RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W NDT80P38830 627 aa10.85□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W INP51P40559 946 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W DAP1Q12091 152 aa10.85□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W TAH18Q12181 623 aa10.85□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W RAD2P07276 1031 aa10.84□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W AZR1P50080 613 aa10.84□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W FOL1P53848 824 aa10.84□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W VPS30Q02948 557 aa10.84□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
YLR349WYLR349W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data10.83□□□□□ -0.68not detected
YLR349WYLR349W RIT1P23796 513 aa10.83□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W TIM23P32897 222 aa10.83□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W DUR3P33413 735 aa10.83□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W BRL1P38770 471 aa10.83□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W UFD2P54860 961 aa10.83□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W VPS45P38932 577 aa10.82□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W MRPS35P53292 345 aa10.82□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W TVP23P38962 199 aa10.81□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W SNA3P14359 133 aa10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W VID30P53076 958 aa10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W GUD1Q07729 489 aa10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W ATG11Q12527 1178 aa10.8□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W NUC1P08466 329 aa10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W SEC8P32855 1065 aa10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W OSH3P38713 996 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W HDA1P53973 706 aa10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W MSC2Q03455 724 aa10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W NUM1Q00402 2748 aa10.79□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W MYO3P36006 1272 aa10.78□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W RDH54P38086 958 aa10.78□□□□□ -0.68
YLR349WYLR349W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data10.78□□□□□ -0.68not detected
YLR349WYLR349W MET1P36150 593 aa10.77□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W POA1P38218 177 aa10.77□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W FMP10P40098 244 aa10.77□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W SWI6P09959 803 aa10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W ANP1P32629 500 aa10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W GUA1P38625 525 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W FMS1P50264 508 aa10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W INP52P50942 1183 aa10.76□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W URK1P27515 501 aa10.75□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W KTR1P27810 393 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W PES4P39684 611 aa10.75□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W DSF2P38213 736 aa10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W ALD5P40047 520 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W LIF1P53150 421 aa10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W YLL058WQ12198 575 aa10.74□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W OPI1P21957 404 aa10.73□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W SRP54P20424 541 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W CSM2P40465 213 aa10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W LSB1P53281 241 aa10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W RIF1P29539 1916 aa10.71□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W SPO74P45819 413 aa10.71□□□□□ -0.69
YLR349WYLR349W IDI1P15496 288 aa10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W UBP15P50101 1230 aa10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W MET13P53128 600 aa10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W YNL034WP53963 612 aa10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W YNL018CP53976 612 aa10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W KIN82P25341 720 aa10.69□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W SAD1P43589 448 aa10.69□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W YGR035CP53222 116 aa10.68□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W HEH2Q03281 663 aa10.68□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W TEL1P38110 2787 aa10.67□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W FUB1P25659 250 aa10.67□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W UGA4P32837 571 aa10.67□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W RFC1P38630 861 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W PNG1Q02890 363 aa10.67□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W AFT1P22149 690 aa10.66□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W MAK31P23059 88 aa10.66□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W MDM1Q01846 1127 aa10.66□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W YML020WQ03722 664 aa10.66□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W PRC1P00729 532 aa10.65□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W CDC16P09798 840 aa10.65□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W GPI13Q07830 1017 aa10.65□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
YLR349WYLR349W SMY2P32909 740 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W RER2P35196 286 aa10.64□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W OPT1P40897 799 aa10.64□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SKY1Q03656 742 aa10.64□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data10.63□□□□□ -0.71not detected
YLR349WYLR349W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W LCD1Q04377 747 aa10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W TFC6Q06339 672 aa10.63□□□□□ -0.71
YLR349WYLR349W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.4 ms