Protein–RNA interactions for Protein: P38283

SLI15, Inner centromere protein-related protein SLI15, yeastyeast

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLI15P38283 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.6■■□□□ 1.53
SLI15P38283 NOP1YDL014W 984 nt24.26■■□□□ 1.47
SLI15P38283 NSR1YGR159C 1245 nt23.84■■□□□ 1.41
SLI15P38283 YKL036CYKL036C 393 nt23.11■■□□□ 1.29
SLI15P38283 YJL027CYJL027C 417 nt21.7■■□□□ 1.06
SLI15P38283 Q0297Q0297 156 nt21.52■■□□□ 1.04
SLI15P38283 SCS3YGL126W 1143 nt21.42■■□□□ 1.02
SLI15P38283 SRX1YKL086W 384 nt21.22■□□□□ 0.99
SLI15P38283 MDJ1YFL016C 1536 nt20.37■□□□□ 0.85
SLI15P38283 YCR051WYCR051W 669 nt20.15■□□□□ 0.82
SLI15P38283 SCJ1YMR214W 1134 nt20■□□□□ 0.79
SLI15P38283 YOL085CYOL085C 342 nt20■□□□□ 0.79
SLI15P38283 PKP1YIL042C 1185 nt19.55■□□□□ 0.72
SLI15P38283 ATS1YAL020C 1002 nt19.39■□□□□ 0.69
SLI15P38283 RPP1BYDL130W 321 nt19.3■□□□□ 0.68
SLI15P38283 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.72■□□□□ 0.59
SLI15P38283 CCC1YLR220W 969 nt18.49■□□□□ 0.55
SLI15P38283 DBP2YNL112W 1641 nt18.38■□□□□ 0.53
SLI15P38283 SCR1SCR1 522 nt18.34■□□□□ 0.53
SLI15P38283 PET122YER153C 765 nt18.32■□□□□ 0.52
SLI15P38283 RTC3YHR087W 336 nt18.1■□□□□ 0.49
SLI15P38283 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.96■□□□□ 0.47
SLI15P38283 RRN5YLR141W 1092 nt17.88■□□□□ 0.45
SLI15P38283 PST2YDR032C 597 nt17.84■□□□□ 0.45
SLI15P38283 RSB1YOR049C 1065 nt17.72■□□□□ 0.43
SLI15P38283 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.55■□□□□ 0.4
SLI15P38283 YKL097CYKL097C 411 nt17.52■□□□□ 0.4
SLI15P38283 RVS167YDR388W 1449 nt17.44■□□□□ 0.38
SLI15P38283 YDJ1YNL064C 1230 nt17.4■□□□□ 0.38
SLI15P38283 YBR190WYBR190W 312 nt17.22■□□□□ 0.35
SLI15P38283 SHR5YOL110W 714 nt17.04■□□□□ 0.32
SLI15P38283 SHU1YHL006C 453 nt16.91■□□□□ 0.3
SLI15P38283 GAR1YHR089C 618 nt16.83■□□□□ 0.28
SLI15P38283 YOR139CYOR139C 393 nt16.68■□□□□ 0.26
SLI15P38283 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.37■□□□□ 0.21
SLI15P38283 NPL3YDR432W 1245 nt16.35■□□□□ 0.21
SLI15P38283 TIR1YER011W 765 nt16.26■□□□□ 0.19
SLI15P38283 DEP1YAL013W 1218 nt16.24■□□□□ 0.19
SLI15P38283 YNL208WYNL208W 600 nt16.12■□□□□ 0.17
SLI15P38283 URN1YPR152C 1398 nt16.06■□□□□ 0.16
SLI15P38283 RPN10YHR200W 807 nt16.01■□□□□ 0.15
SLI15P38283 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.98■□□□□ 0.15
SLI15P38283 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.98■□□□□ 0.15
SLI15P38283 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.98■□□□□ 0.15
