Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B3

YPR108W-A, Uncharacterized protein YPR108W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR108W-AQ3E7B3 NSR1YGR159C 1245 nt17.09■□□□□ 0.33
YPR108W-AQ3E7B3 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.96■□□□□ 0.31
YPR108W-AQ3E7B3 NOP1YDL014W 984 nt16.36■□□□□ 0.21
YPR108W-AQ3E7B3 MDJ1YFL016C 1536 nt15.46■□□□□ 0.07
YPR108W-AQ3E7B3 YKL036CYKL036C 393 nt14.82□□□□□ -0.04
YPR108W-AQ3E7B3 SRX1YKL086W 384 nt14.29□□□□□ -0.12
YPR108W-AQ3E7B3 YJL027CYJL027C 417 nt14.25□□□□□ -0.13
YPR108W-AQ3E7B3 Q0297Q0297 156 nt14.21□□□□□ -0.13
YPR108W-AQ3E7B3 YCR051WYCR051W 669 nt13.56□□□□□ -0.24
YPR108W-AQ3E7B3 DBP2YNL112W 1641 nt13.54□□□□□ -0.24
YPR108W-AQ3E7B3 SCS3YGL126W 1143 nt13.33□□□□□ -0.28
YPR108W-AQ3E7B3 YBR190WYBR190W 312 nt13.25□□□□□ -0.29
YPR108W-AQ3E7B3 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YPR108W-AQ3E7B3 CCC1YLR220W 969 nt12.98□□□□□ -0.33
YPR108W-AQ3E7B3 RTC3YHR087W 336 nt12.97□□□□□ -0.33
YPR108W-AQ3E7B3 YOL085CYOL085C 342 nt12.84□□□□□ -0.35
YPR108W-AQ3E7B3 RPP1BYDL130W 321 nt12.76□□□□□ -0.37
YPR108W-AQ3E7B3 PKP1YIL042C 1185 nt12.7□□□□□ -0.38
YPR108W-AQ3E7B3 RVS167YDR388W 1449 nt12.69□□□□□ -0.38
YPR108W-AQ3E7B3 SCJ1YMR214W 1134 nt12.54□□□□□ -0.4
YPR108W-AQ3E7B3 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YPR108W-AQ3E7B3 PUT4YOR348C 1884 nt12.25□□□□□ -0.45
YPR108W-AQ3E7B3 PET122YER153C 765 nt12.23□□□□□ -0.45
YPR108W-AQ3E7B3 SHR5YOL110W 714 nt12.17□□□□□ -0.46
YPR108W-AQ3E7B3 SSA3YBL075C 1950 nt12.12□□□□□ -0.47
YPR108W-AQ3E7B3 SCR1SCR1 522 nt12.03□□□□□ -0.48
YPR108W-AQ3E7B3 URN1YPR152C 1398 nt12.02□□□□□ -0.49
YPR108W-AQ3E7B3 DEP1YAL013W 1218 nt11.94□□□□□ -0.5
YPR108W-AQ3E7B3 ARE1YCR048W 1833 nt11.94□□□□□ -0.5
YPR108W-AQ3E7B3 SAH1YER043C 1350 nt11.91□□□□□ -0.5
YPR108W-AQ3E7B3 OPI9YLR338W 858 nt11.9□□□□□ -0.5
YPR108W-AQ3E7B3 YDJ1YNL064C 1230 nt11.89□□□□□ -0.51
YPR108W-AQ3E7B3 POA1YBR022W 534 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR108W-AQ3E7B3 RRN5YLR141W 1092 nt11.85□□□□□ -0.51
YPR108W-AQ3E7B3 ATS1YAL020C 1002 nt11.83□□□□□ -0.52
YPR108W-AQ3E7B3 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.8□□□□□ -0.52
YPR108W-AQ3E7B3 RPN10YHR200W 807 nt11.78□□□□□ -0.52
YPR108W-AQ3E7B3 YNL208WYNL208W 600 nt11.71□□□□□ -0.53
YPR108W-AQ3E7B3 GAR1YHR089C 618 nt11.69□□□□□ -0.54
YPR108W-AQ3E7B3 BSC6YOL137W 1494 nt11.65□□□□□ -0.54
YPR108W-AQ3E7B3 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.6□□□□□ -0.55
YPR108W-AQ3E7B3 PUN1YLR414C 792 nt11.55□□□□□ -0.56
YPR108W-AQ3E7B3 BUD23YCR047C 828 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR108W-AQ3E7B3 RSB1YOR049C 1065 nt11.53□□□□□ -0.56
YPR108W-AQ3E7B3 PTC2YER089C 1395 nt11.47□□□□□ -0.57
YPR108W-AQ3E7B3 YJR018WYJR018W 363 nt11.45□□□□□ -0.58
