RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244906.6

DKFZP434K028-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DKFZP434K028, Length 927 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.17■■■■□ 3.54
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.45■■■□□ 2.95
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.02■■■□□ 2.72
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.95■■■□□ 2.71
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NACADO15069 1562 aa31.67■■■□□ 2.66
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.53■■■□□ 2.64
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.11■■■□□ 2.57
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.49■■■□□ 2.47
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.49■■■□□ 2.47
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.4■■■□□ 2.46
DKFZP434K028-201ENST00000244906 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.14■■■□□ 2.26
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CUX2O14529 1486 aa29.12■■■□□ 2.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERCC6Q03468 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SMARCA4P51532 1647 aa29.06■■■□□ 2.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SMARCA2P51531 1590 aa29■■■□□ 2.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HMGXB3Q12766 1538 aa28.98■■■□□ 2.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NESP48681 1621 aa28.96■■■□□ 2.23
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.44■■■□□ 2.14
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.23■■■□□ 2.11
DKFZP434K028-201ENST00000244906 WDR62O43379 1518 aa28.18■■■□□ 2.1
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRIM41Q8WV44 630 aa28.09■■■□□ 2.09
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.06■■■□□ 2.08
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 CFTRP13569 1480 aa27.97■■■□□ 2.07
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 IFT140Q96RY7 1462 aa27.51■■□□□ 1.99
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARHGEF11O15085 1522 aa27.36■■□□□ 1.97
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCC8Q09428 1581 aa27.35■■□□□ 1.97
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.35■■□□□ 1.97
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHD1O14646 1710 aa27.3■■□□□ 1.96
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 FBLN2P98095 1184 aa27.14■■□□□ 1.94
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ARAP1Q96P48 1450 aa27.07■■□□□ 1.92
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.98■■□□□ 1.91
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GRIN2BQ13224 1484 aa26.82■■□□□ 1.88
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SYNJ1O43426 1573 aa26.82■■□□□ 1.88
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PBRM1Q86U86 1689 aa26.78■■□□□ 1.88
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SYNJ2O15056 1496 aa26.76■■□□□ 1.87
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.71■■□□□ 1.87
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.65■■□□□ 1.86
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.64■■□□□ 1.85
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.54■■□□□ 1.84
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GRIN2AQ12879 1464 aa26.49■■□□□ 1.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CEP170Q5SW79 1584 aa26.46■■□□□ 1.83
DKFZP434K028-201ENST00000244906 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADAMTS12P58397 1594 aa26.45■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.43■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NUP160Q12769 1436 aa26.41■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TOP2BQ02880 1626 aa26.41■■□□□ 1.82
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SHROOM2Q13796 1616 aa26.37■■□□□ 1.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.34■■□□□ 1.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.25■■□□□ 1.79
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
DKFZP434K028-201ENST00000244906 JPH4Q96JJ6 628 aa26.19■■□□□ 1.78
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