RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Usp32F8VPZ3 1604 aa25.34■■□□□ 1.65
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kcna6Q61923 529 aa25.27■■□□□ 1.64
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa25.26■■□□□ 1.63
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kif24Q6NWW5 1356 aa25.23■■□□□ 1.63
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tmem2Q5FWI3 1383 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Idi1P58044 227 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GapdhsQ64467 440 aa25.16■■□□□ 1.62
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ap3b2Q9JME5 1082 aa25.16■■□□□ 1.62
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Card11Q8CIS0 1159 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cdk19Q8BWD8 501 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kif1aP33173 1695 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zbtb4Q5F293 982 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NgefQ8CHT1 710 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 TonslQ6NZL6 1363 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Camta1A2A891 1682 aa25.11■■□□□ 1.61
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf316Q6PGE4 1016 aa25.05■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa25.05■■□□□ 1.6
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Adgrl1Q80TR1 1466 aa25.04■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sema6bO54951 886 aa25.03■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Wdr17E9Q271 1322 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NktrP30415 1453 aa25.02■■□□□ 1.6
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cntnap1O54991 1385 aa25.01■■□□□ 1.59
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp7bQ64446 1462 aa24.99■■□□□ 1.59
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slit2Q9R1B9 1521 aa24.98■■□□□ 1.59
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mon2Q80TL7 1715 aa24.98■■□□□ 1.59
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp10bB1AWN4 1474 aa24.94■■□□□ 1.58
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zranb1Q7M760 708 aa24.92■■□□□ 1.58
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Emilin2Q8K482 1074 aa24.92■■□□□ 1.58
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 MypopQ8R4U1 393 aa24.92■■□□□ 1.58
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dmrt2Q8BG36 561 aa24.89■■□□□ 1.58
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.89■■□□□ 1.58
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dixdc1Q80Y83 711 aa24.88■■□□□ 1.57
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kif7B7ZNG0 1348 aa24.87■■□□□ 1.57
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k19E9Q3S4 1311 aa24.87■■□□□ 1.57
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nrxn1Q9CS84 1514 aa24.87■■□□□ 1.57
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Smim5Q8BT42 78 aa24.87■■□□□ 1.57
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