Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.25■■■■■ 6.44
Ccer2J3QPU5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Ccer2J3QPU5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Ccer2J3QPU5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Ccer2J3QPU5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Ccer2J3QPU5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.79■■■■■ 5.4
Ccer2J3QPU5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.32■■■■■ 5.33
Ccer2J3QPU5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.82■■■■■ 5.25
Ccer2J3QPU5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.66■■■■■ 5.22
Ccer2J3QPU5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
Ccer2J3QPU5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Ccer2J3QPU5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Ccer2J3QPU5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
Ccer2J3QPU5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Ccer2J3QPU5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Ccer2J3QPU5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
Ccer2J3QPU5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Ccer2J3QPU5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Ccer2J3QPU5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Ccer2J3QPU5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Ccer2J3QPU5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Ccer2J3QPU5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Ccer2J3QPU5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Ccer2J3QPU5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.18■■■■■ 4.82
Ccer2J3QPU5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ccer2J3QPU5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ccer2J3QPU5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Ccer2J3QPU5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45■■■■■ 4.79
Ccer2J3QPU5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Ccer2J3QPU5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
Ccer2J3QPU5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
Ccer2J3QPU5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Ccer2J3QPU5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Ccer2J3QPU5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Ccer2J3QPU5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Ccer2J3QPU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Ccer2J3QPU5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Ccer2J3QPU5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Ccer2J3QPU5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Ccer2J3QPU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Ccer2J3QPU5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Ccer2J3QPU5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Ccer2J3QPU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
Ccer2J3QPU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Ccer2J3QPU5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Ccer2J3QPU5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Ccer2J3QPU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
Ccer2J3QPU5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Ccer2J3QPU5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Ccer2J3QPU5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Ccer2J3QPU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Ccer2J3QPU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Ccer2J3QPU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Ccer2J3QPU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Ccer2J3QPU5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Ccer2J3QPU5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Ccer2J3QPU5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Ccer2J3QPU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Ccer2J3QPU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
Ccer2J3QPU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Ccer2J3QPU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Ccer2J3QPU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Ccer2J3QPU5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
Ccer2J3QPU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Ccer2J3QPU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Ccer2J3QPU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.38■■■■■ 4.37
Ccer2J3QPU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Ccer2J3QPU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ccer2J3QPU5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Ccer2J3QPU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Ccer2J3QPU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Ccer2J3QPU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
Ccer2J3QPU5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccer2J3QPU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ccer2J3QPU5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ccer2J3QPU5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ccer2J3QPU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Ccer2J3QPU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccer2J3QPU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccer2J3QPU5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Ccer2J3QPU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccer2J3QPU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Ccer2J3QPU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccer2J3QPU5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccer2J3QPU5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ccer2J3QPU5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccer2J3QPU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccer2J3QPU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Ccer2J3QPU5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Ccer2J3QPU5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccer2J3QPU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Ccer2J3QPU5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Ccer2J3QPU5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Ccer2J3QPU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Ccer2J3QPU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Ccer2J3QPU5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Ccer2J3QPU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Ccer2J3QPU5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Ccer2J3QPU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Ccer2J3QPU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms