RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C ACE2P21192 770 aa14.58□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD18P10862 487 aa14.57□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C UTR4P32626 227 aa14.57□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C BCS1P32839 456 aa14.57□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C YAF9P53930 226 aa14.57□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C RGT1P32862 1170 aa14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C OSH3P38713 996 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C RRP8P38961 392 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C ALD6P54115 500 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C BRE1Q07457 700 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C TUS1Q06412 1307 aa14.56□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C KTR1P27810 393 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS8P39702 1274 aa14.55□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C DBP1P24784 617 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C PRO3P32263 286 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C RFC1P38630 861 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C UBP9P39967 754 aa14.54□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C CDC19P00549 500 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C SAM1P10659 382 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C DLD1P32891 587 aa14.53□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C WHI3P34761 661 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C YKR018CP36114 725 aa14.53□□□□□ -0.08
tM(CAU)CtM(CAU)C KTR2P33550 425 aa14.52□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C TOM71P38825 639 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C CDC16P09798 840 aa14.51□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C YFL040WP43562 540 aa14.51□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C YGR125WP53273 1036 aa14.51□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C EAR1Q03212 550 aa14.51□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C OPI1P21957 404 aa14.5□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C MET1P36150 593 aa14.5□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C SHP1P34223 423 aa14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C STM1P39015 273 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C UFD2P54860 961 aa14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C FMP30Q02883 468 aa14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C SLD5Q03406 294 aa14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C TGL1P34163 548 aa14.48□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C PTK2P47116 818 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS29P38759 282 aa14.47□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C FOL1P53848 824 aa14.47□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C CSC1Q06538 782 aa14.47□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa14.47□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C HIP1P06775 603 aa14.46□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C RIT1P23796 513 aa14.46□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C SCS3P53012 380 aa14.46□□□□□ -0.09
tM(CAU)CtM(CAU)C YUR1P26725 428 aa14.45□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C MYO3P36006 1272 aa14.45□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C NOC2P39744 710 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C SKP2P42843 763 aa14.45□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C MIP1P15801 1254 aa14.44□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS30Q02948 557 aa14.44□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C NKP2Q06162 153 aa14.44□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C ANP1P32629 500 aa14.43□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C HDA1P53973 706 aa14.43□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C SPH1Q06160 661 aa14.43□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C SUE1Q06524 206 aa14.43□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C ERP3Q12403 225 aa14.43□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C PDC1P06169 563 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C NUC1P08466 329 aa14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS45P38932 577 aa14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C ISW2Q08773 1120 aa14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C ECM29P38737 1868 aa14.42□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C PES4P39684 611 aa14.41□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C AHC1Q12433 566 aa14.41□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C MCR1P36060 302 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C AVT3P36062 692 aa14.4□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM20Q12033 661 aa14.4□□□□□ -0.1
tM(CAU)CtM(CAU)C MCM4P30665 933 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C DBP7P36120 742 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C POX1P13711 748 aa14.38□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS53P47061 822 aa14.38□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa14.38□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C TKL1P23254 680 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR321CQ04898 105 aa14.37□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C TFC4P33339 1025 aa14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C REG2P38232 338 aa14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C NDT80P38830 627 aa14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C DAK1P54838 584 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C TRM11Q12463 433 aa14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C RKM4Q12504 494 aa14.36□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C RER2P35196 286 aa14.35□□□□□ -0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data14.35□□□□□ -0.11not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data14.34□□□□□ -0.11not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C SRP54P20424 541 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C AAP1P37898 856 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.7 ms