RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49,92■■■■■ 5,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NischQ80TM9 1593 aa48,94■■■■■ 5,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc8B2RUS7 1588 aa47,49■■■■■ 5,19
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc9P70170 1546 aa47,27■■■■■ 5,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 ScribQ80U72 1612 aa46,23■■■■■ 4,99
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NacadQ5SWP3 1504 aa44,63■■■■■ 4,73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kdm5dQ62240 1548 aa44,5■■■■■ 4,71
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43,79■■■■■ 4,6
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dcaf1Q80TR8 1506 aa43,53■■■■■ 4,56
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BicraF8VPZ9 1578 aa43,34■■■■■ 4,53
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa43,09■■■■■ 4,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa42,61■■■■■ 4,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP42,2■■■■■ 4,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP42,14■■■■■ 4,34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Baz1aO88379 1555 aa41,94■■■■■ 4,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41,9■■■■■ 4,3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41,88■■■■■ 4,29
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41,67■■■■■ 4,26
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rhox8Q6VSS7 320 aa41,61■■■■■ 4,25
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa41,45■■■■■ 4,23
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP41,43■■■■■ 4,22
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ercc6F8VPZ5 1481 aa41,29■■■■■ 4,2
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smarca2Q6DIC0 1577 aa41,16■■■■■ 4,18
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,11■■■■■ 4,17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam135aQ6NS59 1506 aa41,03■■■■■ 4,16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40,99■■■■■ 4,15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40,8■■■■■ 4,12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40,72■■■■■ 4,11
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40,67■■■■■ 4,1
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40,58■■■■■ 4,09
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Baz1bQ9Z277 1479 aa40,5■■■■■ 4,07
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubl4bQ9CQ84 188 aa40,26■■■■■ 4,04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,22■■■■■ 4,03
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mrc2Q64449 1479 aa40,06■■■■■ 4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa39,75■■■■□ 3,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CftrP26361 1476 aa39,74■■■■□ 3,95
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnajc5P60904 198 aa39,62■■■■□ 3,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Synj1Q8CHC4 1574 aa39,61■■■■□ 3,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rtl1Q7M732 1744 aa39,57■■■■□ 3,93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Trim41Q5NCC3 630 aa39,44■■■■□ 3,9
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP39,43■■■■□ 3,9
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa39,3■■■■□ 3,88
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cux2P70298 1426 aa39,11■■■■□ 3,85
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39,1■■■■□ 3,85
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39,03■■■■□ 3,84
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39,02■■■■□ 3,84
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP38,99■■■■□ 3,83
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif15Q6P9L6 1387 aa38,98■■■■□ 3,83
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lamc3Q9R0B6 1581 aa38,75■■■■□ 3,79
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP38,7■■■■□ 3,79
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38,66■■■■□ 3,78
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Shroom2A2ALU4 1481 aa38,56■■■■□ 3,76
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep164Q5DU05 1446 aa38,47■■■■□ 3,75
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38,34■■■■□ 3,73
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plb1Q3TTY0 1478 aa38,24■■■■□ 3,71
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38,23■■■■□ 3,71
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col17a1Q07563 1470 aa38,17■■■■□ 3,7
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc18Q640L5 1455 aa38,15■■■■□ 3,7
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TnnQ80Z71 1560 aa38,12■■■■□ 3,69
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Il27Q8K3I6 234 aa38,12■■■■□ 3,69
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,09■■■■□ 3,69
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP38,07■■■■□ 3,68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38,06■■■■□ 3,68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Top2bQ64511 1612 aa38,05■■■■□ 3,68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Camsap1A2AHC3 1581 aa37,98■■■■□ 3,67
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rusc2Q80U22 1514 aa37,87■■■■□ 3,65
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ift140E9PY46 1464 aa37,86■■■■□ 3,65
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Golga3P55937 1487 aa37,81■■■■□ 3,64
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37,78■■■■□ 3,64
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37,75■■■■□ 3,63
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cngb1E1AZ71 1325 aa37,67■■■■□ 3,62
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37,64■■■■□ 3,62
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Duox2A2AQ99 1517 aa37,61■■■■□ 3,61
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37,54■■■■□ 3,6
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fmn1Q05860 1466 aa37,53■■■■□ 3,6
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Disp1Q3TDN0 1521 aa37,51■■■■□ 3,59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37,39■■■■□ 3,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grin2bQ01097 1482 aa37,39■■■■□ 3,58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37,35■■■■□ 3,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37,33■■■■□ 3,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Samd9lQ69Z37 1561 aa37,33■■■■□ 3,57
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Efcab5A0JP43 1406 aa37,18■■■■□ 3,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adgrl3Q80TS3 1537 aa37,14■■■■□ 3,54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37,07■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37,07■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtprkP35822 1457 aa37,06■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37,04■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37,04■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fgd6Q69ZL1 1399 aa37,04■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grin2aP35436 1464 aa37,02■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep170Q6A065 1588 aa37,02■■■■□ 3,52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37■■■■□ 3,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36,97■■■■□ 3,51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm156Q58A37 223 aa36,93■■■■□ 3,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36,92■■■■□ 3,5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtprtQ99M80 1454 aa36,83■■■■□ 3,49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NrkQ9R0G8 1455 aa36,8■■■■□ 3,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AknaQ80VW7 1404 aa36,76■■■■□ 3,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc1O35379 1528 aa36,76■■■■□ 3,48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36,71■■■■□ 3,47
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