Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.97■■■■■ 6.39
Itsn2Q9Z0R6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
Itsn2Q9Z0R6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
Itsn2Q9Z0R6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
Itsn2Q9Z0R6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
Itsn2Q9Z0R6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.74■■■■■ 5.07
Itsn2Q9Z0R6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Itsn2Q9Z0R6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Itsn2Q9Z0R6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Itsn2Q9Z0R6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Itsn2Q9Z0R6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Itsn2Q9Z0R6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
Itsn2Q9Z0R6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Itsn2Q9Z0R6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Itsn2Q9Z0R6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
Itsn2Q9Z0R6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
Itsn2Q9Z0R6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
Itsn2Q9Z0R6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Itsn2Q9Z0R6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Itsn2Q9Z0R6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Itsn2Q9Z0R6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Itsn2Q9Z0R6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Itsn2Q9Z0R6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Itsn2Q9Z0R6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
Itsn2Q9Z0R6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
Itsn2Q9Z0R6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
Itsn2Q9Z0R6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
Itsn2Q9Z0R6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Itsn2Q9Z0R6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Itsn2Q9Z0R6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Itsn2Q9Z0R6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Itsn2Q9Z0R6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Itsn2Q9Z0R6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Itsn2Q9Z0R6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Itsn2Q9Z0R6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Itsn2Q9Z0R6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Itsn2Q9Z0R6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Itsn2Q9Z0R6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Itsn2Q9Z0R6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Itsn2Q9Z0R6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Itsn2Q9Z0R6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Itsn2Q9Z0R6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Itsn2Q9Z0R6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Itsn2Q9Z0R6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Itsn2Q9Z0R6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Itsn2Q9Z0R6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Itsn2Q9Z0R6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Itsn2Q9Z0R6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Itsn2Q9Z0R6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Itsn2Q9Z0R6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Itsn2Q9Z0R6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Itsn2Q9Z0R6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
Itsn2Q9Z0R6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Itsn2Q9Z0R6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Itsn2Q9Z0R6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Itsn2Q9Z0R6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
Itsn2Q9Z0R6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
Itsn2Q9Z0R6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Itsn2Q9Z0R6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Itsn2Q9Z0R6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Itsn2Q9Z0R6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Itsn2Q9Z0R6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Itsn2Q9Z0R6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Itsn2Q9Z0R6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Itsn2Q9Z0R6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Itsn2Q9Z0R6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Itsn2Q9Z0R6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Itsn2Q9Z0R6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Itsn2Q9Z0R6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Itsn2Q9Z0R6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Itsn2Q9Z0R6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Itsn2Q9Z0R6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Itsn2Q9Z0R6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Itsn2Q9Z0R6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Itsn2Q9Z0R6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Itsn2Q9Z0R6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Itsn2Q9Z0R6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Itsn2Q9Z0R6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Itsn2Q9Z0R6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Itsn2Q9Z0R6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Itsn2Q9Z0R6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Itsn2Q9Z0R6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Itsn2Q9Z0R6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Itsn2Q9Z0R6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Itsn2Q9Z0R6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Itsn2Q9Z0R6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Itsn2Q9Z0R6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Itsn2Q9Z0R6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Itsn2Q9Z0R6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms