RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa49.92■■■■■ 5.58
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43.79■■■■■ 4.6
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 BicraF8VPZ9 1578 aa43.34■■■■■ 4.53
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc180J3QNE4 1664 aa41.9■■■■■ 4.3
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Crybg2B7ZCC2 1516 aa41.88■■■■■ 4.29
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ercc6F8VPZ5 1481 aa41.29■■■■■ 4.2
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fam135aQ6NS59 1506 aa41.03■■■■■ 4.16
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa40.99■■■■■ 4.15
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa40.8■■■■■ 4.12
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40.72■■■■■ 4.11
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40.67■■■■■ 4.1
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubl4bQ9CQ84 188 aa40.26■■■■■ 4.04
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40.22■■■■■ 4.03
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Synj1Q8CHC4 1574 aa39.61■■■■□ 3.93
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rtl1Q7M732 1744 aa39.57■■■■□ 3.93
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa39.3■■■■□ 3.88
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cux2P70298 1426 aa39.11■■■■□ 3.85
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa39.1■■■■□ 3.85
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39.02■■■■□ 3.84
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif15Q6P9L6 1387 aa38.98■■■■□ 3.83
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Plb1Q3TTY0 1478 aa38.24■■■■□ 3.71
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Col17a1Q07563 1470 aa38.17■■■■□ 3.7
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc18Q640L5 1455 aa38.15■■■■□ 3.7
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Il27Q8K3I6 234 aa38.12■■■■□ 3.69
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Crocc2F6XLV1 1638 aa38.09■■■■□ 3.69
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Top2bQ64511 1612 aa38.05■■■■□ 3.68
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Camsap1A2AHC3 1581 aa37.98■■■■□ 3.67
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rusc2Q80U22 1514 aa37.87■■■■□ 3.65
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ift140E9PY46 1464 aa37.86■■■■□ 3.65
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Golga3P55937 1487 aa37.81■■■■□ 3.64
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cngb1E1AZ71 1325 aa37.67■■■■□ 3.62
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Duox2A2AQ99 1517 aa37.61■■■■□ 3.61
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37.54■■■■□ 3.6
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fmn1Q05860 1466 aa37.53■■■■□ 3.6
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Disp1Q3TDN0 1521 aa37.51■■■■□ 3.59
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grin2bQ01097 1482 aa37.39■■■■□ 3.58
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Samd9lQ69Z37 1561 aa37.33■■■■□ 3.57
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Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adgrl3Q80TS3 1537 aa37.14■■■■□ 3.54
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa37.07■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37.07■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtprkP35822 1457 aa37.06■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa37.04■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fgd6Q69ZL1 1399 aa37.04■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Grin2aP35436 1464 aa37.02■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cep170Q6A065 1588 aa37.02■■■■□ 3.52
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37■■■■□ 3.51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa36.97■■■■□ 3.51
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm156Q58A37 223 aa36.93■■■■□ 3.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa36.92■■■■□ 3.5
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PtprtQ99M80 1454 aa36.83■■■■□ 3.49
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NrkQ9R0G8 1455 aa36.8■■■■□ 3.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 AknaQ80VW7 1404 aa36.76■■■■□ 3.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Abcc1O35379 1528 aa36.76■■■■□ 3.48
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gpatch8A2A6A1 1505 aa36.71■■■■□ 3.47
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