Protein–RNA interactions for Protein: P36102

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN3P36102 NSR1YGR159C 1245 nt17.32■□□□□ 0.36
PAN3P36102 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.98■□□□□ 0.31
PAN3P36102 NOP1YDL014W 984 nt16.35■□□□□ 0.21
PAN3P36102 MDJ1YFL016C 1536 nt15.76■□□□□ 0.11
PAN3P36102 YKL036CYKL036C 393 nt14.66□□□□□ -0.06
PAN3P36102 YJL027CYJL027C 417 nt14.52□□□□□ -0.09
PAN3P36102 SRX1YKL086W 384 nt14.29□□□□□ -0.12
PAN3P36102 Q0297Q0297 156 nt14.19□□□□□ -0.14
PAN3P36102 DBP2YNL112W 1641 nt13.79□□□□□ -0.2
PAN3P36102 YBR190WYBR190W 312 nt13.6□□□□□ -0.23
PAN3P36102 YCR051WYCR051W 669 nt13.47□□□□□ -0.25
PAN3P36102 RTC3YHR087W 336 nt13.22□□□□□ -0.29
PAN3P36102 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.2□□□□□ -0.3
PAN3P36102 SCS3YGL126W 1143 nt13.1□□□□□ -0.31
PAN3P36102 CCC1YLR220W 969 nt12.99□□□□□ -0.33
PAN3P36102 SSA3YBL075C 1950 nt12.98□□□□□ -0.33
PAN3P36102 RVS167YDR388W 1449 nt12.87□□□□□ -0.35
PAN3P36102 RPP1BYDL130W 321 nt12.71□□□□□ -0.37
PAN3P36102 PUT4YOR348C 1884 nt12.7□□□□□ -0.38
PAN3P36102 SCJ1YMR214W 1134 nt12.7□□□□□ -0.38
PAN3P36102 YOL085CYOL085C 342 nt12.7□□□□□ -0.38
PAN3P36102 PKP1YIL042C 1185 nt12.51□□□□□ -0.41
PAN3P36102 ARE1YCR048W 1833 nt12.32□□□□□ -0.44
PAN3P36102 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.31□□□□□ -0.44
PAN3P36102 SHR5YOL110W 714 nt12.31□□□□□ -0.44
PAN3P36102 URN1YPR152C 1398 nt12.23□□□□□ -0.45
PAN3P36102 POA1YBR022W 534 nt12.22□□□□□ -0.45
PAN3P36102 PET122YER153C 765 nt12.18□□□□□ -0.46
PAN3P36102 OPI9YLR338W 858 nt12.18□□□□□ -0.46
PAN3P36102 SAH1YER043C 1350 nt12.18□□□□□ -0.46
PAN3P36102 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.15□□□□□ -0.46
PAN3P36102 BSC6YOL137W 1494 nt12.07□□□□□ -0.48
PAN3P36102 DEP1YAL013W 1218 nt12.05□□□□□ -0.48
PAN3P36102 RPN10YHR200W 807 nt11.97□□□□□ -0.49
PAN3P36102 YDJ1YNL064C 1230 nt11.95□□□□□ -0.5
PAN3P36102 SCR1SCR1 522 nt11.94□□□□□ -0.5
PAN3P36102 SPT5YML010W 3192 nt11.91□□□□□ -0.5
PAN3P36102 YNL208WYNL208W 600 nt11.87□□□□□ -0.51
PAN3P36102 PUN1YLR414C 792 nt11.82□□□□□ -0.52
PAN3P36102 BUD23YCR047C 828 nt11.8□□□□□ -0.52
PAN3P36102 RRN5YLR141W 1092 nt11.77□□□□□ -0.53
PAN3P36102 PTC2YER089C 1395 nt11.72□□□□□ -0.53
PAN3P36102 GAR1YHR089C 618 nt11.7□□□□□ -0.54
PAN3P36102 SSA4YER103W 1929 nt11.66□□□□□ -0.54
PAN3P36102 NAB2YGL122C 1578 nt11.66□□□□□ -0.54
PAN3P36102 YJR018WYJR018W 363 nt11.64□□□□□ -0.55
