RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	THI11	P47183	340 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RTF1	P53064	558 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	BTN2	P53286	410 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RNH1	Q04740	348 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	THI13	Q07748	340 aa		4.59	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SRM1	P21827	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MEF2	P39677	819 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	NUP82	P40368	713 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	BNA1	P47096	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SRB7	P47822	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	VID30	P53076	958 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YNL108C	P53929	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ARV1	Q06541	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ACE2	P21192	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MEF1	P25039	761 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	HIR1	P32479	840 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	IME2	P32581	645 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ATG19	P35193	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	CTR9	P89105	1077 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ERO1	Q03103	563 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PIN2	Q12057	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PET123	P17558	318 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MSH2	P25847	964 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TGL4	P36165	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YBL036C	P38197	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	FYV10	P40492	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	GYP7	P48365	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MTO1	P53070	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SND1	Q04007	877 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PPM2	Q08282	695 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	NYV1	Q12255	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ATP4	P05626	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	POL4	P25615	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TPD3	P31383	635 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RCR1	P38212	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RRF1	P38771	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
BCK2	YER167W	GGA1	Q06336	557 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	FRT1	Q99332	602 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PEP12	P32854	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RTG3	P38165	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MGE1	P38523	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TAT2	P38967	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	DPH6	Q12429	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
BCK2	YER167W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	GCD10	P41814	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YJR120W	P47157	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	COX6	P00427	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	HNM1	P19807	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TIM23	P32897	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SAP185	P40856	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	VTC2	P43585	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	HUL5	P53119	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RAD33	Q04231	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SWA2	Q06677	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ALR1	Q08269	859 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PGC1	Q08959	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	CIT1	P00890	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SWC3	P31376	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SSH4	P32343	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RTT105	P40063	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	IRR1	P40541	1150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MAD1	P40957	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	FPK1	P53739	893 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TMA17	Q12513	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MCM2	P29469	868 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TBS1	P38114	1094 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	EXO84	P38261	753 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ZDS2	P54786	942 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	TAP42	Q04372	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	MRPL25	P23369	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	PGS1	P25578	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	RPC37	P36121	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	ESL1	P40456	1118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BCK2	YER167W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.8 ms