RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.54■■□□□ 1.84
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NischQ80TM9 1593 aa26.06■■□□□ 1.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcc9P70170 1546 aa25.53■■□□□ 1.68
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.35■■□□□ 1.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ScribQ80U72 1612 aa24.85■■□□□ 1.57
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdm5dQ62240 1548 aa23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NacadQ5SWP3 1504 aa23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BicraF8VPZ9 1578 aa23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.38■■□□□ 1.17
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baz1aO88379 1555 aa22.25■■□□□ 1.15
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.15■■□□□ 1.14
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.05■■□□□ 1.12
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.92■■□□□ 1.1
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frmpd1A2AKB4 1549 aa21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.8■■□□□ 1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc5P60904 198 aa21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim41Q5NCC3 630 aa21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc13aQ4KUS2 1712 aa21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrc2Q64449 1479 aa21.52■■□□□ 1.03
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baz1bQ9Z277 1479 aa21.41■■□□□ 1.02
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.18■□□□□ 0.98
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CftrP26361 1476 aa21.16■□□□□ 0.98
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.14■□□□□ 0.98
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.08■□□□□ 0.97
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif21aQ9QXL2 1672 aa20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cux2P70298 1426 aa20.99■□□□□ 0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.92■□□□□ 0.94
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif15Q6P9L6 1387 aa20.88■□□□□ 0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rtl1Q7M732 1744 aa20.84■□□□□ 0.93
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col17a1Q07563 1470 aa20.72■□□□□ 0.91
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plb1Q3TTY0 1478 aa20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il27Q8K3I6 234 aa20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep164Q5DU05 1446 aa20.53■□□□□ 0.88
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Top2bQ64511 1612 aa20.49■□□□□ 0.87
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa20.38■□□□□ 0.85
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.35■□□□□ 0.85
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rusc2Q80U22 1514 aa20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.26■□□□□ 0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TnnQ80Z71 1560 aa20.22■□□□□ 0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ift140E9PY46 1464 aa20.21■□□□□ 0.83
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Setd1bQ8CFT2 1985 aa20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Disp1Q3TDN0 1521 aa20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Duox2A2AQ99 1517 aa20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.06■□□□□ 0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.05■□□□□ 0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.03■□□□□ 0.8
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Golga3P55937 1487 aa20.01■□□□□ 0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm156Q58A37 223 aa20■□□□□ 0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Samd9lQ69Z37 1561 aa19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprkP35822 1457 aa19.96■□□□□ 0.79
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep170Q6A065 1588 aa19.95■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad54l2Q99NG0 1466 aa19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprtQ99M80 1454 aa19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grin2bQ01097 1482 aa19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fmn1Q05860 1466 aa19.84■□□□□ 0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fgd6Q69ZL1 1399 aa19.83■□□□□ 0.77
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Magi3Q9EQJ9 1476 aa19.79■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AknaQ80VW7 1404 aa19.78■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grin2aP35436 1464 aa19.78■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pprc1Q6NZN1 1644 aa19.77■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcc1O35379 1528 aa19.73■□□□□ 0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efcab5A0JP43 1406 aa19.73■□□□□ 0.75
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23 ms