RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeastyeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1YHR064C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SAC6P32599 642 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RAD54P32863 898 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CNS1P33313 385 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SLD2P34252 453 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C BCD1P38772 366 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CTM1P38818 585 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C IOC3P43596 787 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C BOP3P53958 396 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C VAC14Q06708 880 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C HMI1Q12039 706 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C ATG9Q12142 997 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RRI2Q12348 645 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C OSH2Q12451 1283 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C GUT1P32190 709 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C YBL036CP38197 257 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C ATG23Q06671 453 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CEX1Q12453 761 aa5.92□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C POM152P39685 1337 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CDC6P09119 513 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C TIF1P10081 395 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SPO11P23179 398 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C AKR1P39010 764 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SEC9P40357 651 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C PXA1P41909 870 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C IRC8P47046 822 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RTC4P53850 401 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C MMR1Q06324 491 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C PPM2Q08282 695 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C AFT2Q08957 416 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C NBL1Q3E7Y6 73 aa5.91□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CDC37P06101 506 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C HCA4P20448 770 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C SRB4P32569 687 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C VRP1P37370 817 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C MAL31P38156 614 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C RGD1P38339 666 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C GLO3P38682 493 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C NUG1P40010 520 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C EFM4P40516 257 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C HUL4P40985 892 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C ALD2P47771 506 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C ERG5P54781 538 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C GDE1Q02979 1223 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C UTP5Q04177 643 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C NUR1Q12066 484 aa5.9□□□□□ -1.46
SSZ1YHR064C CYB2P00175 591 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SEC65P29478 273 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C HIR1P32479 840 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YET1P35723 206 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YGR237CP50089 785 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C CSC1Q06538 782 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C HAT1Q12341 374 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YOL098CQ12496 1037 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YRF1-3P0CX14 1859 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YRF1-7P0CX15 1859 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YRF1-6P53819 1859 aa5.89□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C COQ1P18900 473 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C CKI1P20485 582 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C DAK2P43550 591 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C ALG2P43636 503 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YGR273CP53329 174 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C ALG1P16661 449 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C RTG2P32608 588 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SER1P33330 395 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
SSZ1YHR064C RXT2P38255 430 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SPT8P38915 602 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C YLR287CQ05881 355 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C TFC6Q06339 672 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C PLP2Q12017 286 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C PTC5Q12511 572 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C ENT1Q12518 454 aa5.88□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C CDC8P00572 216 aa5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C ERG12P07277 443 aa5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C MTF2P10849 440 aa5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C VPS1P21576 704 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SSZ1YHR064C SMF1P38925 575 aa5.87□□□□□ -1.47
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