RNA–Protein interactions for RNA: YER167W

BCK2, Transcript of Serine/threonine-rich protein involved in PKC1 signaling pathway, yeast

Gene BCK2, Length 2,556 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK2	YER167W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
BCK2	YER167W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
BCK2	YER167W	TFA1	P36100	482 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BCK2	YER167W	TAF7	Q05021	590 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BCK2	YER167W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
BCK2	YER167W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
BCK2	YER167W	LEO1	P38439	464 aa		6.16	□□□□□ -1.42
BCK2	YER167W	DMA1	P38823	416 aa		6.16	□□□□□ -1.42
BCK2	YER167W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
BCK2	YER167W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
BCK2	YER167W	IOC4	Q04213	475 aa		5.96	□□□□□ -1.46
BCK2	YER167W	AVT3	P36062	692 aa		5.95	□□□□□ -1.46
BCK2	YER167W	IFH1	P39520	1085 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BCK2	YER167W	AIM44	Q99299	758 aa		5.82	□□□□□ -1.48
BCK2	YER167W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
BCK2	YER167W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
BCK2	YER167W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
BCK2	YER167W	LEU3	P08638	886 aa		5.68	□□□□□ -1.5
BCK2	YER167W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
BCK2	YER167W	DMA2	P53924	522 aa		5.67	□□□□□ -1.5
BCK2	YER167W	SIS2	P36024	562 aa		5.66	□□□□□ -1.5
BCK2	YER167W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
BCK2	YER167W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
BCK2	YER167W	TOP1	P04786	769 aa		5.6	□□□□□ -1.51
BCK2	YER167W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
BCK2	YER167W	RLF2	Q12495	606 aa		5.56	□□□□□ -1.52
BCK2	YER167W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
BCK2	YER167W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
BCK2	YER167W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	MDG1	P53885	366 aa		5.44	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	MNN4	P36044	1178 aa		5.43	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	BRL1	P38770	471 aa		5.43	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	PTP3	P40048	928 aa		5.42	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	SWE1	P32944	819 aa		5.41	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
BCK2	YER167W	YML020W	Q03722	664 aa		5.39	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	ATG36	P46983	293 aa		5.38	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.37	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	CAB3	P36076	571 aa		5.35	□□□□□ -1.55
BCK2	YER167W	LAM6	Q08001	693 aa		5.32	□□□□□ -1.56
BCK2	YER167W	TPO2	P53283	614 aa		5.3	□□□□□ -1.56
BCK2	YER167W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
BCK2	YER167W	VPS72	Q03388	795 aa		5.3	□□□□□ -1.56
BCK2	YER167W	CKB1	P43639	278 aa		5.29	□□□□□ -1.56
BCK2	YER167W	ASF1	P32447	279 aa		5.27	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	RTS3	P53289	263 aa		5.26	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	FAR11	P53917	953 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	TOA1	P32773	286 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	SLX8	P40072	274 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.25	□□□□□ -1.57	not detected
BCK2	YER167W	HIF1	Q12373	385 aa		5.25	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	BRN1	P38170	754 aa		5.23	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	YJR008W	P47085	338 aa		5.23	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	OSW7	P43611	510 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	SPC42	P36094	363 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BCK2	YER167W	PSH1	Q12161	406 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	SSP1	P38871	571 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	ISW1	P38144	1129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	DOS2	P54858	310 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	YTA7	P40340	1379 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	GEF1	P37020	779 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	MRX12	P47084	519 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	PDR1	P12383	1068 aa		5.16	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
BCK2	YER167W	MET10	P39692	1035 aa		5.15	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.12	□□□□□ -1.59	not detected
BCK2	YER167W	NHA1	Q99271	985 aa		5.12	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	MAM3	Q12296	706 aa		5.11	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	AIM21	P40563	679 aa		5.1	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
BCK2	YER167W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	OCA5	P38738	679 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	UBX5	Q06682	500 aa		5.08	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	DAL5	P15365	543 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	RRN6	P32786	894 aa		5.07	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	KIN1	P13185	1064 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	GAL11	P19659	1081 aa		5.06	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	YAF9	P53930	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	TLG1	Q03322	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
BCK2	YER167W	RAD2	P07276	1031 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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