RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	BIK1	P11709	440 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	UTR2	P32623	467 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ELM1	P32801	640 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SPT23	P35210	1082 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPA14	P50106	137 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	PIP2	P52960	996 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RIM20	Q12033	661 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	HKR1	P41809	1802 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	PCT1	P13259	424 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RTS1	P38903	757 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	CWH41	P53008	833 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YPR097W	Q06839	1073 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	PCL8	Q08966	492 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	CLC1	P17891	233 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPB10	P22139	70 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SHC1	P39000	512 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ARH1	P48360	493 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ROM1	P53046	1155 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	GDE1	Q02979	1223 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	BDS1	Q08347	646 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ATG3	P40344	310 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	QDR1	P40475	563 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	APL6	P46682	809 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	JJJ2	P46997	583 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YGL082W	P53155	381 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	AGE1	Q04412	482 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	PEP3	P27801	918 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	BOL3	P39724	118 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TPM2	P40414	161 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YFH7	P43591	353 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MAD1	P40957	749 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MSN5	P52918	1224 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SPR28	Q04921	423 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ELG1	Q12050	791 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YPL150W	Q12152	901 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SRF1	Q12516	437 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	CYT1	P07143	309 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	KRE2	P27809	442 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MGM1	P32266	881 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	IME2	P32581	645 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SEC8	P32855	1065 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YKR018C	P36114	725 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MAL31	P38156	614 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TIP41	Q12199	356 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RAD61	Q99359	647 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MSP1	P28737	362 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	CTH1	P47976	325 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ZDS2	P54786	942 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	EST2	Q06163	884 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ATE1	P16639	503 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	MSM1	P22438	575 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	ROX1	P25042	368 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	BRN1	P38170	754 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	CLA4	P48562	842 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	SOL4	P53315	255 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TOS4	Q06266	489 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	THI3	Q07471	609 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YPL260W	Q08977	551 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TSC13	Q99190	310 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	YKU70	P32807	602 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TRS33	Q99394	268 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO41	YFL036W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	HAP4	P14064	554 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	PRI2	P20457	528 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	BUD6	P41697	788 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	MRPS35	P53292	345 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPO41	YFL036W	PER1	P25625	357 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.7 ms