Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,28■■■■■ 6,12
Rtl5Q5DTT4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,57■■■■■ 5,53
Rtl5Q5DTT4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,82■■■■■ 5,41
Rtl5Q5DTT4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,48■■■■■ 5,03
Rtl5Q5DTT4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC45,94■■■■■ 4,94
Rtl5Q5DTT4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Rtl5Q5DTT4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Rtl5Q5DTT4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,84■■■■■ 4,77
Rtl5Q5DTT4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC44,8■■■■■ 4,76
Rtl5Q5DTT4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,43■■■■■ 4,7
Rtl5Q5DTT4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,33■■■■■ 4,69
Rtl5Q5DTT4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,59■■■■■ 4,57
Rtl5Q5DTT4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,2■■■■■ 4,51
Rtl5Q5DTT4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,12■■■■■ 4,49
Rtl5Q5DTT4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,11■■■■■ 4,49
Rtl5Q5DTT4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
Rtl5Q5DTT4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Rtl5Q5DTT4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Rtl5Q5DTT4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,58■■■■■ 4,41
Rtl5Q5DTT4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Rtl5Q5DTT4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,45■■■■■ 4,39
Rtl5Q5DTT4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,33■■■■■ 4,37
Rtl5Q5DTT4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,29■■■■■ 4,36
Rtl5Q5DTT4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,26■■■■■ 4,36
Rtl5Q5DTT4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Rtl5Q5DTT4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Rtl5Q5DTT4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Rtl5Q5DTT4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Rtl5Q5DTT4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Rtl5Q5DTT4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Rtl5Q5DTT4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Rtl5Q5DTT4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Rtl5Q5DTT4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Rtl5Q5DTT4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,03■■■■■ 4,16
Rtl5Q5DTT4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40,99■■■■■ 4,15
Rtl5Q5DTT4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Rtl5Q5DTT4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40,82■■■■■ 4,13
Rtl5Q5DTT4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Rtl5Q5DTT4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Rtl5Q5DTT4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Rtl5Q5DTT4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Rtl5Q5DTT4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Rtl5Q5DTT4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
Rtl5Q5DTT4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,36■■■■■ 4,05
Rtl5Q5DTT4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
Rtl5Q5DTT4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,15■■■■■ 4,02
Rtl5Q5DTT4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,14■■■■■ 4,02
Rtl5Q5DTT4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,07■■■■■ 4,01
Rtl5Q5DTT4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Rtl5Q5DTT4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,01■■■■■ 4
Rtl5Q5DTT4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,99■■■■□ 3,99
Rtl5Q5DTT4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,84■■■■□ 3,97
Rtl5Q5DTT4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Rtl5Q5DTT4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Rtl5Q5DTT4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Rtl5Q5DTT4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Rtl5Q5DTT4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Rtl5Q5DTT4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Rtl5Q5DTT4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Rtl5Q5DTT4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Rtl5Q5DTT4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Rtl5Q5DTT4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Rtl5Q5DTT4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Rtl5Q5DTT4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,29■■■■□ 3,88
Rtl5Q5DTT4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
Rtl5Q5DTT4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Rtl5Q5DTT4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Rtl5Q5DTT4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Rtl5Q5DTT4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Rtl5Q5DTT4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Rtl5Q5DTT4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Rtl5Q5DTT4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,84■■■■□ 3,81
Rtl5Q5DTT4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Rtl5Q5DTT4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Rtl5Q5DTT4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Rtl5Q5DTT4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Rtl5Q5DTT4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Rtl5Q5DTT4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Rtl5Q5DTT4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Rtl5Q5DTT4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Rtl5Q5DTT4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Rtl5Q5DTT4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Rtl5Q5DTT4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Rtl5Q5DTT4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Rtl5Q5DTT4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,56■■■■□ 3,76
Rtl5Q5DTT4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Rtl5Q5DTT4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Rtl5Q5DTT4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Rtl5Q5DTT4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,4■■■■□ 3,74
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,38■■■■□ 3,73
Rtl5Q5DTT4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Rtl5Q5DTT4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Rtl5Q5DTT4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,23■■■■□ 3,71
Rtl5Q5DTT4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Rtl5Q5DTT4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,2■■■■□ 3,71
Rtl5Q5DTT4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,2■■■■□ 3,71
Rtl5Q5DTT4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,19■■■■□ 3,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,9 ms