RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa32,61■■■□□ 2,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp32F8VPZ3 1604 aa32,61■■■□□ 2,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa32,6■■■□□ 2,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KdrP35918 1367 aa32,59■■■□□ 2,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Qtrt2B8ZXI1 415 aa32,57■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa32,56■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GapdhsQ64467 440 aa32,56■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stag3O70576 1240 aa32,55■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp40Q8BWR4 1235 aa32,55■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP32,54■■■□□ 2,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nyap1Q6PFX7 833 aa32,52■■■□□ 2,8
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa32,51■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DccP70211 1447 aa32,51■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 C5P06684 1680 aa32,5■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcna6Q61923 529 aa32,49■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cypt1Q8CH20 168 aa32,48■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif24Q6NWW5 1356 aa32,47■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnk3Q80XP9 1757 aa32,46■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa32,46■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abca14E9Q8F8 1683 aa32,46■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Als2Q920R0 1651 aa32,46■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Farp2Q91VS8 1065 aa32,45■■■□□ 2,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mink1Q9JM52 1308 aa32,45■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nphp4P59240 1425 aa32,44■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mug2P28666 1451 aa32,44■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbln2P37889 1221 aa32,42■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GnpatP98192 678 aa32,42■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stard8Q8K031 1019 aa32,42■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa32,4■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp142G5E869 1843 aa32,4■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP32,39■■■□□ 2,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem2Q5FWI3 1383 aa32,37■■■□□ 2,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Idi1P58044 227 aa32,36■■■□□ 2,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sox12Q04890 314 aa32,35■■■□□ 2,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP32,35■■■□□ 2,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa32,34■■■□□ 2,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camta1A2A891 1682 aa32,32■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf526Q8BI66 675 aa32,32■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif1aP33173 1695 aa32,31■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sirt1Q923E4 737 aa32,31■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa32,3■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Srcin1Q9QWI6 1250 aa32,3■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrl1Q80TR1 1466 aa32,29■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema6bO54951 886 aa32,29■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ap3b2Q9JME5 1082 aa32,28■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CenpjQ569L8 1344 aa32,27■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc10Q8R4P9 1501 aa32,27■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ggt6Q6PDE7 497 aa32,27■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa32,27■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cntnap1O54991 1385 aa32,27■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slit2Q9R1B9 1521 aa32,26■■■□□ 2,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cypt2Q6P924 180 aa32,26■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa32,25■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdk19Q8BWD8 501 aa32,25■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NgefQ8CHT1 710 aa32,25■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprvP70289 1705 aa32,25■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP32,24■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rundc1Q0VDN7 615 aa32,23■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb4Q5F293 982 aa32,2■■■□□ 2,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NktrP30415 1453 aa32,19■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Card11Q8CIS0 1159 aa32,19■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP32,19■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf316Q6PGE4 1016 aa32,17■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr17E9Q271 1322 aa32,17■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Siglec1Q62230 1695 aa32,17■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP32,16■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp7bQ64446 1462 aa32,16■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gsto1O09131 240 aa32,14■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP32,14■■■□□ 2,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MypopQ8R4U1 393 aa32,13■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rock2P70336 1388 aa32,12■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif7B7ZNG0 1348 aa32,11■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam135bQ9DAI6 1403 aa32,1■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mon2Q80TL7 1715 aa32,09■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp10bB1AWN4 1474 aa32,09■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrp6O88572 1613 aa32,08■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cadps2Q8BYR5 1297 aa32,08■■■□□ 2,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smim5Q8BT42 78 aa32,05■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Emilin2Q8K482 1074 aa32,05■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TonslQ6NZL6 1363 aa32,05■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zranb1Q7M760 708 aa32,04■■■□□ 2,72
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FanciQ8K368 1330 aa32,03■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fyb1O35601 819 aa32,03■■■□□ 2,72
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP32,03■■■□□ 2,72
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nrxn1Q9CS84 1514 aa32,02■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Idi2Q8BFZ6 227 aa32,02■■■□□ 2,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtpruB1AUH1 1446 aa32,01■■■□□ 2,72
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 InsrP15208 1372 aa31,99■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP31,99■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acsbg1Q99PU5 721 aa31,99■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc35g1Q8BY79 368 aa31,98■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dixdc1Q80Y83 711 aa31,97■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP31,97■■■□□ 2,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CatipB9EKE5 520 aa31,96■■■□□ 2,71
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