RNA–Protein interactions for RNA: YML023C

NSE5, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE5, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE5YML023C FRA1Q07825 749 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YOR238WQ08634 303 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C APC11Q12157 165 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C OSH2Q12451 1283 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C CEX1Q12453 761 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C PDI1P17967 522 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C PTP2P29461 750 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C NOP4P37838 685 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YBR184WP38299 523 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C RRP8P38961 392 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C HAL5P38970 855 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C CDC55Q00362 526 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C ERO1Q03103 563 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C SPO75Q07798 868 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C IQG1Q12280 1495 aa7.21□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MCM10P32354 571 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SOH1P38633 127 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SSP2Q08646 371 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE5YML023C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NSE5YML023C HSP60P19882 572 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C RPB10P22139 70 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C HSP78P33416 811 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YNL193WP53870 558 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CDC45Q08032 650 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YPL191CQ08930 360 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C APL5Q08951 932 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PLP2Q12017 286 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YDR056CQ12025 205 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C FAL1Q12099 399 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PDR10P51533 1564 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE5YML023C APA1P16550 321 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CHS3P29465 1165 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C RTA1P53047 317 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C BTN2P53286 410 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TRM3Q07527 1436 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C RNA1P11745 407 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PRE9P23638 258 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C DBF20P32328 564 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C VMA8P32610 256 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TFC4P33339 1025 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MOT2P34909 587 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SLI15P38283 698 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C HXT5P38695 592 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YNL115CP53925 644 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YNL011CP53980 444 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SDH5Q08230 162 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TRE2Q08693 809 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SPT7P35177 1332 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE5YML023C BUD3P25558 1636 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C ACE2P21192 770 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CIC1P38779 376 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MRPS18P42847 217 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YJR115WP47152 169 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C STR2P47164 639 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MAL11P53048 616 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C NST1P53935 1240 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C FMP25Q08023 583 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C BDS1Q08347 646 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MCD1Q12158 566 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE5YML023C NAT1P12945 854 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C UBP1P25037 809 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YKL100CP34248 587 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C RIM4P38741 713 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TMA108P40462 946 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SGM1P47166 707 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PUS6P53294 404 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TAF8Q03750 510 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TFB4Q12004 338 aa7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE5YML023C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TGL3P40308 642 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C RSC8P43609 557 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SUM1P46676 1062 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SCY1P53009 804 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YDR286CQ05530 114 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YPR084WQ06821 456 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C BAS1P22035 811 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C KTR2P33550 425 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YBR197CP38306 217 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C GEM1P39722 662 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MXR1P40029 184 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MAM1P40065 302 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C TUB4P53378 473 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C PAP2P53632 584 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C MLC2Q06580 163 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE5YML023C YLR001CQ07895 862 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.2 ms