Protein–RNA interactions for Protein: P23369

MRPL25, 54S ribosomal protein L25, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL25P23369 NSR1YGR159C 1245 nt20.79■□□□□ 0.92
MRPL25P23369 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.57■□□□□ 0.88
MRPL25P23369 NOP1YDL014W 984 nt19.9■□□□□ 0.78
MRPL25P23369 MDJ1YFL016C 1536 nt18.73■□□□□ 0.59
MRPL25P23369 YKL036CYKL036C 393 nt17.99■□□□□ 0.47
MRPL25P23369 SRX1YKL086W 384 nt17.36■□□□□ 0.37
MRPL25P23369 YJL027CYJL027C 417 nt17.31■□□□□ 0.36
MRPL25P23369 Q0297Q0297 156 nt17.26■□□□□ 0.35
MRPL25P23369 YCR051WYCR051W 669 nt16.44■□□□□ 0.22
MRPL25P23369 DBP2YNL112W 1641 nt16.42■□□□□ 0.22
MRPL25P23369 SCS3YGL126W 1143 nt16.15■□□□□ 0.18
MRPL25P23369 YBR190WYBR190W 312 nt16.12■□□□□ 0.17
MRPL25P23369 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.88■□□□□ 0.13
MRPL25P23369 RTC3YHR087W 336 nt15.75■□□□□ 0.11
MRPL25P23369 CCC1YLR220W 969 nt15.73■□□□□ 0.11
MRPL25P23369 YOL085CYOL085C 342 nt15.56■□□□□ 0.08
MRPL25P23369 RPP1BYDL130W 321 nt15.49■□□□□ 0.07
MRPL25P23369 RVS167YDR388W 1449 nt15.45■□□□□ 0.06
MRPL25P23369 PKP1YIL042C 1185 nt15.36■□□□□ 0.05
MRPL25P23369 SCJ1YMR214W 1134 nt15.19■□□□□ 0.02
MRPL25P23369 SSA3YBL075C 1950 nt14.91□□□□□ -0.02
MRPL25P23369 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.91□□□□□ -0.02
MRPL25P23369 PUT4YOR348C 1884 nt14.88□□□□□ -0.03
MRPL25P23369 PET122YER153C 765 nt14.81□□□□□ -0.04
MRPL25P23369 SHR5YOL110W 714 nt14.79□□□□□ -0.04
MRPL25P23369 SCR1SCR1 522 nt14.63□□□□□ -0.07
MRPL25P23369 URN1YPR152C 1398 nt14.6□□□□□ -0.07
MRPL25P23369 ARE1YCR048W 1833 nt14.5□□□□□ -0.09
MRPL25P23369 DEP1YAL013W 1218 nt14.46□□□□□ -0.09
MRPL25P23369 OPI9YLR338W 858 nt14.45□□□□□ -0.1
MRPL25P23369 YDJ1YNL064C 1230 nt14.44□□□□□ -0.1
MRPL25P23369 SAH1YER043C 1350 nt14.44□□□□□ -0.1
MRPL25P23369 POA1YBR022W 534 nt14.39□□□□□ -0.11
MRPL25P23369 RRN5YLR141W 1092 nt14.36□□□□□ -0.11
MRPL25P23369 ATS1YAL020C 1002 nt14.35□□□□□ -0.11
MRPL25P23369 RPN10YHR200W 807 nt14.34□□□□□ -0.11
MRPL25P23369 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.32□□□□□ -0.12
MRPL25P23369 YNL208WYNL208W 600 nt14.24□□□□□ -0.13
MRPL25P23369 GAR1YHR089C 618 nt14.17□□□□□ -0.14
MRPL25P23369 BSC6YOL137W 1494 nt14.13□□□□□ -0.15
MRPL25P23369 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.06□□□□□ -0.16
MRPL25P23369 PUN1YLR414C 792 nt14.05□□□□□ -0.16
MRPL25P23369 BUD23YCR047C 828 nt13.98□□□□□ -0.17
MRPL25P23369 RSB1YOR049C 1065 nt13.97□□□□□ -0.17
MRPL25P23369 PTC2YER089C 1395 nt13.92□□□□□ -0.18
MRPL25P23369 YJR018WYJR018W 363 nt13.91□□□□□ -0.18
MRPL25P23369 NAB2YGL122C 1578 nt13.82□□□□□ -0.2
