Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC2

Plxnc1, Plexin-C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnc1Q9QZC2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55.47■■■■■ 6.47
Plxnc1Q9QZC2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
Plxnc1Q9QZC2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
Plxnc1Q9QZC2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
Plxnc1Q9QZC2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
Plxnc1Q9QZC2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.54■■■■■ 5.2
Plxnc1Q9QZC2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Plxnc1Q9QZC2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Plxnc1Q9QZC2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Plxnc1Q9QZC2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Plxnc1Q9QZC2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Plxnc1Q9QZC2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Plxnc1Q9QZC2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Plxnc1Q9QZC2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Plxnc1Q9QZC2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Plxnc1Q9QZC2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
Plxnc1Q9QZC2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
Plxnc1Q9QZC2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Plxnc1Q9QZC2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Plxnc1Q9QZC2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Plxnc1Q9QZC2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Plxnc1Q9QZC2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Plxnc1Q9QZC2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
Plxnc1Q9QZC2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Plxnc1Q9QZC2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Plxnc1Q9QZC2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Plxnc1Q9QZC2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
Plxnc1Q9QZC2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Plxnc1Q9QZC2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Plxnc1Q9QZC2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Plxnc1Q9QZC2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Plxnc1Q9QZC2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Plxnc1Q9QZC2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
Plxnc1Q9QZC2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Plxnc1Q9QZC2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Plxnc1Q9QZC2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Plxnc1Q9QZC2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Plxnc1Q9QZC2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Plxnc1Q9QZC2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Plxnc1Q9QZC2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Plxnc1Q9QZC2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Plxnc1Q9QZC2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Plxnc1Q9QZC2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Plxnc1Q9QZC2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Plxnc1Q9QZC2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Plxnc1Q9QZC2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Plxnc1Q9QZC2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Plxnc1Q9QZC2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Plxnc1Q9QZC2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Plxnc1Q9QZC2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.28
Plxnc1Q9QZC2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Plxnc1Q9QZC2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Plxnc1Q9QZC2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Plxnc1Q9QZC2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Plxnc1Q9QZC2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
Plxnc1Q9QZC2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Plxnc1Q9QZC2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Plxnc1Q9QZC2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
Plxnc1Q9QZC2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Plxnc1Q9QZC2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Plxnc1Q9QZC2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Plxnc1Q9QZC2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Plxnc1Q9QZC2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Plxnc1Q9QZC2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Plxnc1Q9QZC2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Plxnc1Q9QZC2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Plxnc1Q9QZC2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Plxnc1Q9QZC2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Plxnc1Q9QZC2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Plxnc1Q9QZC2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Plxnc1Q9QZC2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Plxnc1Q9QZC2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Plxnc1Q9QZC2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
Plxnc1Q9QZC2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Plxnc1Q9QZC2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Plxnc1Q9QZC2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
Plxnc1Q9QZC2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Plxnc1Q9QZC2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Plxnc1Q9QZC2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Plxnc1Q9QZC2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Plxnc1Q9QZC2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Plxnc1Q9QZC2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Plxnc1Q9QZC2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Plxnc1Q9QZC2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Plxnc1Q9QZC2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Plxnc1Q9QZC2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Plxnc1Q9QZC2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Plxnc1Q9QZC2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Plxnc1Q9QZC2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Plxnc1Q9QZC2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Plxnc1Q9QZC2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Plxnc1Q9QZC2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Plxnc1Q9QZC2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Plxnc1Q9QZC2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Plxnc1Q9QZC2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Plxnc1Q9QZC2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Plxnc1Q9QZC2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Plxnc1Q9QZC2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Plxnc1Q9QZC2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms