RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075017.4

Vpreb1-201, Transcript of Immunoglobulin iota chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NinlQ6ZQ12 1394 aa24.61■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MaddQ80U28 1577 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rims1Q99NE5 1463 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rock1P70335 1354 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zranb1Q7M760 708 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zfp142G5E869 1843 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 DccP70211 1447 aa24.6■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 C3P01027 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm20521D3Z5F7 333 aa24.57■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rgl3Q3UYI5 709 aa24.57■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa24.55■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Emilin2Q8K482 1074 aa24.55■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa24.55■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Siglec1Q62230 1695 aa24.54■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tulp4Q9JIL5 1547 aa24.53■■□□□ 1.52
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrp6O88572 1613 aa24.5■■□□□ 1.51
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sox12Q04890 314 aa24.49■■□□□ 1.51
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 IqubQ8CDK3 788 aa24.49■■□□□ 1.51
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa24.47■■□□□ 1.51
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abcc10Q8R4P9 1501 aa24.45■■□□□ 1.51
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp47Q8BY87 1376 aa24.45■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Smim5Q8BT42 78 aa24.44■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrrc7Q80TE7 1490 aa24.44■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Plekhg1F6S200 1446 aa24.43■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Adamts13Q769J6 1426 aa24.42■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cep170bQ80U49 1574 aa24.42■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa24.41■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stag3O70576 1240 aa24.41■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 NgefQ8CHT1 710 aa24.41■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa24.41■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Idi1P58044 227 aa24.4■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tmem2Q5FWI3 1383 aa24.4■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Wnk3Q80XP9 1757 aa24.39■■□□□ 1.5
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 MpndQ3TV65 487 aa24.39■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Acsbg1Q99PU5 721 aa24.39■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ap3b2Q9JME5 1082 aa24.39■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp32F8VPZ3 1604 aa24.38■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eid3Q3V124 375 aa24.36■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Tex14Q7M6U3 1450 aa24.36■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mink1Q9JM52 1308 aa24.35■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cadps2Q8BYR5 1297 aa24.33■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sirt1Q923E4 737 aa24.33■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 C5P06684 1680 aa24.33■■□□□ 1.49
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 InhbeO08717 350 aa24.32■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kif1aP33173 1695 aa24.31■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Usp40Q8BWR4 1235 aa24.31■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Eno4Q8C042 619 aa24.31■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp7bQ64446 1462 aa24.31■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fam135bQ9DAI6 1403 aa24.3■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Als2Q920R0 1651 aa24.3■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Neurod1Q60867 357 aa24.28■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Camta1A2A891 1682 aa24.27■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa24.27■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Wdr17E9Q271 1322 aa24.27■■□□□ 1.48
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Atp10bB1AWN4 1474 aa24.26■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Znf316Q6PGE4 1016 aa24.24■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Mier1Q5UAK0 511 aa24.23■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Fyb1O35601 819 aa24.22■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Dixdc1Q80Y83 711 aa24.22■■□□□ 1.47
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Polr3aB2RXC6 1390 aa24.19■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdk19Q8BWD8 501 aa24.19■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Psrc1Q9D0P7 329 aa24.19■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rgs17Q9QZB0 210 aa24.19■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa24.18■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Abca14E9Q8F8 1683 aa24.18■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 HdgfP51859 237 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 ZgpatQ8VDM1 511 aa24.16■■□□□ 1.46
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 PtpruB1AUH1 1446 aa24.14■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Stard8Q8K031 1019 aa24.13■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa24.12■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 CenpjQ569L8 1344 aa24.12■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Slc35g1Q8BY79 368 aa24.12■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa24.12■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Rtl5Q5DTT4 599 aa24.1■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa24.1■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa24.1■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Nphp4P59240 1425 aa24.09■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa24.09■■□□□ 1.45
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa24.08■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Ildr2B5TVM2 661 aa24.07■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Gsto1O09131 240 aa24.07■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 TimelessQ9R1X4 1197 aa24.07■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Zbtb4Q5F293 982 aa24.06■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Txnrd1Q9JMH6 613 aa24.06■■□□□ 1.44
Vpreb1-201ENSMUST00000075017 Srcin1Q9QWI6 1250 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.5 ms