PAN3P36102 ATS1YAL020C 1002 nt11.59□□□□□ -0.55
PAN3P36102 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.54□□□□□ -0.56
PAN3P36102 FIS1YIL065C 468 nt11.47□□□□□ -0.57
PAN3P36102 DAL1YIR027C 1383 nt11.41□□□□□ -0.58
PAN3P36102 MEP2YNL142W 1500 nt11.39□□□□□ -0.59
PAN3P36102 YJR120WYJR120W 351 nt11.38□□□□□ -0.59
PAN3P36102 RSB1YOR049C 1065 nt11.38□□□□□ -0.59
PAN3P36102 TIR1YER011W 765 nt11.35□□□□□ -0.59
PAN3P36102 FPR4YLR449W 1179 nt11.31□□□□□ -0.6
PAN3P36102 SSA1YAL005C 1929 nt11.31□□□□□ -0.6
PAN3P36102 INM2YDR287W 879 nt11.3□□□□□ -0.6
PAN3P36102 PHO4YFR034C 939 nt11.3□□□□□ -0.6
PAN3P36102 RPP2BYDR382W 333 nt11.29□□□□□ -0.6
PAN3P36102 BDF1YLR399C 2061 nt11.29□□□□□ -0.6
PAN3P36102 YPS1YLR120C 1710 nt11.26□□□□□ -0.61
PAN3P36102 DCW1YKL046C 1350 nt11.17□□□□□ -0.62
PAN3P36102 TAT1YBR069C 1860 nt11.14□□□□□ -0.63
PAN3P36102 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.13□□□□□ -0.63
PAN3P36102 YDR095CYDR095C 411 nt11.12□□□□□ -0.63
PAN3P36102 YBL100CYBL100C 315 nt11.11□□□□□ -0.63
PAN3P36102 EMI2YDR516C 1503 nt11.03□□□□□ -0.64
PAN3P36102 SRB2YHR041C 633 nt11.02□□□□□ -0.65
PAN3P36102 YMR090WYMR090W 684 nt11.01□□□□□ -0.65
PAN3P36102 BDH2YAL061W 1254 nt11□□□□□ -0.65
PAN3P36102 YBR220CYBR220C 1683 nt10.99□□□□□ -0.65
PAN3P36102 FUN26YAL022C 1554 nt10.96□□□□□ -0.65
PAN3P36102 YDL221WYDL221W 552 nt10.93□□□□□ -0.66
PAN3P36102 PTP1YDL230W 1008 nt10.91□□□□□ -0.66
PAN3P36102 RPP2AYOL039W 321 nt10.9□□□□□ -0.66
PAN3P36102 SDH1YKL148C 1923 nt10.89□□□□□ -0.67
PAN3P36102 CAC2YML102W 1407 nt10.88□□□□□ -0.67
PAN3P36102 ALF1YNL148C 765 nt10.88□□□□□ -0.67
PAN3P36102 TRM9YML014W 840 nt10.85□□□□□ -0.67
PAN3P36102 PST2YDR032C 597 nt10.82□□□□□ -0.68
PAN3P36102 CCT6YDR188W 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
PAN3P36102 LSM3YLR438C-A 270 nt10.79□□□□□ -0.68
PAN3P36102 WWM1YFL010C 636 nt10.76□□□□□ -0.69
PAN3P36102 SIS1YNL007C 1059 nt10.76□□□□□ -0.69
PAN3P36102 SCC4YER147C 1875 nt10.74□□□□□ -0.69
PAN3P36102 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.73□□□□□ -0.69
PAN3P36102 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.73□□□□□ -0.69
PAN3P36102 IRC15YPL017C 1500 nt10.73□□□□□ -0.69
PAN3P36102 SEC11YIR022W 504 nt10.69□□□□□ -0.7
PAN3P36102 PCH2YBR186W 1695 nt10.69□□□□□ -0.7
PAN3P36102 GIS3YLR094C 1509 nt10.66□□□□□ -0.7
PAN3P36102 PAC11YDR488C 1602 nt10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms