RNA–Protein interactions for RNA: YHL025W

SNF6, Transcript of Subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex, yeast

Gene SNF6, Length 999 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNF6	YHL025W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	PPM2	Q08282	695 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	SRF1	Q12516	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	PEP3	P27801	918 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	APL6	P46682	809 aa		13.19	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	COQ1	P18900	473 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	13.18	□□□□□ -0.3	not detected
SNF6	YHL025W	PIP2	P52960	996 aa		13.18	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	PUS6	P53294	404 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	IMP2'	P32351	346 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	HVG1	P0CE11	249 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	VPS20	Q04272	221 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	FLO11	P08640	1367 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SNF6	YHL025W	FLO1	P32768	1537 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	SDH2	P21801	266 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	BSD2	P38356	321 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RTS1	P38903	757 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	SIS2	P36024	562 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	NPA3	P47122	385 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	UFD2	P54860	961 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RER2	P35196	286 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	YPL260W	Q08977	551 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	FBP26	P32604	452 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	VID28	P40547	921 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	NSG2	P53898	299 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	ARP5	P53946	755 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	ECM23	Q02710	187 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	CSR2	Q12734	1121 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	YHL050C	P38721	697 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	PNT1	P38969	423 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	YKE2	P52553	114 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	EST2	Q06163	884 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	YJL171C	P46992	396 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	PSK2	Q08217	1101 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SNF6	YHL025W	CBP1	P07252	654 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	TTI1	P36097	1038 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.08	□□□□□ -0.32	not detected
SNF6	YHL025W	YHL017W	P38745	532 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	CST9	Q06032	482 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	RAD61	Q99359	647 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	BIK1	P11709	440 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	MYO3	P36006	1272 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	CTF18	P49956	741 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	NCS6	P53088	359 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	ANP1	P32629	500 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	PCL8	Q08966	492 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	VID27	P40157	782 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	DJP1	P40564	432 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	MTC3	P53077	123 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	AAD16	Q02895	342 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	GSC2	P40989	1895 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	MPH3	P0CE00	602 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	BDH2	P39713	417 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	HRQ1	Q05549	1077 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	TFC6	Q06339	672 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	ELG1	Q12050	791 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	HST1	P53685	503 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	HDA1	P53973	706 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	YLR407W	Q06070	228 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SNF6	YHL025W	RIT1	P23796	513 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	MSP1	P28737	362 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	MAC1	P35192	417 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	PEX14	P53112	341 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	YPL150W	Q12152	901 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.01	□□□□□ -0.33	not detected
SNF6	YHL025W	MAK31	P23059	88 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	BUD6	P41697	788 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	ALG2	P43636	503 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SNF6	YHL025W	PRE8	P23639	250 aa		13	□□□□□ -0.33

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