SLI15P38283 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.98■□□□□ 0.15
SLI15P38283 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.98■□□□□ 0.15
SLI15P38283 YOL037CYOL037C 354 nt15.9■□□□□ 0.14
SLI15P38283 SSA1YAL005C 1929 nt15.9■□□□□ 0.14
SLI15P38283 YGR021WYGR021W 873 nt15.84■□□□□ 0.13
SLI15P38283 HOM6YJR139C 1080 nt15.82■□□□□ 0.12
SLI15P38283 MNP1YGL068W 585 nt15.81■□□□□ 0.12
SLI15P38283 SRB2YHR041C 633 nt15.77■□□□□ 0.12
SLI15P38283 OPI9YLR338W 858 nt15.69■□□□□ 0.1
SLI15P38283 MOT3YMR070W 1473 nt15.67■□□□□ 0.1
SLI15P38283 BSC6YOL137W 1494 nt15.66■□□□□ 0.1
SLI15P38283 WWM1YFL010C 636 nt15.66■□□□□ 0.1
SLI15P38283 YGR139WYGR139W 339 nt15.65■□□□□ 0.1
SLI15P38283 RKM5YLR137W 1104 nt15.58■□□□□ 0.08
SLI15P38283 PUS2YGL063W 1113 nt15.56■□□□□ 0.08
SLI15P38283 YLR281CYLR281C 468 nt15.48■□□□□ 0.07
SLI15P38283 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.43■□□□□ 0.06
SLI15P38283 MRPL8YJL063C 717 nt15.39■□□□□ 0.05
SLI15P38283 YJR018WYJR018W 363 nt15.38■□□□□ 0.05
SLI15P38283 SAH1YER043C 1350 nt15.36■□□□□ 0.05
SLI15P38283 YJR120WYJR120W 351 nt15.32■□□□□ 0.04
SLI15P38283 WHI5YOR083W 888 nt15.29■□□□□ 0.04
SLI15P38283 RPP2BYDR382W 333 nt15.27■□□□□ 0.04
SLI15P38283 SSA3YBL075C 1950 nt15.25■□□□□ 0.03
SLI15P38283 PUN1YLR414C 792 nt15.24■□□□□ 0.03
SLI15P38283 Q0182Q0182 405 nt15.2■□□□□ 0.02
SLI15P38283 FMP45YDL222C 930 nt15.15■□□□□ 0.02
SLI15P38283 BDH2YAL061W 1254 nt15.13■□□□□ 0.01
SLI15P38283 YCH1YGR203W 447 nt15.09■□□□□ 0.01
SLI15P38283 UBX6YJL048C 1191 nt15.09■□□□□ 0.01
SLI15P38283 LSM3YLR438C-A 270 nt15.09■□□□□ 0.01
SLI15P38283 YPR011CYPR011C 981 nt15.09■□□□□ 0.01
SLI15P38283 ADO1YJR105W 1023 nt15.07■□□□□ 0
SLI15P38283 DSK2YMR276W 1122 nt15.06■□□□□ 0
SLI15P38283 PUT4YOR348C 1884 nt15.02■□□□□ -0
SLI15P38283 IMP2'YIL154C 1041 nt14.99□□□□□ -0.01
SLI15P38283 ARE1YCR048W 1833 nt14.99□□□□□ -0.01
SLI15P38283 YLR236CYLR236C 324 nt14.98□□□□□ -0.01
SLI15P38283 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.93□□□□□ -0.02
SLI15P38283 YEL076CYEL076C 651 nt14.93□□□□□ -0.02
SLI15P38283 YLR464WYLR464W 651 nt14.93□□□□□ -0.02
SLI15P38283 PTC2YER089C 1395 nt14.89□□□□□ -0.03
SLI15P38283 RTG1YOL067C 534 nt14.78□□□□□ -0.04
SLI15P38283 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.77□□□□□ -0.05
SLI15P38283 INM2YDR287W 879 nt14.76□□□□□ -0.05
SLI15P38283 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.75□□□□□ -0.05
SLI15P38283 SIS1YNL007C 1059 nt14.75□□□□□ -0.05
SLI15P38283 YBL100CYBL100C 315 nt14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms