RNA–Protein interactions for RNA: YOL092W

YPQ1, Transcript of Putative vacuolar membrane transporter for cationic amino acids, yeast

Gene YPQ1, Length 927 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPQ1	YOL092W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	CDC23	P16522	626 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	LSB5	P25369	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YUH1	P35127	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	ECM31	P38122	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	IKI1	P38874	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	PRM5	P40476	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	BMT5	P40493	336 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YIP1	P53039	248 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MRPL22	P53881	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	VBA1	Q04301	562 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	LPP1	Q04396	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YOR292C	Q08743	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YOR385W	Q08909	290 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	FEX2	Q08991	375 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	PET20	Q99373	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MRPL3	P36516	390 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YFL054C	P43549	646 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	SPG4	Q04438	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	SYM1	Q06563	197 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MCH1	Q07376	486 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MED4	Q12343	284 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	UBA3	Q99344	299 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	GAL1	P04385	528 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MRP20	P32387	263 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	SPS18	P32572	300 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	POP8	P38208	133 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	UBP8	P50102	471 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MRPS16	Q02608	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YFH1	Q07540	174 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	FEX1	Q08913	375 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	ROX3	P25046	220 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	INO2	P26798	304 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	PPQ1	P32945	549 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YKR045C	P36138	183 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	COS8	P38723	381 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	POP2	P39008	433 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	SCM3	Q12334	223 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	LAS17	Q12446	633 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	CPR4	P25334	318 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	FLO10	P36170	1169 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	GPG1	P53130	126 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	CRH1	P53301	507 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	GIM3	P53900	129 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YPQ1	YOL092W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YGR210C	P42942	411 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	RPA43	P46669	326 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YML122C	Q03207	126 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	VPS71	Q03433	280 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	CAB5	Q03941	241 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	SCP1	Q08873	200 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	TRM13	Q12383	476 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YMR31	P19955	123 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	MRS4	P23500	304 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	MIG1	P27705	504 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	MRP17	P28778	131 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YJL213W	P40896	331 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	VPS55	P47111	140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	MEH1	Q02205	184 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	THI74	Q04083	370 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	RTT103	Q05543	409 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	NDE2	Q07500	545 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	BOL1	Q3E793	110 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	ARG80	P07249	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	GCN3	P14741	305 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	PHM8	P40025	321 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	NIF3	P53081	288 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	HOR7	Q05827	59 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
YPQ1	YOL092W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	HRD1	Q08109	551 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YPQ1	YOL092W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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