YPR108W-AQ3E7B3 NAB2YGL122C 1578 nt11.36□□□□□ -0.59
YPR108W-AQ3E7B3 TIR1YER011W 765 nt11.31□□□□□ -0.6
YPR108W-AQ3E7B3 SPT5YML010W 3192 nt11.27□□□□□ -0.6
YPR108W-AQ3E7B3 SSA1YAL005C 1929 nt11.22□□□□□ -0.61
YPR108W-AQ3E7B3 YJR120WYJR120W 351 nt11.19□□□□□ -0.62
YPR108W-AQ3E7B3 DAL1YIR027C 1383 nt11.16□□□□□ -0.62
YPR108W-AQ3E7B3 RPP2BYDR382W 333 nt11.15□□□□□ -0.62
YPR108W-AQ3E7B3 FIS1YIL065C 468 nt11.15□□□□□ -0.62
YPR108W-AQ3E7B3 FPR4YLR449W 1179 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR108W-AQ3E7B3 INM2YDR287W 879 nt11.07□□□□□ -0.64
YPR108W-AQ3E7B3 PHO4YFR034C 939 nt11.04□□□□□ -0.64
YPR108W-AQ3E7B3 SSA4YER103W 1929 nt11.03□□□□□ -0.64
YPR108W-AQ3E7B3 PST2YDR032C 597 nt11□□□□□ -0.65
YPR108W-AQ3E7B3 SRB2YHR041C 633 nt10.97□□□□□ -0.65
YPR108W-AQ3E7B3 MEP2YNL142W 1500 nt10.96□□□□□ -0.65
YPR108W-AQ3E7B3 YPS1YLR120C 1710 nt10.92□□□□□ -0.66
YPR108W-AQ3E7B3 YBL100CYBL100C 315 nt10.92□□□□□ -0.66
YPR108W-AQ3E7B3 BDH2YAL061W 1254 nt10.86□□□□□ -0.67
YPR108W-AQ3E7B3 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.84□□□□□ -0.67
YPR108W-AQ3E7B3 YDR095CYDR095C 411 nt10.81□□□□□ -0.68
YPR108W-AQ3E7B3 DCW1YKL046C 1350 nt10.79□□□□□ -0.68
YPR108W-AQ3E7B3 FUN26YAL022C 1554 nt10.78□□□□□ -0.68
YPR108W-AQ3E7B3 WWM1YFL010C 636 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR108W-AQ3E7B3 TRM9YML014W 840 nt10.72□□□□□ -0.69
YPR108W-AQ3E7B3 ALF1YNL148C 765 nt10.71□□□□□ -0.69
YPR108W-AQ3E7B3 LSM3YLR438C-A 270 nt10.66□□□□□ -0.7
YPR108W-AQ3E7B3 EMI2YDR516C 1503 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 SHU1YHL006C 453 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 RPP2AYOL039W 321 nt10.62□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 BDF1YLR399C 2061 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 YMR090WYMR090W 684 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 CCT6YDR188W 1641 nt10.61□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 PTP1YDL230W 1008 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 YGR021WYGR021W 873 nt10.59□□□□□ -0.71
YPR108W-AQ3E7B3 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.56□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.56□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 CAC2YML102W 1407 nt10.56□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 YDL221WYDL221W 552 nt10.54□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 HOM6YJR139C 1080 nt10.54□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 SIS1YNL007C 1059 nt10.53□□□□□ -0.72
YPR108W-AQ3E7B3 YBR220CYBR220C 1683 nt10.52□□□□□ -0.73
YPR108W-AQ3E7B3 TAT1YBR069C 1860 nt10.47□□□□□ -0.73
YPR108W-AQ3E7B3 SDH1YKL148C 1923 nt10.46□□□□□ -0.73
YPR108W-AQ3E7B3 MNP1YGL068W 585 nt10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms