Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,04■■■■■ 6,4
Tulp4Q9JIL5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,97■■■■■ 5,75
Tulp4Q9JIL5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,95■■■■■ 5,59
Tulp4Q9JIL5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48,14■■■■■ 5,3
Tulp4Q9JIL5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,88■■■■■ 5,26
Tulp4Q9JIL5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47,27■■■■■ 5,16
Tulp4Q9JIL5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,26■■■■■ 5,16
Tulp4Q9JIL5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,51■■■■■ 5,04
Tulp4Q9JIL5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,48■■■■■ 5,03
Tulp4Q9JIL5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,32■■■■■ 5,01
Tulp4Q9JIL5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,87■■■■■ 4,93
Tulp4Q9JIL5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,87■■■■■ 4,93
Tulp4Q9JIL5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,72■■■■■ 4,91
Tulp4Q9JIL5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,61■■■■■ 4,89
Tulp4Q9JIL5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
Tulp4Q9JIL5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,7■■■■■ 4,75
Tulp4Q9JIL5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44,49■■■■■ 4,71
Tulp4Q9JIL5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,44■■■■■ 4,7
Tulp4Q9JIL5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Tulp4Q9JIL5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,24■■■■■ 4,67
Tulp4Q9JIL5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44,21■■■■■ 4,67
Tulp4Q9JIL5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Tulp4Q9JIL5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,91■■■■■ 4,62
Tulp4Q9JIL5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,89■■■■■ 4,62
Tulp4Q9JIL5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,84■■■■■ 4,61
Tulp4Q9JIL5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,82■■■■■ 4,61
Tulp4Q9JIL5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,77■■■■■ 4,6
Tulp4Q9JIL5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Tulp4Q9JIL5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43,68■■■■■ 4,58
Tulp4Q9JIL5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,57
Tulp4Q9JIL5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,58■■■■■ 4,57
Tulp4Q9JIL5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
Tulp4Q9JIL5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43,46■■■■■ 4,55
Tulp4Q9JIL5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,44■■■■■ 4,54
Tulp4Q9JIL5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Tulp4Q9JIL5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,22■■■■■ 4,51
Tulp4Q9JIL5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Tulp4Q9JIL5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Tulp4Q9JIL5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,64■■■■■ 4,42
Tulp4Q9JIL5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,36■■■■■ 4,37
Tulp4Q9JIL5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Tulp4Q9JIL5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,28■■■■■ 4,36
Tulp4Q9JIL5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Tulp4Q9JIL5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Tulp4Q9JIL5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Tulp4Q9JIL5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42,16■■■■■ 4,34
Tulp4Q9JIL5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
Tulp4Q9JIL5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,04■■■■■ 4,32
Tulp4Q9JIL5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4,31
Tulp4Q9JIL5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,94■■■■■ 4,3
Tulp4Q9JIL5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Tulp4Q9JIL5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
Tulp4Q9JIL5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,7■■■■■ 4,27
Tulp4Q9JIL5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41,67■■■■■ 4,26
Tulp4Q9JIL5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41,5■■■■■ 4,23
Tulp4Q9JIL5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Tulp4Q9JIL5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Tulp4Q9JIL5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
Tulp4Q9JIL5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,37■■■■■ 4,21
Tulp4Q9JIL5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Tulp4Q9JIL5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Tulp4Q9JIL5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
Tulp4Q9JIL5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Tulp4Q9JIL5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Tulp4Q9JIL5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41,12■■■■■ 4,17
Tulp4Q9JIL5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Tulp4Q9JIL5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41,02■■■■■ 4,16
Tulp4Q9JIL5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Tulp4Q9JIL5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,94■■■■■ 4,14
Tulp4Q9JIL5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Tulp4Q9JIL5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Tulp4Q9JIL5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Tulp4Q9JIL5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,88■■■■■ 4,13
Tulp4Q9JIL5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Tulp4Q9JIL5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Tulp4Q9JIL5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Tulp4Q9JIL5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Tulp4Q9JIL5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Tulp4Q9JIL5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Tulp4Q9JIL5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Tulp4Q9JIL5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Tulp4Q9JIL5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Tulp4Q9JIL5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Tulp4Q9JIL5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Tulp4Q9JIL5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Tulp4Q9JIL5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40,5■■■■■ 4,07
Tulp4Q9JIL5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Tulp4Q9JIL5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Tulp4Q9JIL5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40,38■■■■■ 4,05
Tulp4Q9JIL5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Tulp4Q9JIL5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,34■■■■■ 4,05
Tulp4Q9JIL5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,33■■■■■ 4,05
Tulp4Q9JIL5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,04
Tulp4Q9JIL5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Tulp4Q9JIL5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Tulp4Q9JIL5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Tulp4Q9JIL5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Tulp4Q9JIL5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40,23■■■■■ 4,03
Tulp4Q9JIL5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Tulp4Q9JIL5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40,05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms