RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	NPR3	P38742	1146 aa		9.44	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	EPL1	P43572	832 aa		9.44	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	SPL2	P38839	148 aa		9.43	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	UFD2	P54860	961 aa		9.43	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	UBX2	Q04228	584 aa		9.43	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	DIT2	P21595	489 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	MRPL10	P36520	322 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	IRC4	Q03036	179 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	SGD1	Q06132	899 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	PSF3	Q12146	194 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	SIT4	P20604	311 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	KRE2	P27809	442 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	TRS33	Q99394	268 aa		9.42	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	FIG2	P25653	1609 aa		9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	CBP3	P21560	335 aa		9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	MCM2	P29469	868 aa		9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	PFF1	P38244	976 aa		9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	GTT3	P39996	337 aa		9.41	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	YFH7	P43591	353 aa		9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
GGA2	YHR108W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	PMD1	P32634	1753 aa		9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	MDL2	P33311	773 aa		9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	AKR1	P39010	764 aa		9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	YPT11	P48559	417 aa		9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	CTR9	P89105	1077 aa		9.4	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	GPA1	P08539	472 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	YER130C	P39959	443 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	JJJ2	P46997	583 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	FAR11	P53917	953 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ATE1	P16639	503 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RRM3	P38766	723 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RTS1	P38903	757 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	PIP2	P52960	996 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ESC2	Q06340	456 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ISW2	Q08773	1120 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RGP1	P16664	663 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	YBL086C	P38177	466 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ERO1	Q03103	563 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	TFC6	Q06339	672 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ANP1	P32629	500 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	UGA2	P38067	497 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ALG2	P43636	503 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	SSL2	Q00578	843 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	CYC8	P14922	966 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	MAL31	P38156	614 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	GDE1	Q02979	1223 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	ASF1	P32447	279 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	MYO3	P36006	1272 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	HDA1	P53973	706 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	YPL260W	Q08977	551 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	DCS2	Q12123	353 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	RAD61	Q99359	647 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GGA2	YHR108W	SNF3	P10870	884 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	MAK31	P23059	88 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	GSY2	P27472	705 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	YHL050C	P38721	697 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	TIM50	Q02776	476 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	HKR1	P41809	1802 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	RIT1	P23796	513 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	CAB3	P36076	571 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	APL6	P46682	809 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	TOS4	Q06266	489 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	CSC1	Q06538	782 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	GRX6	Q12438	231 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	CDC6	P09119	513 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	RXT2	P38255	430 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	YOR111W	Q99210	232 aa		9.32	□□□□□ -0.92
GGA2	YHR108W	PRI1	P10363	409 aa		9.31	□□□□□ -0.92

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