RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP4	YPR178W	HUL4	P40985	892 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PRP4	YPR178W	HMI1	Q12039	706 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PRP4	YPR178W	CTM1	P38818	585 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	VTC3	Q02725	835 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	CDC6	P09119	513 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	YET1	P35723	206 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	ERG5	P54781	538 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	CSC1	Q06538	782 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SPO11	P23179	398 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SPT8	P38915	602 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	VPS8	P39702	1274 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	PPM2	Q08282	695 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SWE1	P32944	819 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	CNS1	P33313	385 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	NPL4	P33755	580 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	BCD1	P38772	366 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	IRC8	P47046	822 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	MMR1	Q06324	491 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	POM152	P39685	1337 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SRB4	P32569	687 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	EFM4	P40516	257 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	ALD2	P47771	506 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	MTF2	P10849	440 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	ATG3	P40344	310 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	YGR237C	P50089	785 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	SFH1	Q06168	426 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	NUR1	Q12066	484 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PRP4	YPR178W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SMF1	P38925	575 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	MIC19	P43594	170 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	IOC3	P43596	787 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	GDE1	Q02979	1223 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PTC5	Q12511	572 aa		11.4	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	COQ1	P18900	473 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	YLR287C	Q05881	355 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	GEF1	P37020	779 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	YJR079W	P47126	109 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	TFC6	Q06339	672 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	YOR223W	Q12015	292 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	CEX1	Q12453	761 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	CKI1	P20485	582 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	HIR1	P32479	840 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RXT2	P38255	430 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RTC4	P53850	401 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	UFD2	P54860	961 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RMP1	Q12530	201 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	CDC8	P00572	216 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	TOP1	P04786	769 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RAD1	P06777	1100 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SPO12	P17123	173 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	RAD57	P25301	460 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	MAL31	P38156	614 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	NGL3	Q03210	505 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	STE23	Q06010	1027 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SWH1	P35845	1188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	VFA1	P40080	203 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	YAP5	P40574	245 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PXA1	P41909	870 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	ALG1	P16661	449 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PCI8	P40512	444 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	PSR2	Q07949	397 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PRP4	YPR178W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	GRX7	P38068	203 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	PTC4	P38089	393 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PRP4	YPR178W	DAK2	P43550	591 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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