RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C HMLALPHA2P0CY09 210 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C SRS2P12954 1174 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C SRP54P20424 541 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ACE2P21192 770 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C AKR1P39010 764 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C VPS8P39702 1274 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ACA1P39970 489 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C NPA3P47122 385 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C SNU71P53207 620 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YLR407WQ06070 228 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C LAP2Q10740 671 aa6.62□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C HVG1P0CE11 249 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C KRS1P15180 591 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C SAM2P19358 384 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C STR2P47164 639 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C CTF18P49956 741 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C VPS20Q04272 221 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C GIN4Q12263 1142 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YOR111WQ99210 232 aa6.61□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C NUC1P08466 329 aa6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ETP1P38748 585 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C EPL1P43572 832 aa6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ISM1P48526 1002 aa6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C FOL1P53848 824 aa6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C VPS30Q02948 557 aa6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C FBP1P09201 348 aa6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YKE2P52553 114 aa6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ARP5P53946 755 aa6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C YPL150WQ12152 901 aa6.59□□□□□ -1.35
RRP4YHR069C ERG12P07277 443 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RNR3P21672 869 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MAL31P38156 614 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YHL017WP38745 532 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C PES4P39684 611 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ALG2P43636 503 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YJL007CP47080 104 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C DSE3Q08729 430 aa6.58□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C KEX2P13134 814 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BMH2P34730 273 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C OCT1P35999 772 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RPN10P38886 268 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C PCI8P40512 444 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ENT3P47160 408 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MDM1Q01846 1127 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YML037CQ03703 340 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SUE1Q06524 206 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ERF2Q06551 359 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C PSK2Q08217 1101 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C ELG1Q12050 791 aa6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MET6P05694 767 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CDC6P09119 513 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CBP3P21560 335 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C VPS1P21576 704 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MBR1P23493 339 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SCJ1P25303 377 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C IME2P32581 645 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RXT2P38255 430 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BSD2P38356 321 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C CSN12P47130 423 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C SOL4P53315 255 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C HRQ1Q05549 1077 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C UBX5Q06682 500 aa6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data6.55□□□□□ -1.36not detected
RRP4YHR069C HCA4P20448 770 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TOM71P38825 639 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C VPS45P38932 577 aa6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C NET1P47035 1189 aa6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RBA50Q04418 439 aa6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-DR4O74302 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-AP0CX57 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-ORP0CX59 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C RAD18P10862 487 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C PER1P25625 357 aa6.54□□□□□ -1.36
RRP4YHR069C TGL1P34163 548 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.2 ms