MRPL25P23369 SPT5YML010W 3192 nt13.72□□□□□ -0.21
MRPL25P23369 TIR1YER011W 765 nt13.72□□□□□ -0.21
MRPL25P23369 SSA1YAL005C 1929 nt13.6□□□□□ -0.23
MRPL25P23369 RPP2BYDR382W 333 nt13.57□□□□□ -0.24
MRPL25P23369 DAL1YIR027C 1383 nt13.55□□□□□ -0.24
MRPL25P23369 YJR120WYJR120W 351 nt13.53□□□□□ -0.24
MRPL25P23369 FIS1YIL065C 468 nt13.52□□□□□ -0.25
MRPL25P23369 FPR4YLR449W 1179 nt13.51□□□□□ -0.25
MRPL25P23369 INM2YDR287W 879 nt13.48□□□□□ -0.25
MRPL25P23369 SSA4YER103W 1929 nt13.41□□□□□ -0.26
MRPL25P23369 PHO4YFR034C 939 nt13.4□□□□□ -0.26
MRPL25P23369 PST2YDR032C 597 nt13.35□□□□□ -0.27
MRPL25P23369 MEP2YNL142W 1500 nt13.32□□□□□ -0.28
MRPL25P23369 YPS1YLR120C 1710 nt13.28□□□□□ -0.28
MRPL25P23369 YBL100CYBL100C 315 nt13.27□□□□□ -0.29
MRPL25P23369 SRB2YHR041C 633 nt13.23□□□□□ -0.29
MRPL25P23369 BDH2YAL061W 1254 nt13.21□□□□□ -0.29
MRPL25P23369 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.17□□□□□ -0.3
MRPL25P23369 YDR095CYDR095C 411 nt13.13□□□□□ -0.31
MRPL25P23369 FUN26YAL022C 1554 nt13.09□□□□□ -0.31
MRPL25P23369 DCW1YKL046C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
MRPL25P23369 TRM9YML014W 840 nt13.04□□□□□ -0.32
MRPL25P23369 WWM1YFL010C 636 nt13.03□□□□□ -0.32
MRPL25P23369 ALF1YNL148C 765 nt13.01□□□□□ -0.33
MRPL25P23369 LSM3YLR438C-A 270 nt12.98□□□□□ -0.33
MRPL25P23369 YMR090WYMR090W 684 nt12.94□□□□□ -0.34
MRPL25P23369 EMI2YDR516C 1503 nt12.93□□□□□ -0.34
MRPL25P23369 BDF1YLR399C 2061 nt12.92□□□□□ -0.34
MRPL25P23369 RPP2AYOL039W 321 nt12.91□□□□□ -0.34
MRPL25P23369 CCT6YDR188W 1641 nt12.9□□□□□ -0.34
MRPL25P23369 YGR021WYGR021W 873 nt12.89□□□□□ -0.35
MRPL25P23369 SHU1YHL006C 453 nt12.88□□□□□ -0.35
MRPL25P23369 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.86□□□□□ -0.35
MRPL25P23369 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.86□□□□□ -0.35
MRPL25P23369 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.86□□□□□ -0.35
MRPL25P23369 PTP1YDL230W 1008 nt12.83□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 SIS1YNL007C 1059 nt12.8□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 CAC2YML102W 1407 nt12.79□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 YDL221WYDL221W 552 nt12.79□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.79□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 YBR220CYBR220C 1683 nt12.79□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 HOM6YJR139C 1080 nt12.78□□□□□ -0.36
MRPL25P23369 TAT1YBR069C 1860 nt12.74□□□□□ -0.37
MRPL25P23369 SDH1YKL148C 1923 nt12.72□□□□□ -0.37
MRPL25P23369 YKL097CYKL097C 411 nt12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms