RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcc10Q8R4P9 1501 aa16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Farp2Q91VS8 1065 aa16.67■□□□□ 0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mphosph9A6H5Y1 991 aa16.66■□□□□ 0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3UJC8 639 aa16.64■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emilin2Q8K482 1074 aa16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cps1Q8C196 1500 aa16.63■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcna6Q61923 529 aa16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp32F8VPZ3 1604 aa16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox12Q04890 314 aa16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex14Q7M6U3 1450 aa16.61■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psrc1Q9D0P7 329 aa16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.6■□□□□ 0.25
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Idi1P58044 227 aa16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep170bQ80U49 1574 aa16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wnk3Q80XP9 1757 aa16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MaddQ80U28 1577 aa16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DccP70211 1447 aa16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Washc2Q6PGL7 1334 aa16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dot1lQ6XZL8 1540 aa16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdm2aP59997 1161 aa16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Robo1O89026 1612 aa16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pkd2O35245 966 aa16.54■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NgefQ8CHT1 710 aa16.53■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 InhbeO08717 350 aa16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.52■□□□□ 0.24
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 C5P06684 1680 aa16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtpruB1AUH1 1446 aa16.51■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Als2Q920R0 1651 aa16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc6D3YZP9 469 aa16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubap1lG3UW59 384 aa16.5■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sugp2Q8CH09 1067 aa16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem2Q5FWI3 1383 aa16.49■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rims1Q99NE5 1463 aa16.48■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col22a1E9Q7P1 1613 aa16.47■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camta1A2A891 1682 aa16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35g1Q8BY79 368 aa16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Os9Q8K2C7 672 aa16.46■□□□□ 0.23
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tulp4Q9JIL5 1547 aa16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc52a2Q9D8F3 450 aa16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam135bQ9DAI6 1403 aa16.45■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf316Q6PGE4 1016 aa16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Txnrd1Q9JMH6 613 aa16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamts13Q769J6 1426 aa16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ltbp1Q8CG19 1712 aa16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sirt1Q923E4 737 aa16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mink1Q9JM52 1308 aa16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif1aP33173 1695 aa16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc7Q80TE7 1490 aa16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccer2J3QPU5 274 aa16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr17E9Q271 1322 aa16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abca15E9PWH4 1668 aa16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20521D3Z5F7 333 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dixdc1Q80Y83 711 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cadps2Q8BYR5 1297 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp7bQ64446 1462 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abca14E9Q8F8 1683 aa16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp10bB1AWN4 1474 aa16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgl3Q3UYI5 709 aa16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rock1P70335 1354 aa16.37■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnks1bp1P58871 1720 aa16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc129Q14B48 1034 aa16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap3b2Q9JME5 1082 aa16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shank2Q80Z38 1476 aa16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmym3Q9JLM4 1370 aa16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fyb1O35601 819 aa16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stag3O70576 1240 aa16.3■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekhg1F6S200 1446 aa16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl5Q5DTT4 599 aa16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OscarQ8VBT3 265 aa16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col16a1Q8BLX7 1580 aa16.29■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PaskQ8CEE6 1383 aa16.28■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp47Q8BY87 1376 aa16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfat5Q9WV30 1534 aa16.27■□□□□ 0.2
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms