RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP31,21■■■□□ 2,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP31,21■■■□□ 2,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa31,21■■■□□ 2,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Washc2Q6PGL7 1334 aa31,21■■■□□ 2,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc52a2Q9D8F3 450 aa31,2■■■□□ 2,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP31,2■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GnpatP98192 678 aa31,19■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Q3UJC8 639 aa31,19■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stk26Q99JT2 416 aa31,19■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP31,16■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc10Q8R4P9 1501 aa31,15■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kcna6Q61923 529 aa31,15■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Usp32F8VPZ3 1604 aa31,15■■■□□ 2,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tulp4Q9JIL5 1547 aa31,14■■■□□ 2,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Farp2Q91VS8 1065 aa31,13■■■□□ 2,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccer2J3QPU5 274 aa31,1■■■□□ 2,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 C5P06684 1680 aa31,07■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rock1P70335 1354 aa31,06■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Emilin2Q8K482 1074 aa31,06■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm2aP59997 1161 aa31,05■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Als2Q920R0 1651 aa31,05■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep170bQ80U49 1574 aa31,05■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP31,03■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fan1Q69ZT1 1020 aa31,03■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP31,02■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa31,01■■■□□ 2,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adamts13Q769J6 1426 aa31,01■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smim5Q8BT42 78 aa31,01■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Os9Q8K2C7 672 aa31■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tex14Q7M6U3 1450 aa30,99■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif1aP33173 1695 aa30,99■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Camta1A2A891 1682 aa30,97■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa30,97■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 MpndQ3TV65 487 aa30,97■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP30,97■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc7Q80TE7 1490 aa30,96■■■□□ 2,55
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tmem2Q5FWI3 1383 aa30,94■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plekhg1F6S200 1446 aa30,93■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP30,93■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam135bQ9DAI6 1403 aa30,91■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Idi1P58044 227 aa30,9■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rgl3Q3UYI5 709 aa30,9■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rgs17Q9QZB0 210 aa30,9■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm20521D3Z5F7 333 aa30,89■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sox12Q04890 314 aa30,89■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP30,89■■■□□ 2,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp7bQ64446 1462 aa30,88■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP30,87■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa30,85■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Acsbg1Q99PU5 721 aa30,85■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca14E9Q8F8 1683 aa30,84■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eno4Q8C042 619 aa30,84■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP30,84■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp10bB1AWN4 1474 aa30,82■■■□□ 2,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Usp47Q8BY87 1376 aa30,81■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col22a1E9Q7P1 1613 aa30,8■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ildr2B5TVM2 661 aa30,8■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 InhbeO08717 350 aa30,8■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa30,79■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cadps2Q8BYR5 1297 aa30,78■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 IqubQ8CDK3 788 aa30,77■■■□□ 2,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NgefQ8CHT1 710 aa30,75■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ap3b2Q9JME5 1082 aa30,73■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr17E9Q271 1322 aa30,73■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP30,73■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mink1Q9JM52 1308 aa30,73■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP30,71■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abca15E9PWH4 1668 aa30,71■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stag3O70576 1240 aa30,7■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sirt1Q923E4 737 aa30,7■■■□□ 2,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtpruB1AUH1 1446 aa30,7■■■□□ 2,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP30,7■■■□□ 2,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Psrc1Q9D0P7 329 aa30,65■■■□□ 2,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP30,65■■■□□ 2,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Usp40Q8BWR4 1235 aa30,62■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Polr3aB2RXC6 1390 aa30,62■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dixdc1Q80Y83 711 aa30,61■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa30,58■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eid3Q3V124 375 aa30,58■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf316Q6PGE4 1016 aa30,58■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nrxn1Q9CS84 1514 aa30,57■■■□□ 2,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa30,57■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slc35g1Q8BY79 368 aa30,57■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mon2Q80TL7 1715 aa30,56■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP30,56■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa30,55■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fyb1O35601 819 aa30,54■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tnks1bp1P58871 1720 aa30,53■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa30,53■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Shank2Q80Z38 1476 aa30,51■■■□□ 2,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdk19Q8BWD8 501 aa30,51■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP30,5■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nfat5Q9WV30 1534 aa30,5■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ltbp1Q8CG19 1712 aa30,49■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc6D3YZP9 469 aa30,48■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col16a1Q8BLX7 1580 aa30,48■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa30,47■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP30,47■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ZgpatQ8VDM1 511 aa30,47■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nphp4P59240 1425 aa30,47■■■□□ 2,47
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