Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,97■■■■■ 6,39
Itsn2Q9Z0R6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,2■■■■■ 5,79
Itsn2Q9Z0R6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,03■■■■■ 5,6
Itsn2Q9Z0R6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,06■■■■■ 5,28
Itsn2Q9Z0R6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47,64■■■■■ 5,22
Itsn2Q9Z0R6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,74■■■■■ 5,07
Itsn2Q9Z0R6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,57■■■■■ 5,05
Itsn2Q9Z0R6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,48■■■■■ 5,03
Itsn2Q9Z0R6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,22■■■■■ 4,99
Itsn2Q9Z0R6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,08■■■■■ 4,97
Itsn2Q9Z0R6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,03■■■■■ 4,96
Itsn2Q9Z0R6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,76■■■■■ 4,92
Itsn2Q9Z0R6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
Itsn2Q9Z0R6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,9■■■■■ 4,78
Itsn2Q9Z0R6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,81■■■■■ 4,76
Itsn2Q9Z0R6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,44■■■■■ 4,7
Itsn2Q9Z0R6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,28■■■■■ 4,68
Itsn2Q9Z0R6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,28■■■■■ 4,68
Itsn2Q9Z0R6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
Itsn2Q9Z0R6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Itsn2Q9Z0R6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,85■■■■■ 4,61
Itsn2Q9Z0R6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,76■■■■■ 4,6
Itsn2Q9Z0R6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,75■■■■■ 4,59
Itsn2Q9Z0R6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,6■■■■■ 4,57
Itsn2Q9Z0R6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,53■■■■■ 4,56
Itsn2Q9Z0R6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,47■■■■■ 4,55
Itsn2Q9Z0R6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,46■■■■■ 4,55
Itsn2Q9Z0R6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,35■■■■■ 4,53
Itsn2Q9Z0R6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,05■■■■■ 4,48
Itsn2Q9Z0R6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,9■■■■■ 4,46
Itsn2Q9Z0R6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,45
Itsn2Q9Z0R6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Itsn2Q9Z0R6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Itsn2Q9Z0R6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Itsn2Q9Z0R6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Itsn2Q9Z0R6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
Itsn2Q9Z0R6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,64■■■■■ 4,42
Itsn2Q9Z0R6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Itsn2Q9Z0R6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Itsn2Q9Z0R6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,14■■■■■ 4,34
Itsn2Q9Z0R6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,03■■■■■ 4,32
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,82■■■■■ 4,29
Itsn2Q9Z0R6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Itsn2Q9Z0R6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
Itsn2Q9Z0R6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,61■■■■■ 4,25
Itsn2Q9Z0R6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Itsn2Q9Z0R6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,54■■■■■ 4,24
Itsn2Q9Z0R6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Itsn2Q9Z0R6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Itsn2Q9Z0R6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41,29■■■■■ 4,2
Itsn2Q9Z0R6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Itsn2Q9Z0R6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Itsn2Q9Z0R6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41,2■■■■■ 4,19
Itsn2Q9Z0R6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,16■■■■■ 4,18
Itsn2Q9Z0R6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,13■■■■■ 4,18
Itsn2Q9Z0R6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Itsn2Q9Z0R6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Itsn2Q9Z0R6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4,15
Itsn2Q9Z0R6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Itsn2Q9Z0R6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Itsn2Q9Z0R6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Itsn2Q9Z0R6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,82■■■■■ 4,12
Itsn2Q9Z0R6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Itsn2Q9Z0R6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Itsn2Q9Z0R6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Itsn2Q9Z0R6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Itsn2Q9Z0R6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Itsn2Q9Z0R6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Itsn2Q9Z0R6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Itsn2Q9Z0R6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Itsn2Q9Z0R6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Itsn2Q9Z0R6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Itsn2Q9Z0R6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,3■■■■■ 4,04
Itsn2Q9Z0R6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,29■■■■■ 4,04
Itsn2Q9Z0R6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Itsn2Q9Z0R6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Itsn2Q9Z0R6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Itsn2Q9Z0R6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Itsn2Q9Z0R6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,05■■■■■ 4
Itsn2Q9Z0R6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Itsn2Q9Z0R6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Itsn2Q9Z0R6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Itsn2Q9Z0R6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Itsn2Q9Z0R6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,94■■■■□ 3,98
Itsn2Q9Z0R6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Itsn2Q9Z0R6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,89■■■■□ 3,98
Itsn2Q9Z0R6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,84■■■■□ 3,97
Itsn2Q9Z0R6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,83■■■■□ 3,97
Itsn2Q9Z0R6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Itsn2Q9Z0R6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Itsn2Q9Z0R6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
Itsn2Q9Z0R6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,72■■■■□ 3,95
Itsn2Q9Z0R6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Itsn2Q9Z0R6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Itsn2Q9Z0R6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms