RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,83■■■■■ 5,89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NischQ80TM9 1593 aa51,15■■■■■ 5,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc9P70170 1546 aa49,5■■■■■ 5,51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc8B2RUS7 1588 aa49,46■■■■■ 5,51
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ScribQ80U72 1612 aa47,67■■■■■ 5,22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NacadQ5SWP3 1504 aa46,24■■■■■ 4,99
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm5dQ62240 1548 aa46,13■■■■■ 4,97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45,53■■■■■ 4,88
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45,32■■■■■ 4,85
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BicraF8VPZ9 1578 aa44,65■■■■■ 4,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,58■■■■■ 4,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rhox8Q6VSS7 320 aa44,2■■■■■ 4,67
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Baz1aO88379 1555 aa43,96■■■■■ 4,63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc180J3QNE4 1664 aa43,95■■■■■ 4,63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,83■■■■■ 4,61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,5■■■■■ 4,55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa43,45■■■■■ 4,55
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43,33■■■■■ 4,53
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,09■■■■■ 4,49
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP43,06■■■■■ 4,48
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,68■■■■■ 4,42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarca2Q6DIC0 1577 aa42,65■■■■■ 4,42
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42,58■■■■■ 4,41
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42,52■■■■■ 4,4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42,45■■■■■ 4,39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,4■■■■■ 4,38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,12■■■■■ 4,33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr62Q3U3T8 1523 aa42,1■■■■■ 4,33
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42,02■■■■■ 4,32
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rtl1Q7M732 1744 aa41,95■■■■■ 4,31
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41,85■■■■■ 4,29
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,72■■■■■ 4,27
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CftrP26361 1476 aa41,58■■■■■ 4,25
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,54■■■■■ 4,24
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP41,52■■■■■ 4,24
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,47■■■■■ 4,23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,47■■■■■ 4,23
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41,41■■■■■ 4,22
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa41,35■■■■■ 4,21
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mrc2Q64449 1479 aa41,15■■■■■ 4,18
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP40,89■■■■■ 4,14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim41Q5NCC3 630 aa40,78■■■■■ 4,12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,64■■■■■ 4,1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,55■■■■■ 4,08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cux2P70298 1426 aa40,52■■■■■ 4,08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40,39■■■■■ 4,06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,22■■■■■ 4,03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,18■■■■■ 4,02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP40,13■■■■■ 4,01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Golga3P55937 1487 aa40,01■■■■■ 4
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep164Q5DU05 1446 aa39,99■■■■□ 3,99
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Top2bQ64511 1612 aa39,94■■■■□ 3,99
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TnnQ80Z71 1560 aa39,9■■■■□ 3,98
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cngb1E1AZ71 1325 aa39,86■■■■□ 3,97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,83■■■■□ 3,97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il27Q8K3I6 234 aa39,7■■■■□ 3,95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39,68■■■■□ 3,94
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,67■■■■□ 3,94
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,65■■■■□ 3,94
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,61■■■■□ 3,93
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fmn1Q05860 1466 aa39,58■■■■□ 3,93
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,57■■■■□ 3,93
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,52■■■■□ 3,92
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crocc2F6XLV1 1638 aa39,47■■■■□ 3,91
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajc5P60904 198 aa39,42■■■■□ 3,9
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39,37■■■■□ 3,89
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Shroom2A2ALU4 1481 aa39,22■■■■□ 3,87
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift140E9PY46 1464 aa39,22■■■■□ 3,87
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Duox2A2AQ99 1517 aa39,17■■■■□ 3,86
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin2bQ01097 1482 aa39,12■■■■□ 3,85
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rusc2Q80U22 1514 aa39,05■■■■□ 3,84
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,9■■■■□ 3,82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efcab5A0JP43 1406 aa38,89■■■■□ 3,82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38,89■■■■□ 3,82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP38,85■■■■□ 3,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,84■■■■□ 3,81
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP38,79■■■■□ 3,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,77■■■■□ 3,8
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,74■■■■□ 3,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,72■■■■□ 3,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NrkQ9R0G8 1455 aa38,7■■■■□ 3,79
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col17a1Q07563 1470 aa38,65■■■■□ 3,78
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,61■■■■□ 3,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chic1Q8CBW7 227 aa38,6■■■■□ 3,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP38,6■■■■□ 3,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,58■■■■□ 3,77
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin2aP35436 1464 aa38,51■■■■□ 3,76
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Shroom4Q1W617 1475 aa38,5■■■■□ 3,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,48■■■■□ 3,75
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprkP35822 1457 aa38,43■■■■□ 3,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,42■■■■□ 3,74
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP38,33■■■■□ 3,73
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SynmQ70IV5 1561 aa38,31■■■■□ 3,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgd6Q69ZL1 1399 aa38,3■■■■□ 3,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pla2r1Q62028 1487 aa38,26■■■■□ 3,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38,26■■■■□ 3,72
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zeb1Q64318 1117 aa38,2■■■■□ 3,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npm2Q80W85 207 aa38,01■■■■□ 3,68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AknaQ80VW7 1404 aa38,01■■■■□ 3,68
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa37,98■■■■□ 3,67
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