■■■□ 3.1
MALSU1-201ENST00000287543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.42■■■■□ 3.1
MALSU1-201ENST00000287543 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.42■■■■□ 3.1
MALSU1-201ENST00000287543 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.41■■■■□ 3.1
MALSU1-201ENST00000287543 WDR62O43379 1518 aa34.26■■■■□ 3.08
MALSU1-201ENST00000287543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.25■■■■□ 3.07
MALSU1-201ENST00000287543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
MALSU1-201ENST00000287543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
MALSU1-201ENST00000287543 PRDM2Q13029 1718 aa33.96■■■■□ 3.03
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC8Q09428 1581 aa33.9■■■■□ 3.02
MALSU1-201ENST00000287543 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
MALSU1-201ENST00000287543 IFT140Q96RY7 1462 aa33.74■■■□□ 2.99
MALSU1-201ENST00000287543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.7■■■□□ 2.99
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
MALSU1-201ENST00000287543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
MALSU1-201ENST00000287543 OSCARQ8IYS5 282 aa33.49■■■□□ 2.95
MALSU1-201ENST00000287543 SOGA1O94964 1423 aa33.44■■■□□ 2.94
MALSU1-201ENST00000287543 CUX1P39880 1505 aa33.38■■■□□ 2.93
MALSU1-201ENST00000287543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
MALSU1-201ENST00000287543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.36■■■□□ 2.93
MALSU1-201ENST00000287543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.34■■■□□ 2.931e-12■■■■■ 53.8
MALSU1-201ENST00000287543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.34■■■□□ 2.93
MALSU1-201ENST00000287543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
MALSU1-201ENST00000287543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
MALSU1-201ENST00000287543 WDR97A6NE52 1622 aa33.2■■■□□ 2.9
MALSU1-201ENST00000287543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.94e-6■■■■□ 19.5
MALSU1-201ENST00000287543 FBLN2P98095 1184 aa33.1■■■□□ 2.89
MALSU1-201ENST00000287543 GRIN2BQ13224 1484 aa33.07■■■□□ 2.88
MALSU1-201ENST00000287543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.06■■■□□ 2.88
MALSU1-201ENST00000287543 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.01■■■□□ 2.88
MALSU1-201ENST00000287543 TOP2BQ02880 1626 aa33.01■■■□□ 2.87
MALSU1-201ENST00000287543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
MALSU1-201ENST00000287543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
MALSU1-201ENST00000287543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.99■■■□□ 2.87
MALSU1-201ENST00000287543 TRIM41Q8WV44 630 aa32.94■■■□□ 2.86
MALSU1-201ENST00000287543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.94■■■□□ 2.86
MALSU1-201ENST00000287543 SYNJ1O43426 1573 aa32.92■■■□□ 2.86
MALSU1-201ENST00000287543 SYNJ2O15056 1496 aa32.87■■■□□ 2.85
MALSU1-201ENST00000287543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.83■■■□□ 2.85
MALSU1-201ENST00000287543 CHD1O14646 1710 aa32.82■■■□□ 2.84
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGEF11O15085 1522 aa32.76■■■□□ 2.83
MALSU1-201ENST00000287543 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
MALSU1-201ENST00000287543 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
MALSU1-201ENST00000287543 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.71■■■□□ 2.83
MALSU1-201ENST00000287543 PBRM1Q86U86 1689 aa32.71■■■□□ 2.83
MALSU1-201ENST00000287543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.66■■■□□ 2.82
MALSU1-201ENST00000287543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.66■■■□□ 2.82
MALSU1-201ENST00000287543 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.62■■■□□ 2.81
MALSU1-201ENST00000287543 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.61■■■□□ 2.81
MALSU1-201ENST00000287543 GRIN2AQ12879 1464 aa32.59■■■□□ 2.81
MALSU1-201ENST00000287543 ADAMTS12P58397 1594 aa32.55■■■□□ 2.8
MALSU1-201ENST00000287543 KIF27Q86VH2 1401 aa32.54■■■□□ 2.8
MALSU1-201ENST00000287543 NUP160Q12769 1436 aa32.49■■■□□ 2.79
MALSU1-201ENST00000287543 ARAP1Q96P48 1450 aa32.47■■■□□ 2.79
MALSU1-201ENST00000287543 IGF1RP08069 1367 aa32.44■■■□□ 2.78
MALSU1-201ENST00000287543 CEP170Q5SW79 1584 aa32.34■■■□□ 2.77
MALSU1-201ENST00000287543 JPH4Q96JJ6 628 aa32.26■■■□□ 2.75
MALSU1-201ENST00000287543 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.25■■■□□ 2.75
MALSU1-201ENST00000287543 CUL7Q14999 1698 aa32.21■■■□□ 2.75
MALSU1-201ENST00000287543 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
MALSU1-201ENST00000287543 SHROOM2Q13796 1616 aa32.15■■■□□ 2.74
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